More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2405 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1164  ABC transporter, permease protein  88.11 
 
 		 387 aa  660    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.440199  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2405  hypothetical protein  100 
 
 		 387 aa  764    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0262818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1459  hypothetical protein  80.15 
 
 		 388 aa  604  9.999999999999999e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.789839  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0988  protein of unknown function DUF214  73.97 
 
 		 388 aa  567  1e-160  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1986  hypothetical protein  75.52 
 
 		 388 aa  565  1e-160  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3263  protein of unknown function DUF214  73.97 
 
 		 388 aa  560  1e-158  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2216  hypothetical protein  66.15 
 
 		 388 aa  518  1e-146  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5859  hypothetical protein  61.24 
 
 		 388 aa  484  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.535317  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3709  hypothetical protein  64.08 
 
 		 388 aa  481  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.392463  normal  0.872596 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3400  ABC efflux pump, inner membrane subunit  63.05 
 
 		 388 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.089365  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1794  hypothetical protein  60.21 
 
 		 388 aa  466  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0173513  normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0228  hypothetical protein  62.27 
 
 		 388 aa  462  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000368299 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0204  hypothetical protein  62.02 
 
 		 388 aa  461  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.20132  unclonable  0.000000000008111 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2805  hypothetical protein  63.05 
 
 		 388 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.275109  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0282  hypothetical protein  62.79 
 
 		 388 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.548142  hitchhiker  0.0000619818 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0301  hypothetical protein  63.05 
 
 		 388 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157711  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0220  hypothetical protein  62.02 
 
 		 388 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0255  hypothetical protein  60.1 
 
 		 389 aa  446  1.0000000000000001e-124  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0628  protein of unknown function DUF214  63.31 
 
 		 391 aa  443  1e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0398137 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1618  ABC efflux pump, inner membrane subunit  39.2 
 
 		 394 aa  284  2.0000000000000002e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.656867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1512  hypothetical protein  37.4 
 
 		 396 aa  228  1e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.574186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1759  hypothetical protein  35.7 
 
 		 396 aa  217  2.9999999999999998e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0817  hypothetical protein  33.59 
 
 		 393 aa  208  2e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000337382 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0251  protein of unknown function DUF214  34.26 
 
 		 440 aa  198  1.0000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.170274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03340  ABC transporter permease  35.69 
 
 		 431 aa  197  3e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2023  hypothetical protein  30.03 
 
 		 395 aa  160  5e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2580  protein of unknown function DUF214  30.28 
 
 		 400 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2258  protein of unknown function DUF214  31.88 
 
 		 402 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3164  protein of unknown function DUF214  26.44 
 
 		 454 aa  116  6e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.512918  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0025  hypothetical protein  28.88 
 
 		 400 aa  84  0.000000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  28.85 
 
 		 391 aa  78.2  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0999  protein of unknown function DUF214  28.45 
 
 		 417 aa  77  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000110671 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1668  hypothetical protein  28.22 
 
 		 421 aa  77  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  26.78 
 
 		 397 aa  76.6  0.0000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1541  hypothetical protein  24.02 
 
 		 415 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0147258 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  26.34 
 
 		 371 aa  75.5  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1059  hypothetical protein  29.8 
 
 		 401 aa  75.5  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0067  hypothetical protein  24.34 
 
 		 488 aa  75.1  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1534  protein of unknown function DUF214  27.8 
 
 		 421 aa  74.3  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  25.83 
 
 		 397 aa  74.7  0.000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0937  hypothetical protein  29.96 
 
 		 400 aa  74.3  0.000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.391687  hitchhiker  0.00182616 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1081  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  29.1 
 
 		 640 aa  74.3  0.000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0953  hypothetical protein  29.13 
 
 		 402 aa  73.9  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  25.77 
 
 		 414 aa  72.8  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1636  protein of unknown function DUF214  27.08 
 
 		 421 aa  72.8  0.000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2085  putative ABC transporter, permease protein  32.5 
 
 		 475 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.01072  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1391  efflux ABC transporter, permease protein  32.5 
 
 		 475 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1112  efflux ABC transporter, permease protein  32.5 
 
 		 475 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2344  ABC transporter, permease protein, putative  33 
 
 		 477 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  26.29 
 
 		 408 aa  72.4  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2376  efflux ABC transporter, permease protein  32.5 
 
 		 475 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0371  hypothetical protein  23.62 
 
 		 414 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  26.94 
 
 		 857 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1563  protein of unknown function DUF214  20.66 
 
 		 385 aa  71.2  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1472  putative permease  32 
 
 		 716 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  24.76 
 
 		 413 aa  70.5  0.00000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1336  ABC transporter efflux protein  28.31 
 
 		 421 aa  70.5  0.00000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3143  efflux ABC transporter, permease protein  32 
 
 		 475 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.183035  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  24.69 
 
 		 386 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0104  protein of unknown function DUF214  26.26 
 
 		 454 aa  70.1  0.00000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1915  hypothetical protein  29.65 
 
 		 414 aa  70.1  0.00000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1087  hypothetical protein  23.23 
 
 		 414 aa  70.1  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3257  efflux ABC transporter, permease protein  31.5 
 
 		 475 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.289143  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  35.53 
 
 		 387 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  25.86 
 
 		 842 aa  69.3  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0065  hypothetical protein  25.09 
 
 		 381 aa  69.3  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  27.97 
 
 		 648 aa  68.6  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1025  protein of unknown function DUF214  26.59 
 
 		 397 aa  68.6  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.347391 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2989  hypothetical protein  29.12 
 
 		 397 aa  67.8  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0456  protein of unknown function DUF214  25.82 
 
 		 412 aa  67.8  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  25.68 
 
 		 858 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2932  hypothetical protein  25.45 
 
 		 390 aa  67.4  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000965565  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0904  hypothetical protein  26.52 
 
 		 411 aa  67.4  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0627404  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0494  hypothetical protein  25.27 
 
 		 399 aa  67  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355429  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02560  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  26.33 
 
 		 406 aa  66.6  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000006972  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1201  putative permease  21.17 
 
 		 431 aa  67  0.0000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0390517  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1359  permease, putative  25.75 
 
 		 415 aa  66.6  0.0000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00178118  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  26.69 
 
 		 401 aa  66.6  0.0000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00555  ABC transporter efflux protein  27.24 
 
 		 417 aa  66.6  0.0000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.29728  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1639  hypothetical protein  22.64 
 
 		 415 aa  66.2  0.0000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  27.15 
 
 		 400 aa  66.2  0.0000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  25.73 
 
 		 406 aa  65.5  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0255  hypothetical protein  25.52 
 
 		 397 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0697  protein of unknown function DUF214  25.79 
 
 		 401 aa  65.9  0.000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3607  protein of unknown function DUF214  25.93 
 
 		 403 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123498  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1658  hypothetical protein  28.57 
 
 		 397 aa  66.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  26.03 
 
 		 642 aa  65.5  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  26.42 
 
 		 402 aa  65.5  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  29.65 
 
 		 408 aa  66.2  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0269  protein of unknown function DUF214  24.37 
 
 		 430 aa  65.1  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.36794 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0652  hypothetical protein  30.41 
 
 		 393 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0895  hypothetical protein  43.86 
 
 		 387 aa  65.1  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0198854  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1519  protein of unknown function DUF214  23.79 
 
 		 379 aa  64.7  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0693  ABC transporter, permease  24.14 
 
 		 391 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0918  ABC transporter, ATP-binding protein  26.75 
 
 		 643 aa  64.3  0.000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4486  putative ABC transporter, permease protein  24.21 
 
 		 391 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000433037 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2787  putative ABC transport system permease protein  29.29 
 
 		 394 aa  64.3  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000544033  hitchhiker  0.000418311 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  28.52 
 
 		 443 aa  63.9  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0797  ABC transporter permease  24.14 
 
 		 391 aa  63.9  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7003  protein of unknown function DUF214  26.36 
 
 		 423 aa  64.3  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00437024  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>