More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2318 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  100 
 
 		 217 aa  430  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  72.51 
 
 		 213 aa  317  7.999999999999999e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  66.19 
 
 		 213 aa  298  5e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  63.94 
 
 		 212 aa  282  3.0000000000000004e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3204  thymidylate kinase  66.67 
 
 		 225 aa  271  6e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00156948  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1059  thymidylate kinase  66.04 
 
 		 225 aa  270  1e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.34393e-16 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  61.61 
 
 		 219 aa  267  7e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  58.59 
 
 		 216 aa  239  2e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  52.38 
 
 		 214 aa  205  4e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  52.55 
 
 		 224 aa  204  1e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  50.23 
 
 		 215 aa  203  2e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0085  thymidylate kinase  51.6 
 
 		 211 aa  200  9.999999999999999e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  50.72 
 
 		 207 aa  197  1.0000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  48.8 
 
 		 215 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  44.02 
 
 		 204 aa  195  4.0000000000000005e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  46.19 
 
 		 211 aa  192  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  56.08 
 
 		 210 aa  189  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  48.84 
 
 		 688 aa  189  4e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1862  dTMP kinase  49.53 
 
 		 214 aa  188  7e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  52.13 
 
 		 210 aa  187  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  47.85 
 
 		 210 aa  187  1e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  45.87 
 
 		 215 aa  186  2e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3227  thymidylate kinase  44.55 
 
 		 217 aa  186  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000111751  normal  0.0445017 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0551  thymidylate kinase  49.3 
 
 		 217 aa  186  3e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  48.29 
 
 		 208 aa  186  3e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2202  dTMP kinase  49.3 
 
 		 217 aa  186  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0588786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1236  dTMP kinase  51.76 
 
 		 217 aa  185  4e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.97692 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  49.53 
 
 		 221 aa  185  4e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  47.32 
 
 		 207 aa  185  4e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0498  dTMP kinase  43.48 
 
 		 236 aa  185  5e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  47.06 
 
 		 212 aa  184  9e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  51.01 
 
 		 210 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0609  thymidylate kinase  50.75 
 
 		 225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0198408  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  50.25 
 
 		 210 aa  182  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  48.58 
 
 		 218 aa  182  3e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  51.01 
 
 		 210 aa  182  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  51.2 
 
 		 207 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  46.15 
 
 		 216 aa  182  4.0000000000000006e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3110  dTMP kinase  49.28 
 
 		 209 aa  182  4.0000000000000006e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.2545  normal  0.244995 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  52.26 
 
 		 210 aa  181  6e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  44.55 
 
 		 217 aa  181  7e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0398  dTMP kinase  45.93 
 
 		 222 aa  181  7e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  51.05 
 
 		 705 aa  180  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  49.75 
 
 		 210 aa  180  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2940  dTMP kinase  44.13 
 
 		 225 aa  180  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  52.26 
 
 		 210 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  49.49 
 
 		 671 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  43.07 
 
 		 206 aa  178  4.999999999999999e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1508  dTMP kinase  50.47 
 
 		 240 aa  178  4.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  47.57 
 
 		 225 aa  178  4.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4191  dTMP kinase  50.24 
 
 		 244 aa  178  5.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3024  thymidylate kinase  43.19 
 
 		 209 aa  177  9e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0778  thymidylate kinase  44.13 
 
 		 207 aa  177  1e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6278  dTMP kinase  48.1 
 
 		 226 aa  177  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.266186 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  47 
 
 		 226 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0704  thymidylate kinase  46.35 
 
 		 208 aa  177  1e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  44.62 
 
 		 207 aa  177  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  49.74 
 
 		 205 aa  176  2e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  50 
 
 		 202 aa  176  3e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  49.47 
 
 		 703 aa  176  3e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  48.8 
 
 		 208 aa  174  6e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1575  thymidylate kinase  44.6 
 
 		 211 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3720  dTMP kinase  44.34 
 
 		 229 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00484768 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  45.54 
 
 		 223 aa  174  9.999999999999999e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1460  dTMP kinase  43.33 
 
 		 223 aa  173  9.999999999999999e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  43.68 
 
 		 203 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2703  thymidylate kinase  47.62 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.833829  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  50.51 
 
 		 211 aa  174  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1310  thymidylate kinase  41.9 
 
 		 214 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  41.15 
 
 		 233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_684  thymidylate kinase  46.35 
 
 		 207 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  47.32 
 
 		 217 aa  173  1.9999999999999998e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  45.24 
 
 		 686 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  45.07 
 
 		 223 aa  172  2.9999999999999996e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1564  thymidylate kinase  47.94 
 
 		 225 aa  172  2.9999999999999996e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.446858  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  45.87 
 
 		 236 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0970  dTMP kinase  51.43 
 
 		 210 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3114  thymidylate kinase  48.15 
 
 		 230 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0311212  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0822  thymidylate kinase  46.19 
 
 		 213 aa  172  5e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0899477  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2155  thymidylate kinase  44.44 
 
 		 221 aa  172  5e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367243  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4562  dTMP kinase  50.71 
 
 		 244 aa  171  5.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0960  thymidylate kinase  49.74 
 
 		 214 aa  171  5.999999999999999e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.265378  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  48.15 
 
 		 218 aa  171  9e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3232  dTMP kinase  45.54 
 
 		 226 aa  171  9e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0992  thymidylate kinase  50 
 
 		 211 aa  171  1e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2010  thymidylate kinase  45.75 
 
 		 230 aa  170  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154294  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  43.46 
 
 		 707 aa  170  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6923  thymidylate kinase  46.67 
 
 		 225 aa  171  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1092  thymidylate kinase  46.7 
 
 		 219 aa  170  2e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.733791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1644  dTMP kinase  47.42 
 
 		 197 aa  169  3e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  46.83 
 
 		 686 aa  169  3e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0128  dTMP kinase  51.44 
 
 		 217 aa  169  3e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.630862  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1660  thymidylate kinase  46.08 
 
 		 206 aa  169  4e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0638751  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0033  dTMP kinase  44.55 
 
 		 206 aa  169  4e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  51.1 
 
 		 213 aa  169  4e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  45.24 
 
 		 688 aa  168  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4102  thymidylate kinase  45.93 
 
 		 226 aa  168  6e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.808086  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  50.79 
 
 		 208 aa  167  1e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4707  dTMP kinase  50 
 
 		 236 aa  167  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0191437 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  40.38 
 
 		 217 aa  166  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>