More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2368 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2368  CBS:transporter-associated region  100 
 
 		 284 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1784  CBS domain-containing protein  75 
 
 		 284 aa  413  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000339521  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2282  CBS domain-containing protein  83.76 
 
 		 250 aa  391  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3260  CBS domain containing protein  61.62 
 
 		 287 aa  366  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1000  CBS domain containing protein  61.27 
 
 		 287 aa  364  1e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0370099  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2036  CBS domain-containing protein  61.48 
 
 		 296 aa  363  2e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2733  CBS domain containing protein  61.43 
 
 		 284 aa  344  8.999999999999999e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.377385  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1235  putative Mg2+ and co2+ transporter CorC  56.79 
 
 		 285 aa  299  3e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  49.25 
 
 		 420 aa  256  2e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0722  CBS domain-containing protein  47.83 
 
 		 276 aa  254  8e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4395  hypothetical protein  47.03 
 
 		 439 aa  228  9e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0154532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1468  CBS domain containing protein  45.38 
 
 		 447 aa  221  9.999999999999999e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0356908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2212  CBS domain-containing protein  40.71 
 
 		 417 aa  216  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000293587  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0553  CBS domain containing protein  47.95 
 
 		 273 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000116003 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1807  CBS  43.54 
 
 		 298 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.223069  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0060  CBS domain pair protein  45.02 
 
 		 259 aa  213  3.9999999999999995e-54  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0738  CBS domain-containing protein  43.85 
 
 		 435 aa  211  7e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0846  CBS domain-containing protein  43.66 
 
 		 439 aa  209  3e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2111  CBS domain containing protein  48 
 
 		 421 aa  209  6e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.241811  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2297  Hemolysin and related protein containing CBS domains-like protein  45.25 
 
 		 434 aa  208  8e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1158  CBS domain-containing protein  44.12 
 
 		 452 aa  208  9e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.992942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3157  CBS domain containing protein  42.31 
 
 		 490 aa  206  3e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00650526  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3245  protein of unknown function DUF21  42.26 
 
 		 442 aa  204  9e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0319126  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3465  hypothetical protein  43.68 
 
 		 436 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0200076 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2708  CBS domain-containing protein  42.91 
 
 		 432 aa  204  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.642417 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3454  hypothetical protein  43.68 
 
 		 436 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0757862  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1507  hypothetical protein  41.38 
 
 		 430 aa  204  1e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3517  hypothetical protein  43.68 
 
 		 436 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.70435 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1143  hypothetical protein  42.58 
 
 		 432 aa  202  5e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000186322  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1326  protein of unknown function DUF21  43.7 
 
 		 425 aa  202  5e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00045717  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1660  CBS domain containing protein  44.72 
 
 		 461 aa  202  6e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1269  CBS domain containing protein  37.69 
 
 		 420 aa  201  9e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2925  hypothetical protein  37.22 
 
 		 465 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.221134  normal  0.412302 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1153  hypothetical protein  42.57 
 
 		 447 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000974304  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1867  CBS domain containing protein  41.22 
 
 		 285 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545793 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0853  CBS domain-containing protein  42.97 
 
 		 444 aa  198  7e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215802  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2611  protein of unknown function DUF21  42 
 
 		 445 aa  198  7.999999999999999e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0252  protein of unknown function DUF21  39.61 
 
 		 434 aa  198  9e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000514588  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3333  transporter-associated region  41.2 
 
 		 311 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.240989 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3451  CBS domain-containing protein  42.86 
 
 		 464 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.553184  normal  0.0782726 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0626  CorC family Mg2+ / Co2+ transporter  41.2 
 
 		 311 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.479043  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0408  CBS domain-containing protein  42.11 
 
 		 298 aa  196  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.658484  normal  0.141642 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1383  transport protein  36.63 
 
 		 434 aa  196  3e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3830  CBS domain-containing protein  42.15 
 
 		 432 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0791  CBS domain-containing protein  42.97 
 
 		 483 aa  196  5.000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.847387  normal  0.143113 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3442  CBS domain-containing protein  39.19 
 
 		 291 aa  195  7e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000638255 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2858  CBS domain-containing protein  38.83 
 
 		 291 aa  195  7e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1103  CBS domain containing protein  39.19 
 
 		 291 aa  195  7e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000107663 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3264  CBS domain-containing protein  39.19 
 
 		 291 aa  195  7e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3306  CBS domain-containing protein  39.19 
 
 		 291 aa  195  7e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2741  transporter-associated region  41.86 
 
 		 281 aa  195  8.000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.835583  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12392  transmembrane protein  40.29 
 
 		 435 aa  195  9e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1002  hypothetical protein  40.45 
 
 		 443 aa  195  9e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0655  CBS domain containing protein  38.71 
 
 		 273 aa  194  1e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1001  CBS domain-containing protein  38.83 
 
 		 291 aa  194  1e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.243259  normal  0.0641056 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1066  CBS domain-containing protein  38.83 
 
 		 291 aa  194  1e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.354605  normal  0.0599682 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2703  hypothetical protein  41.63 
 
 		 285 aa  193  2e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.313937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3011  hypothetical protein  38.38 
 
 		 429 aa  194  2e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3830  CBS domain-containing protein  42.04 
 
 		 464 aa  193  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1178  magnesium and cobalt efflux protein CorC  38.46 
 
 		 291 aa  193  3e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1251  CBS domain-containing protein  41.53 
 
 		 435 aa  192  4e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1005  CBS domain-containing protein  38.46 
 
 		 291 aa  192  4e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0718327 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0528  hypothetical protein  41.53 
 
 		 298 aa  192  6e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0687971  normal  0.0248188 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0601  CBS domain-containing protein  40.62 
 
 		 295 aa  191  9e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1456  magnesium and cobalt efflux protein CorC  40.23 
 
 		 284 aa  191  1e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00173357  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0404  CBS domain containing protein  41.2 
 
 		 309 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.275188 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0419  CBS domain containing protein  41.2 
 
 		 309 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.622 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1330  CBS domain-containing protein  43.44 
 
 		 275 aa  191  1e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.964649  normal  0.0685098 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3140  CBS domain-containing protein  38.1 
 
 		 293 aa  191  1e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.328358  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6025  putative Mg2+ and Co2+ transporter CorC  39.69 
 
 		 295 aa  190  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.097804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3699  CBS domain-containing protein  37 
 
 		 291 aa  190  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246978  hitchhiker  0.00355907 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3282  protein of unknown function DUF21  40.7 
 
 		 433 aa  190  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0587  magnesium and cobalt efflux protein CorC  39.54 
 
 		 295 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3474  CBS domain-containing protein  35.82 
 
 		 291 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.42  hitchhiker  0.00607831 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0450  CBS transporter-associated protein  39.56 
 
 		 295 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00559232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2926  CBS domain-containing protein  37.23 
 
 		 291 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00659921 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2615  transporter-associated region  39.45 
 
 		 295 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0650038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2750  transporter-associated region  39.45 
 
 		 295 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29691  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1578  CBS domain containing protein  44.89 
 
 		 537 aa  189  4e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110465  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1066  protein of unknown function DUF21  40.54 
 
 		 426 aa  189  4e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.905964  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3782  CBS domain-containing protein  41.46 
 
 		 279 aa  189  5e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.964712  normal  0.253 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2433  magnesium and cobalt efflux protein CorC  39.16 
 
 		 295 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0221  magnesium and cobalt efflux protein CorC  39.16 
 
 		 295 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2353  magnesium and cobalt efflux protein CorC  39.16 
 
 		 295 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0719  magnesium and cobalt efflux protein CorC  39.16 
 
 		 295 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.742148  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0704  magnesium and cobalt efflux protein CorC  39.16 
 
 		 295 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.459975  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2725  magnesium and cobalt efflux protein CorC  39.16 
 
 		 295 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7047  CBS domain containing protein  40.71 
 
 		 425 aa  188  7e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1243  hemolysin C  40.08 
 
 		 258 aa  188  7e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.419025  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0885  magnesium and cobalt efflux protein CorC  39.16 
 
 		 403 aa  188  7e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.216918  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1967  CBS domain containing protein  40.32 
 
 		 443 aa  188  8e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000080224 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2578  magnesium and cobalt efflux protein CorC  37 
 
 		 292 aa  188  8e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0721434 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0240  Mg2+/Co2+ transporter  39.44 
 
 		 291 aa  187  1e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2086  transporter-associated region  39.45 
 
 		 295 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0362455  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2725  CBS domain-containing protein  39.45 
 
 		 295 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.49452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0397  CBS domain-containing protein  36.73 
 
 		 291 aa  187  1e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467149 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2698  CBS domain-containing protein  39.45 
 
 		 295 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0164111  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1183  protein of unknown function DUF21  41.2 
 
 		 424 aa  187  1e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000010351  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0967  protein of unknown function DUF21  40 
 
 		 439 aa  187  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.854838 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1349  CBS domain containing protein  36.94 
 
 		 293 aa  187  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.038929  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>