More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2407 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  100 
 
 
231 aa  463  1e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1162  ABC transporter, ATP-binding protein  89.18 
 
 
231 aa  426  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0787551  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3264  ABC transporter related protein  82.38 
 
 
229 aa  379  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0987  ABC transporter related  80.62 
 
 
229 aa  374  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.891984 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1457  ABC transporter related  79.74 
 
 
228 aa  375  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1984  ABC transporter related  77.83 
 
 
231 aa  357  1e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1792  ABC transporter-related protein  72.65 
 
 
234 aa  339  2e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.153543  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5857  ABC transporter related  70.67 
 
 
230 aa  330  1e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.105187  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0630  ABC transporter related  70.98 
 
 
268 aa  322  3e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0423789 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3711  ABC transporter related  68.58 
 
 
235 aa  315  4e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.587902 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2214  ABC transporter, ATPase subunit  69.23 
 
 
230 aa  314  7e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0230  ABC transporter related  68.56 
 
 
232 aa  311  5e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  2.98e-07 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0222  ABC transporter related  68.12 
 
 
232 aa  308  3e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3402  ABC efflux pump, ATPase subunit  69 
 
 
232 aa  308  4e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0029159  normal  0.408947 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0303  ABC transporter related  69 
 
 
232 aa  305  3e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0537962  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0284  ABC transporter related  68.56 
 
 
232 aa  305  5e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257552  hitchhiker  3.95766e-06 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2803  ABC transporter related  68.56 
 
 
232 aa  303  1e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0893633  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0206  ABC transporter related  67.69 
 
 
232 aa  298  4e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.922054  unclonable  7.713e-12 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2521  ABC transporter related  65 
 
 
235 aa  296  2e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3166  ABC transporter related protein  59.65 
 
 
240 aa  276  2e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.240946  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0253  ABC transporter related  60.18 
 
 
229 aa  274  1e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.588254 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0819  ABC transporter related  57.85 
 
 
231 aa  272  3e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000974524 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2021  ABC transporter related  56.82 
 
 
225 aa  268  4e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1620  ABC transporter, ATPase subunit  61.09 
 
 
241 aa  268  6e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1514  ABC transporter related  58.59 
 
 
232 aa  266  2e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03342  ABC transporter ATP-binding protein  58.82 
 
 
229 aa  263  1e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1757  ABC transporter ATP-binding protein  55.07 
 
 
235 aa  262  3e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.245254  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2260  ABC transporter related  54.11 
 
 
232 aa  254  6e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0549292  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2582  ABC transporter related  54.39 
 
 
234 aa  241  6e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  50.67 
 
 
255 aa  235  4e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0492  ABC transporter related  48.18 
 
 
238 aa  221  7e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.925941  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  47.03 
 
 
240 aa  220  1e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  47.93 
 
 
228 aa  220  1e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  48.18 
 
 
221 aa  220  1e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  48.67 
 
 
242 aa  219  2e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  48.2 
 
 
266 aa  220  2e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  48.43 
 
 
258 aa  219  3e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.37949e-10 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  48.85 
 
 
239 aa  218  5e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05403  ABC transporter ATPase subunit  49.77 
 
 
237 aa  218  7e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  48.44 
 
 
266 aa  218  7e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  49.77 
 
 
239 aa  217  1e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  46.08 
 
 
229 aa  216  2e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3705  ABC transporter related  47.27 
 
 
293 aa  216  2e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  45.85 
 
 
262 aa  216  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3057  ABC transporter related protein  49.56 
 
 
255 aa  215  4e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0892  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  47.73 
 
 
251 aa  214  7e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  43.69 
 
 
230 aa  214  7e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  47.47 
 
 
237 aa  214  1e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2216  ABC transporter-related protein  42.86 
 
 
233 aa  214  1e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.22614 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  45.09 
 
 
240 aa  214  1e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  3.60668e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  48.4 
 
 
259 aa  214  1e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  46.36 
 
 
228 aa  213  2e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  51.36 
 
 
277 aa  213  2e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  47.49 
 
 
225 aa  213  2e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  47.49 
 
 
225 aa  213  2e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001466  ABC transporter ATP-binding protein  48.86 
 
 
238 aa  213  2e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  50.23 
 
 
222 aa  212  3e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  51.57 
 
 
233 aa  211  5e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0478  ABC transporter related protein  46.36 
 
 
220 aa  211  5e-54  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  48.87 
 
 
288 aa  211  5e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  45.21 
 
 
246 aa  211  6e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  46.36 
 
 
248 aa  211  7e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  46.46 
 
 
239 aa  211  8e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  47.22 
 
 
264 aa  211  1e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4127  ABC transporter related  42.79 
 
 
241 aa  210  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.330151  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  46.64 
 
 
230 aa  210  1e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  4.35089e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  46.58 
 
 
242 aa  210  1e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  45.74 
 
 
232 aa  211  1e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0205  ABC transporter related  46.49 
 
 
233 aa  209  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3214  ABC transporter related  47.95 
 
 
233 aa  209  2e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.418962  normal  0.11192 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2937  ABC transporter related  47.35 
 
 
668 aa  209  3e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.697708  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  49.54 
 
 
247 aa  209  3e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3444  ABC transporter related  47.35 
 
 
668 aa  209  3e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.625414  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1963  ABC transporter related  51.34 
 
 
248 aa  208  5e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  47.03 
 
 
231 aa  208  5e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  48.17 
 
 
280 aa  208  5e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0894  ABC transporter related  46.58 
 
 
224 aa  208  6e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.552759  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1979  ABC transporter related  42.79 
 
 
240 aa  208  7e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0692  ABC transporter related  46.05 
 
 
252 aa  208  7e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1628  ABC transporter related protein  48.25 
 
 
250 aa  207  8e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  45.09 
 
 
226 aa  207  8e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  46.79 
 
 
253 aa  207  9e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0495  ABC transporter related  47.73 
 
 
237 aa  207  1e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08480  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  47.96 
 
 
274 aa  207  1e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.363174  normal  0.516344 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  46.26 
 
 
228 aa  207  1e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  47.03 
 
 
258 aa  206  2e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2724  ABC transporter related  45.21 
 
 
252 aa  206  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2781  ABC transporter related  45.21 
 
 
252 aa  206  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  45.62 
 
 
244 aa  206  2e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3285  ABC transporter related  49.09 
 
 
249 aa  206  2e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3170  ABC transporter related protein  50.75 
 
 
217 aa  206  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0178954  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20470  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  47.11 
 
 
245 aa  207  2e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0202995  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2178  ABC transporter-related protein  47.93 
 
 
248 aa  207  2e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2776  ABC transporter related  47.75 
 
 
240 aa  206  2e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000244167  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  47.49 
 
 
228 aa  206  2e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3230  ABC transporter related protein  47.09 
 
 
312 aa  206  3e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1961  normal  0.0782588 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  48.46 
 
 
238 aa  206  3e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  45.62 
 
 
240 aa  206  3e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2628  ABC transporter related  43.89 
 
 
241 aa  206  3e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  48.39 
 
 
264 aa  206  3e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>