91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2364 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2276  hypothetical protein  82.08 
 
 		 413 aa  714    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1789  hypothetical protein  72.64 
 
 		 413 aa  645    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000891935  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2364  hypothetical protein  100 
 
 		 413 aa  853    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3256  hypothetical protein  72.09 
 
 		 413 aa  636    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1004  hypothetical protein  71.36 
 
 		 413 aa  630  1e-179  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00505199  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2042  hypothetical protein  66.99 
 
 		 413 aa  581  1.0000000000000001e-165  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000173265  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2737  hypothetical protein  65.38 
 
 		 413 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.601359  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2349  hypothetical protein  53.49 
 
 		 415 aa  476  1e-133  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.218384  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2084  hypothetical protein  53.14 
 
 		 415 aa  464  1e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0833724  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0559  hypothetical protein  51.22 
 
 		 410 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.146499  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2985  hypothetical protein  52.77 
 
 		 415 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.767883  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3297  hypothetical protein  52.53 
 
 		 415 aa  449  1e-125  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1990  hypothetical protein  52.77 
 
 		 415 aa  448  1e-125  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3319  hypothetical protein  52.53 
 
 		 415 aa  449  1e-125  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.103018  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3292  hypothetical protein  53.01 
 
 		 415 aa  449  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3021  hypothetical protein  52.29 
 
 		 415 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3259  hypothetical protein  52.29 
 
 		 415 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2967  hypothetical protein  52.29 
 
 		 415 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.482567  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3283  hypothetical protein  52.53 
 
 		 415 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0709  hypothetical protein  52.55 
 
 		 410 aa  442  1e-123  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000587987 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0704  hypothetical protein  50.84 
 
 		 417 aa  432  1e-120  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1280  hypothetical protein  51.08 
 
 		 415 aa  426  1e-118  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4577  hypothetical protein  50.61 
 
 		 411 aa  420  1e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0647604  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0086  hypothetical protein  46.81 
 
 		 411 aa  416  9.999999999999999e-116  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1657  hypothetical protein  54.13 
 
 		 411 aa  412  1e-114  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.962442 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2761  hypothetical protein  51.95 
 
 		 404 aa  413  1e-114  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0062  hypothetical protein  47.62 
 
 		 418 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.519667  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1926  hypothetical protein  50.85 
 
 		 416 aa  397  1e-109  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.570079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1138  hypothetical protein  49.16 
 
 		 413 aa  395  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.258981 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2901  hypothetical protein  52.2 
 
 		 404 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2995  hypothetical protein  51.7 
 
 		 404 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1283  hypothetical protein  46 
 
 		 412 aa  392  1e-108  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000225003  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0065  hypothetical protein  46.19 
 
 		 418 aa  388  1e-107  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2814  hypothetical protein  51.71 
 
 		 404 aa  388  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3628  hypothetical protein  52.32 
 
 		 404 aa  388  1e-106  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.73345 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0847  hypothetical protein  44.23 
 
 		 410 aa  372  1e-102  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2175  hypothetical protein  45.37 
 
 		 407 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1282  hypothetical protein  43.45 
 
 		 406 aa  313  4.999999999999999e-84  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000228173  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1404  hypothetical protein  43.55 
 
 		 406 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.413261  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3076  hypothetical protein  53.28 
 
 		 277 aa  301  2e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1859  hypothetical protein  36.67 
 
 		 414 aa  285  8e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.958241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2369  hypothetical protein  39.34 
 
 		 420 aa  285  9e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0135  hypothetical protein  36.62 
 
 		 436 aa  283  3.0000000000000004e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0009  hypothetical protein  38.63 
 
 		 417 aa  281  1e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2649  hypothetical protein  37.76 
 
 		 418 aa  278  1e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.804113  normal  0.316005 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2554  hypothetical protein  37.98 
 
 		 419 aa  273  3e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.459608 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09523  hypothetical protein  33.09 
 
 		 411 aa  244  1.9999999999999999e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.640574  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2153  hypothetical protein  29.02 
 
 		 449 aa  169  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0572  hypothetical protein  25.28 
 
 		 442 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0718  hypothetical protein  26.13 
 
 		 458 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.201396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1414  hypothetical protein  26.17 
 
 		 447 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.792447  normal  0.210387 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_537  hypothetical protein  24.6 
 
 		 442 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.781044  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0597  hypothetical protein  24.15 
 
 		 442 aa  139  8.999999999999999e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0121  hypothetical protein  27.52 
 
 		 424 aa  139  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00158567  normal  0.0307809 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0652  putative phosphatase  27.09 
 
 		 433 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.49036  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4921  hypothetical protein  27.52 
 
 		 450 aa  133  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0657  hypothetical protein  27.6 
 
 		 436 aa  133  6e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2667  hypothetical protein  26.67 
 
 		 424 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0707942  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0099  hypothetical protein  26.61 
 
 		 424 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00564358  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2453  hypothetical protein  26.46 
 
 		 449 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0133  hypothetical protein  27.95 
 
 		 423 aa  129  9.000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0089  hypothetical protein  26.26 
 
 		 424 aa  129  9.000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.200818  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2124  hypothetical protein  25.79 
 
 		 424 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000234804  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1502  hypothetical protein  26.23 
 
 		 449 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00218363  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1638  hypothetical protein  28.15 
 
 		 427 aa  125  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1920  hypothetical protein  27.9 
 
 		 430 aa  125  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.249749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0094  hypothetical protein  27.46 
 
 		 424 aa  124  2e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1406  hypothetical protein  26.06 
 
 		 449 aa  123  5e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.122168  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1422  hypothetical protein  25.93 
 
 		 422 aa  122  9.999999999999999e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3462  hypothetical protein  26.24 
 
 		 435 aa  117  3.9999999999999997e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1988  hypothetical protein  23.18 
 
 		 450 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1747  hypothetical protein  27.44 
 
 		 443 aa  114  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.506846  hitchhiker  0.000552489 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2851  hypothetical protein  25.68 
 
 		 445 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0586103  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1252  hypothetical protein  26.53 
 
 		 426 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.16322 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0110  hypothetical protein  23.01 
 
 		 448 aa  107  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.765018 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1327  hypothetical protein  25.34 
 
 		 412 aa  105  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.964057  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5441  hypothetical protein  27.09 
 
 		 437 aa  103  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.819313 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2164  hypothetical protein  26.22 
 
 		 454 aa  103  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00681502  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3077  hypothetical protein  50.52 
 
 		 101 aa  100  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6064  hypothetical protein  24.48 
 
 		 439 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.634375  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3031  hypothetical protein  26.38 
 
 		 425 aa  93.6  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.416861 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3165  hypothetical protein  28.87 
 
 		 443 aa  92  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0143624  normal  0.30892 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2018  hypothetical protein  24.94 
 
 		 412 aa  88.2  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.896322  normal  0.166706 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3515  hypothetical protein  31.28 
 
 		 401 aa  77  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5444  hypothetical protein  30 
 
 		 395 aa  74.3  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3890  hypothetical protein  29.6 
 
 		 399 aa  70.5  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.282654 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1235  hypothetical protein  21.86 
 
 		 406 aa  67.8  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3017  hypothetical protein  26.73 
 
 		 429 aa  64.7  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0370734  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2478  hypothetical protein  22.64 
 
 		 374 aa  55.1  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3152  hypothetical protein  27.83 
 
 		 412 aa  52.4  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2730  hypothetical protein  24.01 
 
 		 394 aa  51.6  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00608426  hitchhiker  0.000203528 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>