More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2224 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2224  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 260 aa  532  1e-150  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0549039  hitchhiker  0.0000374036 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.86 
 
 		 257 aa  210  2e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.19 
 
 		 268 aa  209  4e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.47 
 
 		 259 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4107  enoyl-CoA hydratase  44.11 
 
 		 263 aa  194  9e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540982  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  45.17 
 
 		 261 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  41.51 
 
 		 263 aa  192  3e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.53 
 
 		 267 aa  189  4e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  38.02 
 
 		 263 aa  188  7e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0274  enoyl-CoA hydratase  39.84 
 
 		 262 aa  188  9e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7538  enoyl-CoA hydratase  42.91 
 
 		 264 aa  187  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.46 
 
 		 260 aa  187  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.75 
 
 		 260 aa  187  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.47 
 
 		 260 aa  186  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0420  enoyl-CoA hydratase  35.45 
 
 		 270 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.697882  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0485  enoyl-CoA hydratase  39.84 
 
 		 261 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474885  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0111  enoyl-CoA hydratase  35.34 
 
 		 275 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.503929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0691  enoyl-CoA hydratase  35.07 
 
 		 270 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.15 
 
 		 264 aa  183  3e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  37.36 
 
 		 263 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8753  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.53 
 
 		 273 aa  182  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0594436 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  37.64 
 
 		 263 aa  182  6e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  37.64 
 
 		 263 aa  182  7e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  41.48 
 
 		 263 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  41.48 
 
 		 263 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  41.48 
 
 		 263 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  41.48 
 
 		 263 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  41.48 
 
 		 263 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2735  enoyl-CoA hydratase  39.08 
 
 		 264 aa  181  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  41.48 
 
 		 263 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  41.48 
 
 		 263 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2341  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  41.15 
 
 		 266 aa  179  4e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.829982  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  39.78 
 
 		 263 aa  179  4.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6043  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.96 
 
 		 258 aa  178  7e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  37.55 
 
 		 260 aa  178  7e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  41.57 
 
 		 260 aa  178  9e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.79 
 
 		 260 aa  178  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3917  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.74 
 
 		 271 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.4 
 
 		 264 aa  176  3e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  38.17 
 
 		 260 aa  176  3e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  39 
 
 		 265 aa  176  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  36.92 
 
 		 259 aa  175  6e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  39 
 
 		 265 aa  175  7e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.77 
 
 		 267 aa  175  7e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  40.78 
 
 		 263 aa  175  7e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1304  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.89 
 
 		 271 aa  175  7e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.285704 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.22 
 
 		 266 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.69 
 
 		 260 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  39.76 
 
 		 260 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.35 
 
 		 271 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.54 
 
 		 260 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  36.74 
 
 		 261 aa  173  2.9999999999999996e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3622  enoyl-CoA hydratase  41.92 
 
 		 268 aa  173  2.9999999999999996e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538204  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1893  enoyl-CoA hydratase  39 
 
 		 266 aa  173  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.09 
 
 		 264 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0080  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.22 
 
 		 266 aa  172  2.9999999999999996e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1007  enoyl-CoA hydratase  35.46 
 
 		 268 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0394132  normal  0.416102 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.16 
 
 		 260 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2158  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.02 
 
 		 277 aa  171  7.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.83195  normal  0.489603 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.02 
 
 		 263 aa  170  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.78 
 
 		 260 aa  171  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2212  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.26 
 
 		 262 aa  169  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136101  normal  0.0104789 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3272  enoyl-CoA hydratase  39 
 
 		 266 aa  169  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.69 
 
 		 260 aa  169  3e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1395  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.8 
 
 		 261 aa  169  4e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2482  enoyl-CoA hydratase  39.92 
 
 		 277 aa  169  6e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.31 
 
 		 260 aa  168  6e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3285  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.46 
 
 		 264 aa  168  6e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.69 
 
 		 258 aa  168  8e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0555  enoyl-CoA hydratase  39.45 
 
 		 262 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.323488  normal  0.0688647 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.38 
 
 		 259 aa  167  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.360311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1300  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  38.37 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.132411  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  40.15 
 
 		 262 aa  166  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  39.3 
 
 		 260 aa  167  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0438  enoyl-CoA hydratase  40.15 
 
 		 261 aa  166  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  38.58 
 
 		 260 aa  167  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4154  enoyl-CoA hydratase  41.8 
 
 		 263 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3213  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.36 
 
 		 267 aa  167  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3841  enoyl-CoA hydratase  36.8 
 
 		 270 aa  166  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.198619  normal  0.203847 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1377  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  39.85 
 
 		 260 aa  166  4e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  36.64 
 
 		 258 aa  166  4e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  38.2 
 
 		 260 aa  166  4e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4537  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.4 
 
 		 261 aa  166  4e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.049531  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3726  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.01 
 
 		 264 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.297829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  38.64 
 
 		 280 aa  165  5e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0603  enoyl-CoA hydratase  38.22 
 
 		 267 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110461  normal  0.0769343 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.74 
 
 		 270 aa  165  5.9999999999999996e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0810  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.36 
 
 		 269 aa  165  5.9999999999999996e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.748292  normal  0.305394 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2490  enoyl-CoA hydratase  39.53 
 
 		 277 aa  165  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.154881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2445  enoyl-CoA hydratase  39.53 
 
 		 277 aa  165  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  36.68 
 
 		 257 aa  165  8e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  37.93 
 
 		 260 aa  165  8e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3800  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.04 
 
 		 287 aa  164  9e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.964787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  36.15 
 
 		 662 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0063  enoyl-CoA hydratase  37.07 
 
 		 262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2165  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.19 
 
 		 258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192446  normal  0.593108 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1758  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.98 
 
 		 263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.599113  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2792  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.88 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.552079 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3684  enoyl-CoA hydratase  35.38 
 
 		 269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  37.31 
 
 		 257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>