More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2213 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_2213  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
392 aa  785    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000256776  normal  0.0132753 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3319  acetyl-CoA acetyltransferase  66.49 
 
 
393 aa  546  1e-154  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.370073  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1491  acetyl-CoA acetyltransferase  66.58 
 
 
393 aa  542  1e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3545  acetyl-CoA acetyltransferase  61.79 
 
 
393 aa  498  1e-140  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1778  acetyl-CoA acetyltransferase  55.87 
 
 
405 aa  451  1.0000000000000001e-126  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2460  acetyl-CoA acetyltransferase  54.99 
 
 
392 aa  421  1e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2170  acetyl-CoA acetyltransferase  54.73 
 
 
392 aa  420  1e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0789  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  52.79 
 
 
403 aa  417  9.999999999999999e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1875  acetyl-CoA acetyltransferase  53.71 
 
 
391 aa  412  1e-114  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51590  acetyl-CoA acetyltransferase  53.08 
 
 
395 aa  395  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4498  acetyl-CoA acetyltransferase  51.92 
 
 
392 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.231134  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3299  acetyl-CoA acetyltransferase  51.41 
 
 
392 aa  393  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.784378 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1351  acetyl-CoA acetyltransferase  51.28 
 
 
393 aa  393  1e-108  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.428024  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23640  acetyl-CoA acetyltransferase  50.38 
 
 
392 aa  394  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3293  acetyl-CoA acetyltransferase  51.28 
 
 
393 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.562243  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4636  acetyl-CoA acetyltransferase  51.92 
 
 
392 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1701  acetyl-CoA acetyltransferase  51.79 
 
 
393 aa  391  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.689247  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0592  acetyl-CoA acetyltransferase  52.94 
 
 
401 aa  389  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0803  acetyl-CoA acetyltransferase  51.15 
 
 
392 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0515651  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38630  acetyl-CoA acetyltransferase  51.03 
 
 
393 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.752168  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1892  acetyl-CoA acetyltransferase  54.04 
 
 
374 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0532  acetyl-CoA acetyltransferase  49.74 
 
 
392 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0314  acetyl-CoA acetyltransferase  50.76 
 
 
400 aa  386  1e-106  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0364767  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1165  acetyl-CoA acetyltransferase  49.36 
 
 
393 aa  386  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000755496  normal  0.122862 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1441  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  50 
 
 
393 aa  385  1e-106  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0922147 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0308  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  50.13 
 
 
402 aa  385  1e-106  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02692  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 
393 aa  382  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2992  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 
393 aa  382  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.936911  normal  0.139342 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1668  acetyl-CoA acetyltransferase  51.79 
 
 
401 aa  382  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0871  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 
393 aa  382  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4629  acetyl-CoA acetyltransferase  50.38 
 
 
392 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.817149  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02655  hypothetical protein  50 
 
 
393 aa  382  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.990226  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0509  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 
392 aa  381  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989603  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3597  acetyl-CoA acetyltransferase  50.64 
 
 
393 aa  383  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.840519 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02151  acetyl-CoA acetyltransferase  52.94 
 
 
394 aa  379  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0846  acetyl-CoA acetyltransferase  49.74 
 
 
393 aa  380  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.874703  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1434  acetyl-CoA acetyltransferase  52.94 
 
 
394 aa  379  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.39386  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2058  acetyl-CoA acetyltransferase  51.66 
 
 
395 aa  378  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1138  acetyl-CoA acetyltransferase  49.87 
 
 
393 aa  380  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.495494 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3237  acetyl-CoA acetyltransferase  49.49 
 
 
392 aa  378  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000800068 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2365  acetyl-CoA acetyltransferase  52.94 
 
 
394 aa  378  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3060  acetyl-CoA acetyltransferase  50.64 
 
 
392 aa  381  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.954536  normal  0.134975 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3171  acetyl-CoA acetyltransferase  49.49 
 
 
392 aa  378  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4113  acetyl-CoA acetyltransferase  49.74 
 
 
393 aa  380  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000455591 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02110  hypothetical protein  52.94 
 
 
394 aa  379  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1426  acetyl-CoA acetyltransferase  52.94 
 
 
394 aa  379  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000528422 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5280  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 
398 aa  380  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2991  acetyl-CoA acetyltransferase  49.74 
 
 
393 aa  380  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00959201  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0609  acetyl-CoA acetyltransferase  50.64 
 
 
392 aa  381  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3016  acetyl-CoA acetyltransferase  49.74 
 
 
393 aa  380  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3166  acetyl-CoA acetyltransferase  49.74 
 
 
393 aa  380  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.989786  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3251  acetyl-CoA acetyltransferase  49.49 
 
 
392 aa  378  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00372711 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0675  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  50.76 
 
 
402 aa  381  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3352  acetyl-CoA acetyltransferase  49.49 
 
 
402 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.378933 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0402  acetyl-CoA acetyltransferase  48.46 
 
 
393 aa  375  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0957  acetyl-CoA acetyltransferase  49.87 
 
 
392 aa  378  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3820  acetyl-CoA acetyltransferase  50.38 
 
 
392 aa  375  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0824  acetyl-CoA acetyltransferase  49.62 
 
 
392 aa  378  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.122225  hitchhiker  0.00529979 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1246  acetyl-CoA acetyltransferase  49.49 
 
 
390 aa  378  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3188  acetyl-CoA acetyltransferase  49.49 
 
 
392 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0274  acetyl-CoA acetyltransferase  51.54 
 
 
390 aa  377  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0504  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 
392 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0234538 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0306  acetyl-CoA acetyltransferase  49.48 
 
 
392 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.67433  normal  0.297498 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3162  acetyl-CoA acetyltransferase  48.34 
 
 
392 aa  377  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2401  acetyl-CoA acetyltransferases  48.97 
 
 
408 aa  375  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.412675  normal  0.536301 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2373  acetyl-CoA acetyltransferase  52.43 
 
 
394 aa  375  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0412  acetyl-CoA acetyltransferase  48.46 
 
 
393 aa  375  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1784  acetyl-CoA acetyltransferase  50.52 
 
 
394 aa  375  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0032  acetyl-CoA acetyltransferase  49.23 
 
 
394 aa  372  1e-102  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.713781  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4076  acetyl-CoA acetyltransferase  49.49 
 
 
391 aa  373  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0498749  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3932  acetyl-CoA acetyltransferase  49.49 
 
 
391 aa  373  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.650395  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3765  acetyl-CoA acetyltransferase  49.49 
 
 
391 aa  373  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3780  acetyl-CoA acetyltransferase  49.49 
 
 
391 aa  372  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.514238  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1160  acetyl-CoA acetyltransferase  48.6 
 
 
392 aa  372  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1109  acetyl-CoA acetyltransferase  49.49 
 
 
391 aa  373  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.228356  normal  0.198631 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4240  acetyl-CoA acetyltransferase  49.49 
 
 
391 aa  373  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.749727  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1380  acetyl-CoA acetyltransferase  50.51 
 
 
391 aa  372  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.435446  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4129  acetyl-CoA acetyltransferase  49.49 
 
 
391 aa  372  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00256645  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1134  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 
398 aa  373  1e-102  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2187  acetyl-CoA acetyltransferase  49.1 
 
 
392 aa  372  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0311845  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4150  acetyl-CoA acetyltransferase  49.49 
 
 
391 aa  372  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0127373  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5118  acetyl-CoA acetyltransferase  49.36 
 
 
394 aa  372  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.583102 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2342  acetyl-CoA acetyltransferase  47.31 
 
 
393 aa  373  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0411622 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4043  acetyl-CoA acetyltransferase  49.49 
 
 
391 aa  373  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0543  acetyl-CoA acetyltransferase  48.08 
 
 
393 aa  372  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7614  acetyl-CoA acetyltransferase  48.45 
 
 
392 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.130059 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3667  acetyl-CoA acetyltransferase  48.59 
 
 
394 aa  374  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.208035  normal  0.356669 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0052  acetyl-CoA acetyltransferase  48.98 
 
 
392 aa  372  1e-102  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000885488  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2023  acetyl-CoA acetyltransferase  48.34 
 
 
392 aa  369  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4344  acetyl-CoA acetyltransferase  50.26 
 
 
408 aa  368  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2772  acetyl-CoA acetyltransferase  47.07 
 
 
393 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2256  acetyl-CoA acetyltransferase  47.06 
 
 
393 aa  369  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0160796  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1814  acetyl-CoA acetyltransferase  47.31 
 
 
393 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.390128 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1790  acetyl-CoA acetyltransferase  47.31 
 
 
393 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3852  acetyl-CoA acetyltransferase  48.72 
 
 
391 aa  370  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.647198  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1484  acetyl-CoA acetyltransferase  48.08 
 
 
393 aa  371  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226113  normal  0.0550721 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2158  acetyl-CoA acetyltransferase  47.07 
 
 
393 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6289  acetyl-CoA acetyltransferase  47.31 
 
 
393 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2051  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  48.98 
 
 
396 aa  369  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3469  acetyl-CoA acetyltransferase  48.34 
 
 
394 aa  370  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.753408 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>