More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2106 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_2106  butyrate kinase  100 
 
 
359 aa  733    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2128  butyrate kinase  82.2 
 
 
362 aa  615  1e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2844  butyrate kinase  77.93 
 
 
358 aa  584  1e-166  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2307  butyrate kinase  51.85 
 
 
370 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0939  butyrate kinase  51.42 
 
 
355 aa  377  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0263  butyrate kinase  53.85 
 
 
370 aa  373  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4236  butyrate kinase  48.01 
 
 
367 aa  365  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3916  butyrate kinase  48.27 
 
 
367 aa  365  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0615579  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2858  butyrate kinase  48.27 
 
 
367 aa  367  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4069  butyrate kinase  48.27 
 
 
367 aa  364  1e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3907  butyrate kinase  48.27 
 
 
367 aa  364  1e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4386  butyrate kinase  48.27 
 
 
367 aa  364  1e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4184  butyrate kinase  48.27 
 
 
367 aa  364  1e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000389222 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0960  butyrate kinase  48.55 
 
 
367 aa  363  2e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0659702 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4294  butyrate kinase  47.69 
 
 
367 aa  362  4e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4005  butyrate kinase  48.27 
 
 
367 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.140021  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4274  butyrate kinase  47.69 
 
 
367 aa  359  4e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2656  butyrate kinase  47.01 
 
 
356 aa  349  3e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1680  butyrate kinase  46.93 
 
 
358 aa  349  3e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00170652  normal  0.0185756 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1109  butyrate kinase  48.15 
 
 
361 aa  348  8e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2342  butyrate kinase  46.72 
 
 
356 aa  348  1e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0107  butyrate kinase  49.85 
 
 
363 aa  345  7e-94  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.215976  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2358  butyrate kinase  49.86 
 
 
362 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0714814  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1472  butyrate kinase  48.3 
 
 
355 aa  343  4e-93  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01633  butyrate kinase  51.16 
 
 
360 aa  341  1e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0108  butyrate kinase  47.73 
 
 
361 aa  335  7e-91  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.835306  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2348  butyrate kinase  45.87 
 
 
352 aa  334  1e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.311163  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3152  butyrate kinase  47.29 
 
 
357 aa  334  1e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0590  butyrate kinase  47.74 
 
 
361 aa  331  1e-89  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1069  butyrate kinase  47.03 
 
 
375 aa  327  3e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2852  butyrate kinase  48.3 
 
 
361 aa  322  5e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0109  butyrate kinase  47.01 
 
 
356 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06760  butyrate kinase  45.89 
 
 
356 aa  320  3e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0936  butyrate kinase  46.02 
 
 
353 aa  316  3e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0106  butyrate kinase  45.04 
 
 
357 aa  312  6.999999999999999e-84  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3544  butyrate kinase  44.73 
 
 
362 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.505108  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2700  butyrate kinase  44.16 
 
 
352 aa  306  3e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21870  butyrate kinase  44.99 
 
 
359 aa  300  2e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1366  butyrate kinase  44.05 
 
 
370 aa  290  2e-77  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1470  butyrate kinase  43.1 
 
 
362 aa  285  1.0000000000000001e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1041  butyrate kinase  42.45 
 
 
357 aa  268  1e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.496289  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1071  butyrate kinase  41.88 
 
 
357 aa  265  1e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2626  butyrate kinase  37.38 
 
 
453 aa  262  8e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0591  butyrate kinase  40.97 
 
 
362 aa  257  2e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0042  butyrate kinase  42.61 
 
 
368 aa  253  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.36526  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3128  butyrate kinase  39.01 
 
 
372 aa  248  8e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0058  butyrate kinase  41.76 
 
 
376 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.870551  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0454  butyrate kinase  40.23 
 
 
359 aa  239  4e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0046  butyrate kinase  42.33 
 
 
376 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.248068  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2330  butyrate kinase  37.46 
 
 
372 aa  231  2e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108416 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0045  butyrate kinase  37.61 
 
 
366 aa  217  2e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.90675 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1383  butyrate kinase  32.49 
 
 
356 aa  150  3e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0000142085  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0258  Butyrate kinase  35.95 
 
 
333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2656  acetate kinase  31.9 
 
 
422 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6196  acetate kinase  30.77 
 
 
380 aa  73.6  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1936  acetate kinase  27.69 
 
 
404 aa  73.2  0.000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3242  acetate kinase  31.65 
 
 
402 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.697897  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1473  acetate kinase  32.08 
 
 
411 aa  71.2  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.206902 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1158  acetate kinase  32.28 
 
 
398 aa  71.2  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00331056  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1318  acetate kinase  34.18 
 
 
396 aa  70.9  0.00000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0343  acetate kinase  31.01 
 
 
402 aa  71.2  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.441374  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0104  acetate kinase  27 
 
 
397 aa  69.7  0.00000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.66342  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0712  acetate kinase  33.54 
 
 
396 aa  69.7  0.00000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0788  acetate kinase  32.12 
 
 
396 aa  68.9  0.0000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.119296  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6116  acetate kinase  28.23 
 
 
583 aa  67.4  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1865  acetate kinase  27.54 
 
 
404 aa  67.4  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1049  acetate kinase  32.28 
 
 
401 aa  67.8  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7535  acetate kinase  31.11 
 
 
381 aa  66.6  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.315075  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0647  acetate kinase  25.23 
 
 
401 aa  65.5  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0812  acetate kinase  29.41 
 
 
399 aa  65.5  0.000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1170  acetate kinase  31.45 
 
 
397 aa  64.7  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.185662 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2303  acetate kinase  30.33 
 
 
398 aa  64.7  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4397  acetate kinase  30.97 
 
 
398 aa  64.3  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2559  acetate kinase  31.84 
 
 
400 aa  63.9  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.139439  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1948  acetate kinase  29.07 
 
 
589 aa  63.9  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0642  acetate kinase  26.52 
 
 
399 aa  63.9  0.000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.376841  normal  0.374072 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1034  acetate kinase  31.65 
 
 
402 aa  63.9  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00869824  normal  0.811028 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7970  acetate kinase  33.11 
 
 
378 aa  63.5  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0580  acetate kinase  27.4 
 
 
399 aa  62  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1027  acetate kinase  27.96 
 
 
400 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.529199  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0641  acetate kinase  26.24 
 
 
405 aa  62  0.00000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00773095  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1044  acetate kinase  24.2 
 
 
404 aa  62.4  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1346  acetate kinase  25.53 
 
 
388 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0429911  normal  0.010894 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0354  acetate kinase  28.66 
 
 
405 aa  61.6  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.43954  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0640  acetate kinase  28.3 
 
 
394 aa  61.2  0.00000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2921  acetate kinase  27.22 
 
 
772 aa  60.8  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.602994 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2207  acetate kinase  25.76 
 
 
408 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.297404 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0674  acetate kinase  28.57 
 
 
403 aa  60.5  0.00000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0650  acetate kinase  28.57 
 
 
403 aa  60.5  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.276735  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5272  acetate kinase  25 
 
 
386 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.666429 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0720  acetate kinase  31.07 
 
 
452 aa  60.1  0.00000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0988409  hitchhiker  0.0000000373865 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1105  acetate kinase  25.33 
 
 
398 aa  60.1  0.00000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000219398  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1272  acetate kinase  31.01 
 
 
362 aa  60.1  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0858677  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10210  acetate kinase  29.94 
 
 
398 aa  60.1  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000154307  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5046  acetate kinase  26.42 
 
 
398 aa  59.7  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1081  acetate kinase  28.75 
 
 
398 aa  59.3  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.347293 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6386  acetate kinase  26.79 
 
 
394 aa  58.9  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1162  acetate kinase  26.04 
 
 
399 aa  58.9  0.0000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0490  acetate kinase  25 
 
 
405 aa  58.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.803694  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2780  acetate kinase  23.62 
 
 
400 aa  58.2  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0653743  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>