242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2328 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2328  hypothetical protein  100 
 
 		 292 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0372766  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2239  hypothetical protein  80.82 
 
 		 292 aa  475  1e-133  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3163  hypothetical protein  67.12 
 
 		 292 aa  393  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0449219  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2287  hypothetical protein  61.15 
 
 		 291 aa  339  2.9999999999999998e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2402  hypothetical protein  58.36 
 
 		 293 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0682346  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1049  hypothetical protein  59.73 
 
 		 292 aa  325  4.0000000000000003e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120663 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3214  hypothetical protein  59.04 
 
 		 292 aa  322  4e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000193402  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1284  hypothetical protein  48.63 
 
 		 292 aa  265  5.999999999999999e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00734721  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1317  hypothetical protein  42.52 
 
 		 294 aa  249  3e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.269981  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1271  hypothetical protein  43.43 
 
 		 291 aa  245  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00975001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3972  hypothetical protein  43.43 
 
 		 291 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00569731  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3916  hypothetical protein  43.43 
 
 		 291 aa  242  6e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3724  hypothetical protein  43.43 
 
 		 291 aa  242  6e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3614  hypothetical protein  43.43 
 
 		 291 aa  242  6e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3632  hypothetical protein  43.43 
 
 		 291 aa  242  6e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4011  hypothetical protein  43.43 
 
 		 291 aa  242  6e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3887  hypothetical protein  43.43 
 
 		 291 aa  242  6e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000222822 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3921  hypothetical protein  43.43 
 
 		 291 aa  240  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.831608  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2607  hypothetical protein  47.95 
 
 		 291 aa  238  5.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.034124  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3696  hypothetical protein  43.77 
 
 		 291 aa  237  2e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1793  hypothetical protein  41.64 
 
 		 293 aa  236  4e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1698  hypothetical protein  42.52 
 
 		 292 aa  234  9e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.466508  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2525  hypothetical protein  43.54 
 
 		 291 aa  232  5e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2003  hypothetical protein  39.8 
 
 		 294 aa  232  7.000000000000001e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1056  hypothetical protein  44.03 
 
 		 291 aa  231  8.000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000165495  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2693  hypothetical protein  47.26 
 
 		 291 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1721  hypothetical protein  39.46 
 
 		 294 aa  231  1e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1599  hypothetical protein  44.86 
 
 		 292 aa  231  1e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000017463  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2788  hypothetical protein  46.92 
 
 		 291 aa  227  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2574  hypothetical protein  47.6 
 
 		 291 aa  227  2e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0448816 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2881  hypothetical protein  40.07 
 
 		 292 aa  225  5.0000000000000005e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000426445  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0011  YicC domain protein  44.18 
 
 		 292 aa  223  4e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.272506  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1033  domain of unknown function DUF1732  38.91 
 
 		 293 aa  222  6e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3632  hypothetical protein  43.34 
 
 		 293 aa  222  6e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.101055 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3896  hypothetical protein  41.87 
 
 		 289 aa  209  3e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000579804  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1946  hypothetical protein  44.03 
 
 		 291 aa  208  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2320  hypothetical protein  37.67 
 
 		 292 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000274769  hitchhiker  0.00243432 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0890  hypothetical protein  41.78 
 
 		 292 aa  206  3e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000147276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1239  hypothetical protein  35.96 
 
 		 292 aa  201  1.9999999999999998e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.369152  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2959  hypothetical protein  42.47 
 
 		 288 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0838  YicC domain protein  41.47 
 
 		 293 aa  195  6e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.422723  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2051  YicC domain protein  38.8 
 
 		 293 aa  187  2e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.974794  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1912  hypothetical protein  37.41 
 
 		 294 aa  187  2e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0397702  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0783  domain of unknown function DUF1732  39.19 
 
 		 291 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000478658  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0305  hypothetical protein  41.67 
 
 		 295 aa  178  8e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000735483  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1327  protein of unknown function DUF1732  31.49 
 
 		 291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0133754  normal  0.451646 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1763  hypothetical protein  35.37 
 
 		 290 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1774  hypothetical protein  40.6 
 
 		 295 aa  171  2e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.593354  normal  0.167904 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5843  domain of unknown function DUF1732  38.91 
 
 		 326 aa  171  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.534035 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3996  hypothetical protein  36.73 
 
 		 287 aa  170  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4848  hypothetical protein  36.82 
 
 		 287 aa  170  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0744075  hitchhiker  0.0000405788 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1457  hypothetical protein  38.41 
 
 		 295 aa  170  3e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000500736  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0131  hypothetical protein  37.5 
 
 		 287 aa  169  4e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2690  hypothetical protein  37.2 
 
 		 290 aa  169  4e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.886781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0318  hypothetical protein  38.01 
 
 		 287 aa  169  5e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0417  hypothetical protein  34.58 
 
 		 295 aa  169  7e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2475  domain of unknown function DUF1732  38.51 
 
 		 287 aa  168  9e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0296  hypothetical protein  34.69 
 
 		 293 aa  168  9e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1316  domain of unknown function DUF1732  40.61 
 
 		 292 aa  168  9e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2900  hypothetical protein  37.12 
 
 		 293 aa  168  1e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0403  hypothetical protein  38.94 
 
 		 295 aa  167  2e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0196247  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0455  hypothetical protein  37.67 
 
 		 287 aa  167  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0095  hypothetical protein  37.84 
 
 		 287 aa  167  2.9999999999999998e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.403752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0055  hypothetical protein  36.82 
 
 		 287 aa  166  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.926553  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0048  hypothetical protein  36.82 
 
 		 287 aa  166  5e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0407  hypothetical protein  37.12 
 
 		 295 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.122152  normal  0.436876 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4161  hypothetical protein  36.49 
 
 		 287 aa  165  9e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.226862  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2445  hypothetical protein  38.23 
 
 		 288 aa  165  9e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465243 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4116  hypothetical protein  36.73 
 
 		 287 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.124592  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0380  hypothetical protein  37.33 
 
 		 287 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0367  hypothetical protein  37.33 
 
 		 287 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0394  hypothetical protein  37.33 
 
 		 287 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000359441 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0369  hypothetical protein  37.33 
 
 		 287 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0065  hypothetical protein  37.25 
 
 		 297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4405  hypothetical protein  37.07 
 
 		 287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1488  domain of unknown function DUF1732  37.54 
 
 		 291 aa  163  3e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.283341 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3778  hypothetical protein  37.67 
 
 		 287 aa  163  3e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0372  hypothetical protein  37.41 
 
 		 291 aa  162  4.0000000000000004e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.816164  normal  0.284607 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0061  YicC domain protein  38.18 
 
 		 287 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3837  hypothetical protein  37.41 
 
 		 287 aa  162  6e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03501  hypothetical protein  38.18 
 
 		 287 aa  162  7e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.137526  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4145  hypothetical protein  38.18 
 
 		 287 aa  162  7e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0120633  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3853  hypothetical protein  38.18 
 
 		 287 aa  162  7e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.349633  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5014  hypothetical protein  38.18 
 
 		 287 aa  162  7e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0067  hypothetical protein  38.18 
 
 		 287 aa  162  7e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0211389  hitchhiker  0.00000185241 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4069  hypothetical protein  37.84 
 
 		 287 aa  162  8.000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.105197  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3605  hypothetical protein  37.33 
 
 		 287 aa  161  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0549  hypothetical protein  35.55 
 
 		 289 aa  161  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.829174  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3979  hypothetical protein  37.84 
 
 		 287 aa  160  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.200033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0377  hypothetical protein  36.64 
 
 		 287 aa  160  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000623436 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4122  hypothetical protein  37.16 
 
 		 287 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.970694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4061  hypothetical protein  37.16 
 
 		 287 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.879365 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0351  hypothetical protein  36.99 
 
 		 287 aa  160  3e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3952  hypothetical protein  37.16 
 
 		 287 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4015  hypothetical protein  37.16 
 
 		 287 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3934  hypothetical protein  37.16 
 
 		 287 aa  159  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.818058  hitchhiker  0.00001038 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1993  hypothetical protein  34.25 
 
 		 288 aa  159  5e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1988  hypothetical protein  34.59 
 
 		 288 aa  159  5e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03453  hypothetical protein  37.76 
 
 		 285 aa  159  6e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.123292  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4257  hypothetical protein  36.64 
 
 		 287 aa  159  6e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>