More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2212 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_2212  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
262 aa  529  1e-149  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136101  normal  0.0104789 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2207  enoyl-CoA hydratase  44.87 
 
 
265 aa  230  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130556  hitchhiker  0.0060069 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.34 
 
 
260 aa  224  9e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.87 
 
 
260 aa  217  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  45.59 
 
 
260 aa  215  5.9999999999999996e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.13 
 
 
267 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.73 
 
 
260 aa  211  1e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.44 
 
 
258 aa  211  1e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.62 
 
 
258 aa  209  3e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.44 
 
 
260 aa  207  1e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.86 
 
 
258 aa  203  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1377  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  47.06 
 
 
260 aa  203  3e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  41.98 
 
 
258 aa  201  7e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1936  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  45.38 
 
 
260 aa  201  8e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  43.08 
 
 
259 aa  201  9.999999999999999e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.77 
 
 
260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.63 
 
 
259 aa  198  6e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.37 
 
 
258 aa  198  9e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1122  short chain enoyl-CoA hydratase  45.32 
 
 
262 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  42.15 
 
 
257 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  41.79 
 
 
260 aa  196  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  42.53 
 
 
257 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6902  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.7 
 
 
258 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.174698  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  43.63 
 
 
260 aa  195  5.000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.44 
 
 
255 aa  195  6e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.13 
 
 
256 aa  194  1e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.06 
 
 
261 aa  194  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  41.42 
 
 
260 aa  194  1e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  41.76 
 
 
260 aa  194  1e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1709  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.47 
 
 
256 aa  194  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.85 
 
 
261 aa  194  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.62 
 
 
261 aa  193  3e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2899  enoyl-CoA hydratase  41.76 
 
 
258 aa  193  3e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596096  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.36 
 
 
260 aa  192  5e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2850  enoyl-CoA hydratase  41.15 
 
 
258 aa  191  8e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000104318  normal  0.652493 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3005  short chain enoyl-CoA hydratase  42.97 
 
 
259 aa  191  9e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  42.31 
 
 
257 aa  191  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  42.08 
 
 
662 aa  191  1e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4369  enoyl-CoA hydratase  42.53 
 
 
257 aa  190  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0156166 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4387  enoyl-CoA hydratase  42.53 
 
 
257 aa  190  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4231  enoyl-CoA hydratase  42.53 
 
 
257 aa  190  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4156  enoyl-CoA hydratase  42.53 
 
 
257 aa  190  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0384  short chain enoyl-CoA hydratase  43.48 
 
 
251 aa  189  2.9999999999999997e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.09 
 
 
268 aa  189  2.9999999999999997e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0876  enoyl-CoA hydratase  42.91 
 
 
258 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1738  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.36 
 
 
259 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0269497 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04650  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  43.95 
 
 
278 aa  189  2.9999999999999997e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  42.15 
 
 
260 aa  189  4e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3574  enoyl-CoA hydratase  42.48 
 
 
257 aa  189  5.999999999999999e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000415637 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3485  enoyl-CoA hydratase  41.38 
 
 
258 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.00000000302611  hitchhiker  0.000530427 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1545  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.08 
 
 
258 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1462  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.41 
 
 
259 aa  188  5.999999999999999e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.23 
 
 
258 aa  188  8e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2866  short chain enoyl-CoA hydratase  40.77 
 
 
257 aa  188  9e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18512  normal  0.106284 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1899  enoyl-CoA hydratase  41.76 
 
 
258 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00000141088  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0474  enoyl-CoA hydratase  41.54 
 
 
258 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  unclonable  0.0000000000253276  normal  0.535209 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0544  enoyl-CoA hydratase  41.76 
 
 
258 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.0000000212345  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3563  enoyl-CoA hydratase  41.76 
 
 
258 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000000063446  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0632  enoyl-CoA hydratase  41.76 
 
 
258 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000040968  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0930  enoyl-CoA hydratase  41.76 
 
 
258 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000286464  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0882  short chain enoyl-CoA hydratase  45.08 
 
 
259 aa  187  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  40.98 
 
 
257 aa  187  1e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0449  enoyl-CoA hydratase  41.54 
 
 
258 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000595981  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.59 
 
 
260 aa  187  1e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4681  enoyl-CoA hydratase  42.31 
 
 
260 aa  187  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417656  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3571  enoyl-CoA hydratase  41.76 
 
 
264 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00545367  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.86 
 
 
259 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203643  normal  0.505075 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.51 
 
 
260 aa  187  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1276  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.92 
 
 
257 aa  187  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547187  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0471  enoyl-CoA hydratase  41 
 
 
258 aa  186  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000928124  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2662  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.25 
 
 
259 aa  187  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3030  short chain enoyl-CoA hydratase  40.6 
 
 
258 aa  187  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.38 
 
 
259 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  43.33 
 
 
258 aa  187  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.77 
 
 
266 aa  186  3e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  40.6 
 
 
257 aa  186  3e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  40.38 
 
 
257 aa  186  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  42.47 
 
 
662 aa  186  3e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3369  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.59 
 
 
262 aa  186  3e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186723  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2708  enoyl-CoA hydratase  40.39 
 
 
263 aa  186  4e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2687  enoyl-CoA hydratase  40.39 
 
 
263 aa  186  4e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.485301  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3544  enoyl-CoA hydratase  41.38 
 
 
258 aa  186  4e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.00000000000159011  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  41.31 
 
 
258 aa  186  4e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0516  enoyl-CoA hydratase  41 
 
 
258 aa  185  5e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000195576  normal  0.432666 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1036  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.23 
 
 
258 aa  185  5e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.86 
 
 
259 aa  186  5e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3584  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.62 
 
 
259 aa  185  6e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0453  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  42.08 
 
 
662 aa  185  7e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.840152  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  42.48 
 
 
256 aa  185  7e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.209168 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  39.31 
 
 
262 aa  185  7e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  42.86 
 
 
661 aa  185  8e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2036  enoyl-CoA hydratase  41 
 
 
257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.189819 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.38 
 
 
257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3030  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.15 
 
 
257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.045049 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3631  enoyl-CoA hydratase  41.76 
 
 
258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251765  normal  0.928843 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.37 
 
 
259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0661339  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3162  enoyl-CoA hydratase  40.77 
 
 
258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000276465  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2561  enoyl-CoA hydratase  41 
 
 
258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000238691  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  41.25 
 
 
258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0544  enoyl-CoA hydratase  41 
 
 
258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000181699  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>