More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2398 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_2398  queuine tRNA-ribosyltransferase  100 
 
 
368 aa  771  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.65402e-10  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3335  queuine tRNA-ribosyltransferase  81.74 
 
 
368 aa  644  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00131766  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1175  queuine tRNA-ribosyltransferase  88.83 
 
 
368 aa  700  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0539668  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3258  queuine tRNA-ribosyltransferase  88.83 
 
 
368 aa  694  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  6.43926e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0911  queuine tRNA-ribosyltransferase  81.47 
 
 
368 aa  642  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8642e-32 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2484  queuine tRNA-ribosyltransferase  74.66 
 
 
373 aa  605  1e-172  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.70638e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1228  queuine tRNA-ribosyltransferase  76.86 
 
 
369 aa  603  1e-171  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.14064e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2017  queuine tRNA-ribosyltransferase  74.59 
 
 
380 aa  599  1e-170  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000528319  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1457  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.83 
 
 
375 aa  456  1e-127  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000844701  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1666  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.42 
 
 
370 aa  451  1e-126  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.098612  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.71 
 
 
369 aa  452  1e-126  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0231453  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12290  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.1 
 
 
373 aa  449  1e-125  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  3.56741e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2518  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.01 
 
 
380 aa  447  1e-124  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00624233  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3134  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.19 
 
 
379 aa  442  1e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.212476  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0930  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.19 
 
 
380 aa  443  1e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2109  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.56 
 
 
379 aa  441  1e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0958  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.01 
 
 
374 aa  442  1e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0452051  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1716  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.68 
 
 
371 aa  441  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.2965  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4647  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.37 
 
 
379 aa  438  1e-122  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  2.56565e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4497  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.37 
 
 
379 aa  438  1e-122  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.28432e-05 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1694  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.89 
 
 
373 aa  437  1e-122  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4551  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.37 
 
 
379 aa  438  1e-122  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.70513e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4312  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.37 
 
 
379 aa  438  1e-122  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  4.8864e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4502  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.37 
 
 
379 aa  438  1e-122  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  5.75969e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4150  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.37 
 
 
379 aa  438  1e-122  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.48017e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4161  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.37 
 
 
379 aa  438  1e-122  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  3.10592e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4536  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.1 
 
 
379 aa  436  1e-121  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  5.78318e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4264  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.64 
 
 
379 aa  437  1e-121  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  8.51523e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0699  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.1 
 
 
379 aa  436  1e-121  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  2.27158e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3622  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.11 
 
 
372 aa  436  1e-121  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00110996  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1729  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.62 
 
 
379 aa  432  1e-120  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37523  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1696  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.62 
 
 
379 aa  432  1e-120  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1194  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.7 
 
 
367 aa  428  1e-119  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0396  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.39 
 
 
380 aa  429  1e-119  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000954967  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0159  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.95 
 
 
382 aa  426  1e-118  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.95405  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0852  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.4 
 
 
370 aa  427  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1785  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.01 
 
 
380 aa  425  1e-118  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0229472  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.91 
 
 
372 aa  421  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0382  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.62 
 
 
357 aa  422  1e-117  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1203  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.89 
 
 
379 aa  422  1e-117  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.261953  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1782  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.46 
 
 
372 aa  422  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114635 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2619  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.85 
 
 
373 aa  424  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1259  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.48 
 
 
379 aa  420  1e-116  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0445  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.45 
 
 
375 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0444  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.45 
 
 
375 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0451  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.45 
 
 
375 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0945287  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0530  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.55 
 
 
373 aa  412  1e-114  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00176978  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0486  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.72 
 
 
375 aa  414  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0464  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.45 
 
 
375 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.992026  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0476  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.72 
 
 
375 aa  414  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0505  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.45 
 
 
375 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3203  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.72 
 
 
375 aa  414  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.372376  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00358  hypothetical protein  52.72 
 
 
375 aa  414  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.575633  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3097  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.6 
 
 
387 aa  413  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141745  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0436  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.72 
 
 
375 aa  414  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3227  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.72 
 
 
375 aa  414  1e-114  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  1.87089e-06 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1894  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.65 
 
 
355 aa  414  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.38291e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0438  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.72 
 
 
375 aa  414  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2906  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.02 
 
 
387 aa  413  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.905549  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1019  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.51 
 
 
381 aa  414  1e-114  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00354  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.72 
 
 
375 aa  414  1e-114  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.520405  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0931  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.75 
 
 
394 aa  413  1e-114  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0325  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.72 
 
 
375 aa  414  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1359  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.8 
 
 
372 aa  409  1e-113  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000569759  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0919  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.52 
 
 
381 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3291  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.23 
 
 
381 aa  411  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004367  tRNA-guanine transglycosylase  51.23 
 
 
382 aa  408  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1912  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.94 
 
 
380 aa  407  1e-112  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.288264  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1428  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.17 
 
 
369 aa  407  1e-112  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00175971  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.24 
 
 
375 aa  405  1e-112  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0875  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.23 
 
 
375 aa  406  1e-112  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.68635  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0270  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.79 
 
 
379 aa  406  1e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.147453  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3123  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.07 
 
 
374 aa  406  1e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00561158  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3264  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.07 
 
 
374 aa  406  1e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000400897  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3384  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.07 
 
 
374 aa  406  1e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000344335  normal  0.488605 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1061  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.52 
 
 
374 aa  406  1e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00184616 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2201  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.94 
 
 
380 aa  407  1e-112  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0605  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.91 
 
 
395 aa  405  1e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2075  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.08 
 
 
367 aa  407  1e-112  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.698983  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3755  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.52 
 
 
387 aa  408  1e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.145582 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0514  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.52 
 
 
370 aa  405  1e-112  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0907  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.63 
 
 
372 aa  405  1e-112  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0218  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.25 
 
 
376 aa  402  1e-111  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.989201  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1315  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.7 
 
 
376 aa  404  1e-111  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01046  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.41 
 
 
378 aa  404  1e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2011  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.53 
 
 
380 aa  404  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.638578  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0579  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.66 
 
 
370 aa  401  1e-110  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.350695  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1435  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.09 
 
 
374 aa  400  1e-110  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  6.52098e-07  hitchhiker  0.000858372 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1791  queuine tRNA-ribosyltransferase  50 
 
 
370 aa  400  1e-110  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  3.78979e-06  hitchhiker  0.00274251 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0505  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.72 
 
 
394 aa  400  1e-110  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1382  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.09 
 
 
374 aa  400  1e-110  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000246245  hitchhiker  1.18913e-05 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1447  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.09 
 
 
374 aa  400  1e-110  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  3.28041e-06  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0632  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.92 
 
 
392 aa  396  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1333  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.27 
 
 
370 aa  396  1e-109  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.299331  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2068  Queuine tRNA-ribosyltransferase  52.91 
 
 
371 aa  396  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2352  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.58 
 
 
391 aa  395  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2647  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.8 
 
 
381 aa  397  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  9.56702e-08  hitchhiker  0.00180241 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2702  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.68 
 
 
374 aa  397  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  6.54614e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2808  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.38 
 
 
376 aa  395  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.634866  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.69 
 
 
385 aa  395  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.38532  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>