More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2315 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  100 
 
 		 298 aa  597  1e-170  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  77.44 
 
 		 299 aa  479  1e-134  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  74.41 
 
 		 297 aa  451  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  71.04 
 
 		 297 aa  441  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1726  GTP-binding protein Era  64.21 
 
 		 296 aa  379  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2127  GTP-binding protein Era  60.74 
 
 		 296 aa  354  1e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148937  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2421  GTP-binding protein Era  54.88 
 
 		 302 aa  338  5e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  57.19 
 
 		 298 aa  338  8e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  54.61 
 
 		 302 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1405  GTP-binding protein Era  53.38 
 
 		 303 aa  335  3.9999999999999995e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00334874  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1029  GTP-binding protein Era  55.56 
 
 		 302 aa  333  2e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1067  GTP-binding protein Era  56.31 
 
 		 297 aa  332  4e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0646  GTP-binding protein Era  54.11 
 
 		 305 aa  332  4e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.601606  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  54.55 
 
 		 301 aa  331  1e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  54.88 
 
 		 301 aa  330  2e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0819  GTP-binding protein Era  54.88 
 
 		 301 aa  328  7e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000201776  decreased coverage  1.20434e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  54.88 
 
 		 301 aa  328  8e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4380  GTP-binding protein Era  54.55 
 
 		 301 aa  326  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000332799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4037  GTP-binding protein Era  54.55 
 
 		 301 aa  326  2.0000000000000001e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4047  GTP-binding protein Era  54.55 
 
 		 301 aa  326  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000669103  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4433  GTP-binding protein Era  54.55 
 
 		 301 aa  326  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4322  GTP-binding protein Era  54.55 
 
 		 301 aa  326  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08796e-57 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4199  GTP-binding protein Era  54.21 
 
 		 301 aa  325  6e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000030589  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4524  GTP-binding protein Era  54.21 
 
 		 301 aa  325  6e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000023252  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3066  GTP-binding protein Era  54.05 
 
 		 300 aa  322  5e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000674548  decreased coverage  0.0000000895367 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4275  GTP-binding protein Era  52.9 
 
 		 303 aa  318  7e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0668  GTP-binding protein Era  53.24 
 
 		 299 aa  316  2e-85  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0548419  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1116  GTP-binding protein Era  52.74 
 
 		 303 aa  312  3.9999999999999997e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2293  GTP-binding protein Era  53.8 
 
 		 310 aa  310  2e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0382696  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1625  GTP-binding protein Era  51.03 
 
 		 299 aa  308  5e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1659  GTP-binding protein Era  51.03 
 
 		 299 aa  308  5e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1499  GTP-binding protein Era  52.56 
 
 		 299 aa  308  8e-83  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.030246  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2205  GTP-binding protein Era  53.47 
 
 		 310 aa  308  8e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.395814  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1653  small GTP-binding protein Era  53.14 
 
 		 310 aa  306  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12510  GTP-binding protein Era  50.34 
 
 		 294 aa  306  3e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0397  GTP-binding protein Era  48.66 
 
 		 303 aa  303  2.0000000000000002e-81  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0908  GTP-binding protein Era  51.17 
 
 		 303 aa  303  2.0000000000000002e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1561  Era, Era/TrmE family GTP-binding protein  50 
 
 		 293 aa  300  1e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.400098  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1981  GTP-binding protein Era  48.81 
 
 		 298 aa  300  2e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0874  GTP-binding protein Era  52.9 
 
 		 307 aa  300  2e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0138  GTP-binding protein Era  50.17 
 
 		 300 aa  300  2e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1134  GTP-binding protein Era  48.11 
 
 		 299 aa  300  3e-80  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.968945  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  53.24 
 
 		 303 aa  299  4e-80  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0738  GTP-binding protein Era  54.39 
 
 		 301 aa  297  1e-79  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.979215  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  51.36 
 
 		 324 aa  295  7e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  49.14 
 
 		 302 aa  295  9e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0780  GTPase  51.17 
 
 		 303 aa  292  6e-78  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00998411  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2045  GTP-binding protein Era  50.84 
 
 		 308 aa  290  2e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0600  GTP-binding protein Era  50.34 
 
 		 301 aa  288  6e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2272  GTP-binding protein Era  48.29 
 
 		 296 aa  287  1e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1987  GTP-binding protein Era  48.29 
 
 		 296 aa  287  1e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2156  GTP-binding protein Era  51.5 
 
 		 310 aa  285  5e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151042 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1205  GTP-binding protein Era  45.79 
 
 		 297 aa  284  1.0000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.124977  normal  0.282602 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02997  GTP-binding protein Era  48.49 
 
 		 314 aa  280  2e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.249422  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0671  GTP-binding protein Era  49.15 
 
 		 301 aa  276  4e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.584741  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0989  GTPase  47.49 
 
 		 305 aa  275  7e-73  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00032345  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0973  GTP-binding protein Era  45.89 
 
 		 311 aa  274  1.0000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1004  GTP-binding protein Era  45.89 
 
 		 311 aa  273  4.0000000000000004e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1711  GTP-binding protein Era  48.47 
 
 		 307 aa  272  4.0000000000000004e-72  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000444879  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1412  GTP-binding protein Era  47.28 
 
 		 300 aa  272  4.0000000000000004e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000752923  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2457  GTP-binding protein Era  49.15 
 
 		 306 aa  271  1e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3148  GTP-binding protein Era  46.82 
 
 		 300 aa  271  1e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0159525  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2959  GTP-binding protein Era  48.12 
 
 		 310 aa  268  5.9999999999999995e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000390486  normal  0.0714001 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1348  GTP-binding protein Era  48.81 
 
 		 315 aa  268  8.999999999999999e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.136623  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4121  GTP-binding protein Era  47.95 
 
 		 305 aa  266  2e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.383616  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0482  GTP-binding protein Era  45.08 
 
 		 295 aa  267  2e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3668  GTP-binding protein Era  46 
 
 		 302 aa  266  2.9999999999999995e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0735  GTP-binding protein Era  44.48 
 
 		 314 aa  265  5.999999999999999e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.222854  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1239  GTP-binding protein Era  46.82 
 
 		 300 aa  265  5.999999999999999e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.680465  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2784  GTP-binding protein Era  46.15 
 
 		 301 aa  264  1e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.731152  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0864  GTP-binding protein Era  46.64 
 
 		 296 aa  263  2e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0183856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1008  GTP-binding protein Era  46.64 
 
 		 296 aa  263  2e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.028746 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0651  putative GTP-binding protein  46.8 
 
 		 312 aa  263  2e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.181354  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1291  GTP-binding protein Era  47.49 
 
 		 449 aa  263  3e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.537318 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1160  GTP-binding protein Era  46.76 
 
 		 338 aa  263  3e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.15184  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0296  GTP-binding protein Era  43.48 
 
 		 306 aa  263  3e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0808  GTP-binding protein Era  46.94 
 
 		 299 aa  263  3e-69  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1069  GTP-binding protein Era  46.15 
 
 		 301 aa  263  3e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4517  GTP-binding protein Era  47.62 
 
 		 337 aa  262  4e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3070  GTP-binding protein Era  45.67 
 
 		 301 aa  262  4e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.129104  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1205  GTP-binding protein Era  45.67 
 
 		 301 aa  262  6e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.745594  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1685  GTP-binding protein Era  44.41 
 
 		 295 aa  261  6.999999999999999e-69  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1137  GTP-binding protein Era  45.39 
 
 		 303 aa  261  6.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0472293  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1190  GTP-binding protein Era  45.39 
 
 		 303 aa  261  6.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.442285  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3612  GTP-binding protein Era  45.39 
 
 		 303 aa  261  6.999999999999999e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.387158  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1349  GTP-binding protein Era  46.42 
 
 		 339 aa  261  8e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2181  GTP-binding protein Era  47.99 
 
 		 451 aa  261  8e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2847  GTP-binding protein Era  46.08 
 
 		 339 aa  261  1e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.410629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2929  GTP-binding protein Era  46.08 
 
 		 339 aa  261  1e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.275755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1387  GTP-binding protein Era  48.64 
 
 		 308 aa  261  1e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.263237  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3025  GTP-binding protein Era  46.08 
 
 		 339 aa  261  1e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.118015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0597  GTP-binding protein Era  46.53 
 
 		 348 aa  260  2e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00117321 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0160  GTP-binding protein Era  47.65 
 
 		 311 aa  260  2e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.709103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1038  GTP-binding protein Era  45.73 
 
 		 330 aa  260  2e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00137835  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0332  GTP-binding protein Era  44.22 
 
 		 293 aa  260  2e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2207  GTP-binding protein Era  43.89 
 
 		 307 aa  260  2e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.547377 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1279  GTP-binding protein Era  45.39 
 
 		 338 aa  259  3e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.446406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0080  GTP-binding protein Era  45.27 
 
 		 300 aa  260  3e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000115632  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1246  GTP-binding protein Era  45.39 
 
 		 338 aa  260  3e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00162731  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1202  GTP-binding protein Era  45.39 
 
 		 338 aa  259  3e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0677572  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>