More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2070 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3229  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  60.57 
 
 		 661 aa  850    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1382  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  62.99 
 
 		 722 aa  870    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1714  hypothetical protein  62.75 
 
 		 671 aa  885    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2070  hypothetical protein  100 
 
 		 663 aa  1370    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000208921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2831  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  63.14 
 
 		 714 aa  870    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2264  hypothetical protein  60.82 
 
 		 661 aa  860    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.968326  hitchhiker  0.00000860072 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3039  hypothetical protein  62.99 
 
 		 661 aa  894    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1463  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  77.98 
 
 		 662 aa  1078    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2517  hypothetical protein  55.82 
 
 		 662 aa  767    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1600  hypothetical protein  61.63 
 
 		 661 aa  853    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2791  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  76.62 
 
 		 662 aa  1060    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.589243 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1035  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  61.18 
 
 		 661 aa  841    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2860  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41.83 
 
 		 699 aa  556  1e-157  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4528  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  39.69 
 
 		 694 aa  522  1e-146  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3646  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  38.59 
 
 		 694 aa  504  1e-141  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1856  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  39.97 
 
 		 686 aa  493  9.999999999999999e-139  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2621  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  38.79 
 
 		 713 aa  468  9.999999999999999e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0809  hypothetical protein  36.33 
 
 		 727 aa  454  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0335326 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4458  hypothetical protein  36.09 
 
 		 752 aa  451  1e-125  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000771252  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4457  hypothetical protein  36.19 
 
 		 730 aa  447  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458302  normal  0.390978 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2065  hypothetical protein  36.28 
 
 		 658 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.810314 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1777  hypothetical protein  37.93 
 
 		 678 aa  438  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0685  hypothetical protein  36.21 
 
 		 659 aa  437  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.808103  normal  0.989456 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0698  putative iron-sulfur-binding reductase  37.41 
 
 		 714 aa  426  1e-118  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0314835  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1213  hypothetical protein  36.17 
 
 		 661 aa  421  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1700  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.31 
 
 		 683 aa  422  1e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.102017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2414  hypothetical protein  36.1 
 
 		 652 aa  414  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1468  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.43 
 
 		 656 aa  409  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2785  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.58 
 
 		 656 aa  409  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0009  hypothetical protein  35.87 
 
 		 678 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2255  hypothetical protein  37.97 
 
 		 655 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000010012  hitchhiker  0.0000000000013579 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2087  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.71 
 
 		 663 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.371437  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2795  iron-sulfur cluster-binding protein  37.74 
 
 		 661 aa  405  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.623048  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0570  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.29 
 
 		 655 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0837064  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5959  hypothetical protein  36.21 
 
 		 720 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0717248 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2131  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.82 
 
 		 663 aa  397  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000140494 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0008  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.56 
 
 		 711 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.787604  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2925  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.25 
 
 		 658 aa  396  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2714  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.17 
 
 		 664 aa  399  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.793769 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0008  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.1 
 
 		 711 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0008  hypothetical protein  35.65 
 
 		 711 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1359  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.79 
 
 		 658 aa  391  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.548906  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1502  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.36 
 
 		 664 aa  387  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3866  hypothetical protein  33.76 
 
 		 703 aa  384  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00245399  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5523  ferredoxin, 4Fe-4S  34.52 
 
 		 703 aa  383  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5476  ferredoxin, 4Fe-4S  34.52 
 
 		 703 aa  385  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5194  ferredoxin, 4Fe-4S  34.09 
 
 		 703 aa  382  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0190376  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5029  ferredoxin, 4Fe-4S  34.24 
 
 		 703 aa  384  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5045  ferredoxin, 4Fe-4S  34.24 
 
 		 703 aa  384  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.047294  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5468  ferredoxin, 4Fe-4S  34.52 
 
 		 703 aa  384  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000379951  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5590  ferredoxin, 4Fe-4S  34.09 
 
 		 703 aa  382  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5438  ferredoxin, 4Fe-4S  34.24 
 
 		 703 aa  384  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0164712 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0918  hypothetical protein  36.6 
 
 		 720 aa  379  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.534839 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5143  hypothetical protein  33.81 
 
 		 703 aa  379  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3454  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.51 
 
 		 698 aa  379  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3345  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.43 
 
 		 699 aa  376  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000110964  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4350  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  34.78 
 
 		 743 aa  371  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0071  hypothetical protein  33.93 
 
 		 727 aa  368  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0051  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  37.12 
 
 		 676 aa  367  1e-100  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5484  ferredoxin, 4Fe-4S  34.33 
 
 		 629 aa  363  6e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00120718  hitchhiker  1.1586099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2426  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.3 
 
 		 679 aa  359  9e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2113  hypothetical protein  33.28 
 
 		 683 aa  351  3e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.177792 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3765  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  31.81 
 
 		 712 aa  350  7e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0441363  normal  0.184331 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2367  hypothetical protein  33.94 
 
 		 683 aa  350  7e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9137  hypothetical protein  34.87 
 
 		 716 aa  349  1e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.793292 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0874  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  32.25 
 
 		 989 aa  347  3e-94  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  normal  0.996162 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3407  hypothetical protein  33.1 
 
 		 699 aa  345  1e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2474  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.29 
 
 		 721 aa  342  1e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1707  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.85 
 
 		 737 aa  342  2e-92  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.121804  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0195  putative iron-sulphur-binding reductase  32.38 
 
 		 716 aa  342  2e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0242  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.08 
 
 		 717 aa  342  2e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1527  hypothetical protein  33.73 
 
 		 654 aa  340  5.9999999999999996e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.583345 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1417  hypothetical protein  33.48 
 
 		 688 aa  339  8e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000449737  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10343  iron-sulfur-binding reductase  34.26 
 
 		 882 aa  339  9.999999999999999e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.557854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3824  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.5 
 
 		 728 aa  338  9.999999999999999e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.676113  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0042  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.33 
 
 		 738 aa  339  9.999999999999999e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5262  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.55 
 
 		 737 aa  338  2.9999999999999997e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0971  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.6 
 
 		 723 aa  337  5e-91  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0054  hypothetical protein  31.39 
 
 		 732 aa  332  1e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0451564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0059  hypothetical protein  32.38 
 
 		 718 aa  332  1e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.149051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0238  hypothetical protein  31.82 
 
 		 739 aa  330  4e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.855121  normal  0.712535 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4404  hypothetical protein  32.35 
 
 		 1033 aa  330  7e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326408  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0442  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  33.01 
 
 		 1046 aa  329  9e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0452  hypothetical protein  33.01 
 
 		 1046 aa  329  9e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.506631  normal  0.0226595 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5473  CoB--CoM heterodisulfide reductase  31.34 
 
 		 737 aa  329  1.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38640  Fe-S oxidoreductase  33.62 
 
 		 762 aa  328  1.0000000000000001e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0429  hypothetical protein  33.01 
 
 		 1042 aa  329  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.811487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0278  hypothetical protein  32.7 
 
 		 1044 aa  328  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0501  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  31.68 
 
 		 724 aa  328  3e-88  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.17587  normal  0.555543 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26190  Fe-S oxidoreductase  40.27 
 
 		 1388 aa  327  5e-88  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0461  hypothetical protein  33.58 
 
 		 703 aa  326  1e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.667458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0619  hypothetical protein  31.57 
 
 		 1027 aa  325  2e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.321206  normal  0.108108 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2267  hypothetical protein  32.57 
 
 		 692 aa  324  3e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00913496  hitchhiker  0.0000724137 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0754  hypothetical protein  33.7 
 
 		 643 aa  323  8e-87  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.39993 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0261  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  31.72 
 
 		 748 aa  322  1.9999999999999998e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.618986  normal  0.510874 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0207  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  40.84 
 
 		 774 aa  320  5e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.987392 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0933  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.17 
 
 		 695 aa  317  3e-85  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.271519  normal  0.676616 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4809  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  31.36 
 
 		 762 aa  315  9.999999999999999e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6953  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  38.83 
 
 		 758 aa  313  5.999999999999999e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1708  CoB--CoM heterodisulfide reductase  31.11 
 
 		 641 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>