More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2417 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1149  EAL domain-containing protein  81.91 
 
 		 411 aa  667    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2417  diguanylate phosphodiesterase  100 
 
 		 411 aa  840    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000004717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2981  diguanylate phosphodiesterase  54.37 
 
 		 412 aa  473  1e-132  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0150403  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2780  diguanylate phosphodiesterase  49.01 
 
 		 411 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.948032  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2615  diguanylate phosphodiesterase  50.98 
 
 		 411 aa  403  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1612  diguanylate phosphodiesterase  49.26 
 
 		 410 aa  401  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0416985  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1598  diguanylate phosphodiesterase  50.74 
 
 		 411 aa  393  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1729  diguanylate phosphodiesterase  48.76 
 
 		 419 aa  389  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1073  diguanylate phosphodiesterase  47.26 
 
 		 428 aa  372  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3300  EAL  44.96 
 
 		 417 aa  333  4e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2937  diguanylate phosphodiesterase  43.28 
 
 		 411 aa  325  9e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.64133  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1852  diguanylate phosphodiesterase  40.63 
 
 		 412 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.12834  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1332  diguanylate phosphodiesterase  37.9 
 
 		 424 aa  264  2e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2912  diguanylate phosphodiesterase  37.41 
 
 		 447 aa  246  6e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1776  diguanylate phosphodiesterase  38.74 
 
 		 448 aa  241  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.265098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1938  diguanylate phosphodiesterase  36.05 
 
 		 422 aa  239  5e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.509602  normal  0.818289 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1965  diguanylate phosphodiesterase  33.58 
 
 		 413 aa  238  1e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.616321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1571  diguanylate phosphodiesterase  38.3 
 
 		 445 aa  233  5e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.256124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0322  putative signal transduction protein  37.5 
 
 		 403 aa  229  7e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0122  diguanylate phosphodiesterase  32.02 
 
 		 400 aa  227  3e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000715595  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1316  diguanylate phosphodiesterase  35.52 
 
 		 419 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3464  EAL domain-containing protein  32.01 
 
 		 406 aa  222  9.999999999999999e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126352  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1693  EAL domain protein  34.7 
 
 		 410 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1720  diguanylate phosphodiesterase  33.66 
 
 		 412 aa  219  5e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3129  diguanylate phosphodiesterase  30.45 
 
 		 415 aa  218  1e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0991  diguanylate phosphodiesterase  33.57 
 
 		 423 aa  218  1e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0906  diguanylate phosphodiesterase  33.57 
 
 		 423 aa  218  2e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3977  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0920  diguanylate phosphodiesterase  35.7 
 
 		 416 aa  217  2.9999999999999998e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.135015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0828  diguanylate phosphodiesterase  33.5 
 
 		 413 aa  216  5e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.81779  normal  0.35188 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03533  EAL domain protein  30.58 
 
 		 408 aa  216  7e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111496  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2451  diguanylate phosphodiesterase  33.74 
 
 		 423 aa  215  9e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.694346  normal  0.603659 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3130  diguanylate phosphodiesterase  33.07 
 
 		 413 aa  212  1e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3594  diguanylate phosphodiesterase  32.64 
 
 		 402 aa  207  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00249356  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0860  diguanylate phosphodiesterase  31.93 
 
 		 397 aa  206  9e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5115  diguanylate phosphodiesterase  33.09 
 
 		 429 aa  204  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959026 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0413  diguanylate phosphodiesterase  33.59 
 
 		 397 aa  204  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029399  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1998  diguanylate phosphodiesterase  33.42 
 
 		 404 aa  204  2e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1462  diguanylate phosphodiesterase  33.42 
 
 		 405 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003840  predicted signal transduction protein  33.76 
 
 		 404 aa  200  3e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000123266  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0990  diguanylate phosphodiesterase  34.37 
 
 		 431 aa  200  5e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0347  diguanylate phosphodiesterase  32.26 
 
 		 400 aa  199  6e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.145586  normal  0.218991 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0905  diguanylate phosphodiesterase  34.37 
 
 		 431 aa  199  9e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002124  predicted signal transduction protein  30.39 
 
 		 407 aa  198  1.0000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1442  hypothetical protein  31.42 
 
 		 404 aa  199  1.0000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000750338  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1779  diguanylate phosphodiesterase  32.2 
 
 		 450 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0127  hypothetical protein  30.19 
 
 		 402 aa  196  7e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5114  diguanylate phosphodiesterase  32.78 
 
 		 464 aa  196  8.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488167 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1568  diguanylate phosphodiesterase  30.44 
 
 		 460 aa  195  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2915  diguanylate phosphodiesterase  29.88 
 
 		 458 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.555808 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1652  diguanylate phosphodiesterase  32.91 
 
 		 406 aa  194  2e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00298  signal transduction protein  30.81 
 
 		 407 aa  194  3e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3736  diguanylate phosphodiesterase  32.26 
 
 		 406 aa  190  4e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000203381 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2312  diguanylate phosphodiesterase  35 
 
 		 423 aa  189  5.999999999999999e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0339  signal transduction protein  30.2 
 
 		 409 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0012225  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1937  putative signaling protein  29.85 
 
 		 400 aa  189  7e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1315  diguanylate phosphodiesterase  33.66 
 
 		 449 aa  189  9e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3947  diguanylate phosphodiesterase  29.17 
 
 		 413 aa  188  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.103414  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3234  diguanylate phosphodiesterase  30.48 
 
 		 408 aa  187  3e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.114779 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0010  diguanylate phosphodiesterase  30.82 
 
 		 487 aa  187  4e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0508854 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2383  hypothetical protein  29.98 
 
 		 408 aa  186  9e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1719  diguanylate phosphodiesterase  33.09 
 
 		 448 aa  184  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03534  diguanylate phosphodiesterase  25.74 
 
 		 411 aa  177  4e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0852439  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2343  diguanylate phosphodiesterase  28.29 
 
 		 431 aa  176  5e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00856181  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2930  putative signaling protein  28.64 
 
 		 406 aa  175  9.999999999999999e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1990  diguanylate phosphodiesterase  29.15 
 
 		 414 aa  170  5e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.973618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2098  diguanylate phosphodiesterase  29.31 
 
 		 405 aa  169  6e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2840  diguanylate phosphodiesterase  30.4 
 
 		 403 aa  164  3e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4244  diguanylate phosphodiesterase  30.34 
 
 		 428 aa  162  9e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2174  diguanylate phosphodiesterase  28.16 
 
 		 408 aa  158  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.120475  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1888  diguanylate phosphodiesterase  26.29 
 
 		 400 aa  157  3e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.61283  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4213  EAL  33.87 
 
 		 402 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1814  diguanylate phosphodiesterase  30.35 
 
 		 405 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.877922  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2159  signal transduction protein  27.97 
 
 		 480 aa  145  9e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.140137  normal  0.149553 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1352  hypothetical protein  26.09 
 
 		 411 aa  145  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3785  diguanylate phosphodiesterase  29.88 
 
 		 444 aa  137  4e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.942548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1476  putative signal transduction protein  24.46 
 
 		 403 aa  134  3e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000542008  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0056  signal transduction protein  25.69 
 
 		 444 aa  125  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.680301  normal  0.542378 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2882  putative signal transduction protein  25.25 
 
 		 397 aa  123  7e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.567941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3084  putative signal transduction protein  25.43 
 
 		 419 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1268  diguanylate phosphodiesterase  25.45 
 
 		 407 aa  121  3e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15473  normal  0.0747469 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2907  signal transduction protein  25.85 
 
 		 439 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0386149  normal  0.411691 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0842  signal transduction protein  34.13 
 
 		 389 aa  116  8.999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0117523 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4155  putative signal transduction protein  27.15 
 
 		 438 aa  114  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1384  putative signal transduction protein  26.68 
 
 		 463 aa  109  7.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3725  putative signal transduction protein  26.03 
 
 		 378 aa  100  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1201  putative signal transduction protein  22.5 
 
 		 406 aa  100  7e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1497  putative signal transduction protein  22.85 
 
 		 414 aa  94.7  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3062  signal transduction protein  24.77 
 
 		 403 aa  94.4  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0202013  normal  0.558987 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0592  hypothetical protein  25.89 
 
 		 379 aa  91.7  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2723  putative signal transduction protein  33.13 
 
 		 399 aa  90.9  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000022717 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0573  hypothetical protein  25.89 
 
 		 379 aa  90.1  6e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0558  putative signal transduction protein  27.87 
 
 		 410 aa  72.4  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31360  predicted signal transduction protein containing EAL and modified HD-GYP domains  25.41 
 
 		 418 aa  71.2  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.041924 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2411  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  26.44 
 
 		 632 aa  67.8  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00893826 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3112  putative signal transduction protein  26.23 
 
 		 413 aa  66.2  0.0000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3839  putative signal transduction protein  26.23 
 
 		 403 aa  66.2  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51660  EAL/GGDEF domain-containing protein  31.8 
 
 		 592 aa  63.5  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2227  diguanylate phosphodiesterase  28.43 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.118815  hitchhiker  0.00585618 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1403  diguanylate phosphodiesterase  28.81 
 
 		 412 aa  60.8  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.561856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2848  diguanylate phosphodiesterase  31.11 
 
 		 428 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.423911  normal  0.493577 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>