More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2308 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2308  response regulator receiver protein  100 
 
 		 123 aa  248  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2219  response regulator  72.95 
 
 		 123 aa  178  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3143  response regulator receiver protein  68.85 
 
 		 124 aa  176  7e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1409  two component signal transduction response regulator  66.94 
 
 		 123 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000120114  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0743  response regulator receiver protein  65.29 
 
 		 132 aa  164  4e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0758  response regulator receiver protein  63.93 
 
 		 132 aa  163  5.9999999999999996e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0540632 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  46.61 
 
 		 124 aa  114  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.15 
 
 		 310 aa  114  5e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1901  response regulator receiver protein  44.54 
 
 		 125 aa  113  8.999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1116  DNA-binding response regulator  50.43 
 
 		 235 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.310768  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 121 aa  111  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2649  response regulator receiver protein  42.37 
 
 		 122 aa  110  7.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.857048  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3747  response regulator receiver protein  43.59 
 
 		 121 aa  110  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.11 
 
 		 228 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4150  response regulator receiver protein  43.7 
 
 		 125 aa  109  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.583085 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0845  response regulator receiver protein  41.38 
 
 		 125 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.455865  normal  0.167506 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.61 
 
 		 232 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0783  two component transcriptional regulator  46.22 
 
 		 231 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  44.63 
 
 		 231 aa  108  3e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2951  two component transcriptional regulator  45.38 
 
 		 236 aa  107  4.0000000000000004e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14770  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  48.25 
 
 		 226 aa  107  4.0000000000000004e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.383411  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2443  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.8 
 
 		 224 aa  107  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121019 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  44.63 
 
 		 231 aa  107  5e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2712  two component transcriptional regulator  44.63 
 
 		 224 aa  107  5e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00552555  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2892  two component transcriptional regulator  47.11 
 
 		 227 aa  107  5e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0239565 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2562  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  44.95 
 
 		 437 aa  107  7.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2155  CheA signal transduction histidine kinase  39.17 
 
 		 1609 aa  107  7.000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0653  two-component response regulator PhoB  47.11 
 
 		 230 aa  106  9.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.131558  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  43.97 
 
 		 121 aa  106  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0483  two component transcriptional regulator  45.38 
 
 		 229 aa  106  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.342081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 235 aa  106  1e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1866  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.24 
 
 		 326 aa  105  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1485  response regulator receiver  44.63 
 
 		 235 aa  105  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.236897  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20650  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  41.88 
 
 		 231 aa  105  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260682  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4009  two component transcriptional regulator  48.62 
 
 		 230 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00751412  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4125  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.62 
 
 		 230 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.125271  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4151  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.62 
 
 		 230 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1873  response regulator receiver  42.24 
 
 		 326 aa  105  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.402703 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4952  response regulator receiver protein  43.97 
 
 		 121 aa  105  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.699568  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3990  response regulator receiver protein  42.74 
 
 		 146 aa  105  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27172  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5113  response regulator receiver protein  44.07 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  44.63 
 
 		 229 aa  105  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0399  two component transcriptional regulator  44.83 
 
 		 272 aa  105  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1394  two component transcriptional regulator  44.74 
 
 		 236 aa  105  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000024965  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2387  two component transcriptional regulator  43.8 
 
 		 229 aa  104  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00115026  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1449  two component transcriptional regulator  43.59 
 
 		 246 aa  104  4e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1632  response regulator receiver  42.86 
 
 		 123 aa  104  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2076  histidine kinase  42.5 
 
 		 1373 aa  103  5e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.5 
 
 		 236 aa  103  7e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  45.61 
 
 		 239 aa  103  7e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.52 
 
 		 231 aa  103  8e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0738  response regulator receiver protein  47.46 
 
 		 123 aa  103  8e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2401  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  41.38 
 
 		 229 aa  103  9e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0355  response regulator receiver protein  39.47 
 
 		 161 aa  103  9e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.384709  normal  0.97064 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2238  response regulator receiver protein  43.22 
 
 		 140 aa  103  9e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0218186  hitchhiker  0.00000354209 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2507  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  44.44 
 
 		 488 aa  102  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.182398 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1750  response regulator PleD  42.98 
 
 		 457 aa  103  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0882  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.63 
 
 		 230 aa  103  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.148935 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3814  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.47 
 
 		 1131 aa  102  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.257486 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0719  DNA-binding response regulator  46.85 
 
 		 236 aa  102  2e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0951718  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1501  response regulator receiver protein  44.92 
 
 		 132 aa  102  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.153095  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0640  response regulator receiver protein  36.89 
 
 		 123 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0603  two component transcriptional regulator  43.7 
 
 		 233 aa  102  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0519325  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1673  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.61 
 
 		 233 aa  102  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0631  response regulator receiver protein  36.89 
 
 		 123 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1555  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0650  response regulator receiver protein  37.19 
 
 		 123 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.438565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2044  response regulator receiver protein  40.52 
 
 		 123 aa  101  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0300859  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1560  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 129 aa  101  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1062  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 120 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58489  hitchhiker  0.0000344775 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.74 
 
 		 236 aa  101  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0669  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 123 aa  101  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4465  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.2 
 
 		 437 aa  101  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0415  two component transcriptional regulator  48.62 
 
 		 231 aa  101  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.777838 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  41.38 
 
 		 234 aa  101  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  45.61 
 
 		 235 aa  101  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5185  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  45.45 
 
 		 234 aa  101  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.809056 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0251  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 126 aa  101  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.102048 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3968  response regulator receiver protein  42.74 
 
 		 125 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  45.61 
 
 		 235 aa  101  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0308  two component transcriptional regulator  40.83 
 
 		 239 aa  101  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  41.6 
 
 		 229 aa  101  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2029  response regulator receiver protein  43.7 
 
 		 124 aa  101  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.371136 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4718  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  45.45 
 
 		 239 aa  101  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.220817 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0856  response regulator receiver domain-containing protein  39.13 
 
 		 120 aa  100  5e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0758877  normal  0.0586548 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2281  two component transcriptional regulator  44.74 
 
 		 229 aa  100  5e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.331932  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2695  response regulator receiver domain-containing protein  41.59 
 
 		 186 aa  100  5e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00269866  normal  0.78823 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  45.61 
 
 		 235 aa  100  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1134  response regulator receiver protein  37.7 
 
 		 138 aa  100  5e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.461969  hitchhiker  0.00297359 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  45.61 
 
 		 235 aa  100  5e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  45.45 
 
 		 231 aa  100  6e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1133  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.74 
 
 		 217 aa  100  6e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2688  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  48.57 
 
 		 243 aa  100  6e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0901925  normal  0.494683 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  41.6 
 
 		 229 aa  100  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2303  response regulator receiver protein  42.73 
 
 		 227 aa  100  6e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2937  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.59 
 
 		 243 aa  100  7e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5261  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.59 
 
 		 237 aa  100  7e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.909356  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0640  two component transcriptional regulator  43.59 
 
 		 233 aa  100  7e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772339  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2795  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 121 aa  100  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2915  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.76 
 
 		 225 aa  100  8e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.892207  normal  0.300351 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>