More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2177 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  100 
 
 		 345 aa  712    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  36.74 
 
 		 353 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  36.74 
 
 		 353 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3232  hypothetical protein  32.88 
 
 		 323 aa  139  7.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.470904  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1348  methyltransferase type 11  31.14 
 
 		 286 aa  123  5e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.71095  hitchhiker  0.00964289 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  40.72 
 
 		 214 aa  122  8e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0456  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  32.29 
 
 		 672 aa  117  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0420  Methyltransferase type 11  27.94 
 
 		 335 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.849842 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2682  Methyltransferase type 12  28.52 
 
 		 358 aa  109  7.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.454648  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5520  Methyltransferase type 12  27 
 
 		 306 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0390  Methyltransferase type 11  29.52 
 
 		 267 aa  107  4e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2154  methyltransferase type 11  28.41 
 
 		 291 aa  100  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1806  methyltransferase type 11  28.52 
 
 		 310 aa  100  5e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0971  methyltransferase type 11  30.04 
 
 		 330 aa  99.4  8e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2304  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 		 317 aa  96.7  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000442527  normal  0.300878 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3803  Methyltransferase type 12  25.09 
 
 		 300 aa  95.5  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3058  methyltransferase type 12  28.3 
 
 		 318 aa  95.1  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2510  hypothetical protein  42.74 
 
 		 308 aa  94.4  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  37.42 
 
 		 222 aa  94  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2627  methyltransferase type 11  36.23 
 
 		 306 aa  93.2  6e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1111  Methyltransferase type 12  31.87 
 
 		 310 aa  88.6  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.100428  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0742  Methyltransferase type 12  32.47 
 
 		 275 aa  88.2  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  25.11 
 
 		 282 aa  87.4  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0355  methyltransferase type 12  25.77 
 
 		 342 aa  86.7  5e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3503  SAM-dependent methyltransferase  28.38 
 
 		 287 aa  86.7  6e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0311533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1074  methyltransferase type 11  32.11 
 
 		 436 aa  85.9  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.257037  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2732  hypothetical protein  34.56 
 
 		 236 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000422466  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3357  Methyltransferase type 11  32.53 
 
 		 211 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0142  methyltransferase type 12  26.59 
 
 		 309 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0836  Methyltransferase type 12  27.62 
 
 		 310 aa  84  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2963  methyltransferase type 12  33.77 
 
 		 303 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2979  WbbD domain protein  34.78 
 
 		 272 aa  81.3  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4412  methyltransferase type 11  26.41 
 
 		 303 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.033739  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2594  Methyltransferase type 11  34.78 
 
 		 272 aa  81.3  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2132  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 274 aa  81.3  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0835  Methyltransferase type 12  31.79 
 
 		 273 aa  80.9  0.00000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3735  Methyltransferase type 12  26.62 
 
 		 334 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14091  hypothetical protein  23.01 
 
 		 310 aa  80.1  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0863653  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1306  hypothetical protein  32.87 
 
 		 297 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.782095 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03350  hypothetical protein  24.14 
 
 		 285 aa  79.3  0.00000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3053  methyltransferase type 12  32.88 
 
 		 332 aa  79.3  0.00000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3983  methyltransferase type 11  31.31 
 
 		 293 aa  78.6  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.307607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  34.23 
 
 		 225 aa  79  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0233  Methyltransferase type 12  24.74 
 
 		 305 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4080  methyltransferase type 12  30.56 
 
 		 274 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1513  hypothetical protein  30 
 
 		 308 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0813678  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4283  methyltransferase type 11  35.12 
 
 		 257 aa  78.2  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.706274  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0838  Methyltransferase type 12  26.01 
 
 		 316 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.202995  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  31.47 
 
 		 310 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  31.52 
 
 		 238 aa  77.4  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6261  Methyltransferase type 12  24.91 
 
 		 298 aa  77.8  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1880  Methyltransferase type 11  29.52 
 
 		 240 aa  76.6  0.0000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0757  methyltransferase type 11  38.32 
 
 		 442 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4934  Methyltransferase type 11  26.29 
 
 		 332 aa  75.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.310878 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1903  hypothetical protein  29.38 
 
 		 376 aa  75.9  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.298907  normal  0.396986 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  36.27 
 
 		 196 aa  75.5  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  32.46 
 
 		 258 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3576  Methyltransferase type 11  37.04 
 
 		 457 aa  74.7  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3949  methyltransferase type 11  30.82 
 
 		 513 aa  74.7  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4598  Methyltransferase type 12  34.38 
 
 		 281 aa  75.1  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1285  hypothetical protein  34.42 
 
 		 249 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0768  methyltransferase type 11  38.32 
 
 		 442 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  31.41 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1350  methyltransferase type 12  32.88 
 
 		 1046 aa  74.3  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.041094  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3267  hypothetical protein  32.26 
 
 		 303 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0734  hypothetical protein  30.16 
 
 		 330 aa  73.6  0.000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.69115  normal  0.886501 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2886  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  24.16 
 
 		 277 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00412088 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2007  methyltransferase type 11  29.05 
 
 		 239 aa  73.6  0.000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1232  glycosyl transferase family protein  34.25 
 
 		 1037 aa  73.2  0.000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3910  hypothetical protein  29.37 
 
 		 305 aa  73.2  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230808  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21081  hypothetical protein  35.9 
 
 		 373 aa  72.8  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.781663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1324  methyltransferase type 11  24 
 
 		 248 aa  72.4  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.386033  hitchhiker  0.000000000822833 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1780  mannosyltransferase, putative  33.09 
 
 		 1635 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.731336  decreased coverage  0.0078788 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  39.05 
 
 		 239 aa  71.6  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20390  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  34.26 
 
 		 245 aa  72  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0797828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4266  methyltransferase type 11  34.51 
 
 		 256 aa  71.6  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.985163  normal  0.26538 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  30.59 
 
 		 711 aa  70.9  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4822  Methyltransferase type 11  34.74 
 
 		 233 aa  70.9  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4748  hypothetical protein  29.07 
 
 		 273 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000104492 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4696  methyltransferase type 11  32.26 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.219462 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0453  hypothetical protein  29.93 
 
 		 305 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3846  methyltransferase type 11  29.15 
 
 		 351 aa  70.1  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0403066  normal  0.436715 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1274  Methyltransferase type 11  29.94 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.572437 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4431  methyltransferase type 11  36.19 
 
 		 295 aa  69.7  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4657  Methyltransferase type 11  32.14 
 
 		 624 aa  69.7  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.109696 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1613  Methyltransferase type 12  29.41 
 
 		 311 aa  69.3  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.959863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.55 
 
 		 250 aa  69.3  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1006  Methyltransferase type 11  27.89 
 
 		 242 aa  69.3  0.00000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00471985  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3261  Methyltransferase type 11  36.75 
 
 		 264 aa  69.3  0.00000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0235  Methyltransferase type 11  41.18 
 
 		 242 aa  68.9  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4588  Methyltransferase type 12  28.24 
 
 		 457 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28526  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0834  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.59 
 
 		 237 aa  68.9  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293263  normal  0.0185746 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  32.14 
 
 		 243 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  32.14 
 
 		 243 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  32.14 
 
 		 243 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0673  methyltransferase type 11  35.2 
 
 		 253 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 281 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 710 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4779  Methyltransferase type 11  31.82 
 
 		 264 aa  68.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766265 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0484  putative methyltransferase  32 
 
 		 240 aa  68.2  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>