More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2112 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_2112  HAD family hydrolase  100 
 
 
239 aa  470  1e-132  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  35.55 
 
 
209 aa  95.9  4e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2152  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.09 
 
 
225 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0261  HAD family hydrolase  30.52 
 
 
217 aa  90.5  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000130583  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  32.21 
 
 
227 aa  89.7  4e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2060  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.64 
 
 
225 aa  88.6  7e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750609  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1780  HAD family hydrolase  32.88 
 
 
225 aa  87.4  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.587654  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0268  phosphoglycolate phosphatase  29.86 
 
 
228 aa  86.7  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0557534  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4527  phosphoglycolate phosphatase  30.32 
 
 
216 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1985  phosphoglycolate phosphatase  30.29 
 
 
223 aa  84.3  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.554471  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2310  HAD family hydrolase  33.65 
 
 
221 aa  84  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.523408  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  28.78 
 
 
235 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14840  HAD-superfamily hydrolase  34.15 
 
 
220 aa  83.2  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.770171  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0937  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.21 
 
 
219 aa  82.8  0.000000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3168  pyrophosphatase PpaX  30.23 
 
 
222 aa  82.4  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3772  2-deoxyglucose-6-phosphatase  26.7 
 
 
218 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0382  phosphoglycolate phosphatase  28.85 
 
 
229 aa  82  0.000000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  31.96 
 
 
227 aa  82  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3807  HAD family hydrolase  31.6 
 
 
224 aa  81.6  0.000000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.118188  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3839  HAD-superfamily hydrolase  33.33 
 
 
220 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0865807  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  33.49 
 
 
226 aa  81.3  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2110  phosphoglycolate phosphatase  29.22 
 
 
225 aa  80.5  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.782136  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4839  AHBA synthesis associated protein  33.04 
 
 
237 aa  80.1  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.098143  normal  0.0397379 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1944  pyrophosphatase PpaX  28.71 
 
 
214 aa  80.1  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1640  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
220 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.284861 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3425  2-deoxyglucose-6-phosphatase  31.55 
 
 
223 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000919178  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1907  HAD superfamily hydrolase  30.66 
 
 
224 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.00000027861 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0431  3-amino-5-hydroxybenoic acid synthesis related  32.87 
 
 
263 aa  79.3  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  32.2 
 
 
252 aa  79  0.00000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1764  phosphoglycolate phosphatase  29.17 
 
 
223 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  30.9 
 
 
252 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  31.78 
 
 
252 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  31.78 
 
 
252 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1355  phosphoglycolate phosphatase  29.59 
 
 
223 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  32.2 
 
 
252 aa  77.8  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2984  pyrophosphatase PpaX  29.3 
 
 
215 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3950  phosphoglycolate phosphatase  29.17 
 
 
223 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00428214  normal  0.0156244 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2232  pyrophosphatase PpaX  29.02 
 
 
214 aa  77.8  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  29.46 
 
 
229 aa  78.2  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  31.78 
 
 
252 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  30.96 
 
 
219 aa  77.4  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  34.03 
 
 
226 aa  77  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1371  phosphoglycolate phosphatase  29.38 
 
 
223 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0414  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.9 
 
 
217 aa  77  0.0000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0670  beta-phosphoglucomutase  32.11 
 
 
207 aa  77  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.922957  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  28.29 
 
 
235 aa  77  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1621  HAD family hydrolase  33.17 
 
 
231 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0638141  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1483  HAD family hydrolase  29.72 
 
 
224 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0762089  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1741  phosphoglycolate phosphatase  31.82 
 
 
223 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1661  AHBA synthesis associated protein  32.56 
 
 
214 aa  76.6  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49792 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2229  phosphoglycolate phosphatase  29.25 
 
 
227 aa  76.6  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40738  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2370  phosphoglycolate phosphatase  30.84 
 
 
227 aa  77  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2111  phosphoglycolate phosphatase  32.43 
 
 
228 aa  76.6  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2449  HAD family hydrolase  30.62 
 
 
217 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0190416  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0174  HAD family hydrolase  34.83 
 
 
215 aa  76.6  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3218  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.89 
 
 
234 aa  76.6  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03237  phosphoglycolate phosphatase  32.2 
 
 
252 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  32.2 
 
 
252 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03189  hypothetical protein  32.2 
 
 
252 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0927  HAD family hydrolase  29.79 
 
 
210 aa  75.9  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1899  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32 
 
 
212 aa  75.9  0.0000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000244384  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1957  phosphoglycolate phosphatase  29.53 
 
 
223 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2479  phosphoglycolate phosphatase  32.02 
 
 
228 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0669626  normal  0.547058 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0481  HAD family hydrolase  26.73 
 
 
231 aa  75.9  0.0000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.158536  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0432  2-deoxyglucose-6-phosphatase  28.8 
 
 
218 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000498152  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3850  phosphoglycolate phosphatase  32.2 
 
 
252 aa  75.5  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3681  phosphoglycolate phosphatase  32.2 
 
 
252 aa  75.5  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123155  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3754  phosphoglycolate phosphatase  32.2 
 
 
252 aa  75.5  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3898  phosphoglycolate phosphatase  29.72 
 
 
221 aa  75.5  0.0000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.67393 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3679  phosphoglycolate phosphatase  32.2 
 
 
252 aa  75.5  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966867  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1518  HAD family hydrolase  30.77 
 
 
226 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0020263  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3788  phosphoglycolate phosphatase  32.2 
 
 
252 aa  75.1  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00378  phosphoglycolate phosphatase  32.98 
 
 
250 aa  75.1  0.0000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.590108  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2034  HAD family hydrolase  31.03 
 
 
216 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.645104  normal  0.0672621 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4525  phosphatase  26.06 
 
 
208 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1950  HAD family hydrolase  30.14 
 
 
228 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0253028  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2859  phosphoglycolate phosphatase  31.16 
 
 
256 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0440  phosphoglycolate phosphatase  30 
 
 
251 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3798  phosphoglycolate phosphatase  30 
 
 
253 aa  74.7  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3482  phosphoglycolate phosphatase  28.35 
 
 
226 aa  73.9  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824519  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2469  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.31 
 
 
224 aa  73.9  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.618161  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3992  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.19 
 
 
218 aa  74.3  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.177922  normal  0.23268 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  28.7 
 
 
219 aa  73.6  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.187107 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  29.06 
 
 
296 aa  74.3  0.000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0211  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.29 
 
 
213 aa  73.9  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.531728  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2097  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.6 
 
 
221 aa  73.6  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284323  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3651  phosphoglycolate phosphatase  29.8 
 
 
223 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1749  HAD family hydrolase  26.43 
 
 
227 aa  73.6  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.109928  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3926  2-deoxyglucose-6-phosphatase  27.23 
 
 
219 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000238408  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  27.78 
 
 
225 aa  73.2  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3593  2-deoxyglucose-6-phosphatase  28.27 
 
 
218 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000011766  normal  0.672534 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  30.73 
 
 
216 aa  72.8  0.000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4047  2-deoxyglucose-6-phosphatase  27.23 
 
 
219 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000965281  normal  0.234971 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1566  HAD family hydrolase  30.73 
 
 
216 aa  72.8  0.000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.13 
 
 
222 aa  72.8  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3906  2-deoxyglucose-6-phosphatase  27.23 
 
 
219 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000443869  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0220  phosphoglycolate phosphatase  26.67 
 
 
231 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2908  phosphoglycolate phosphatase  30.18 
 
 
242 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0332  hypothetical protein  29.57 
 
 
223 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23210  phosphoglycolate phosphatase  28.5 
 
 
226 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0343323  hitchhiker  0.00416895 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>