239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2060 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_2060  fusaric acid resistance protein region  100 
 
 
635 aa  1258    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.065197  normal  0.166692 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2360  Fusaric acid resistance protein conserved region  48.48 
 
 
639 aa  514  1e-144  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1858  Fusaric acid resistance protein conserved region  47.57 
 
 
641 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5715  fusaric acid resistance protein region  30.45 
 
 
661 aa  219  8.999999999999998e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0277565 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1306  fusaric acid resistance protein region  32.64 
 
 
644 aa  217  5e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.389506  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5952  membrane protein  29.16 
 
 
623 aa  192  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1263  fusaric acid resistance protein  29.22 
 
 
676 aa  171  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16106  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0233  membrane protein-like  28.17 
 
 
653 aa  171  4e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5724  fusaric acid resistance protein region  28.72 
 
 
673 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.367852 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3787  fusaric acid resistance protein region  28.72 
 
 
673 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376332  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4581  fusaric acid resistance protein region  28.72 
 
 
673 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0331097  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4008  fusaric acid resistance protein region  28.08 
 
 
676 aa  152  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3193  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.63 
 
 
699 aa  148  3e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.624391  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2071  hypothetical protein  30.25 
 
 
493 aa  144  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.555824 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1652  Fusaric acid resistance protein conserved region  24.3 
 
 
653 aa  138  3.0000000000000003e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.421943  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1167  fusaric acid resistance protein region  27.94 
 
 
676 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240521 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4267  fusaric acid resistance protein region  27.64 
 
 
662 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6856  fusaric acid resistance protein  25.34 
 
 
700 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21280  hypothetical protein  26.8 
 
 
664 aa  120  9e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2626  fusaric acid resistance domain-containing protein  27.72 
 
 
733 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.215952  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2911  hypothetical protein  22.38 
 
 
726 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5689  hypothetical protein  24.77 
 
 
691 aa  118  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.33226  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1150  fusaric acid resistance protein region  27.57 
 
 
662 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0139844  normal  0.271992 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1490  fusaric acid resistance protein region  27.88 
 
 
662 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.205086  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3001  fusaric acid resistance protein region  27.11 
 
 
697 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1992  fusaric acid resistance protein region  26.74 
 
 
702 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.355593  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4798  Fusaric acid resistance protein conserved region  23.46 
 
 
722 aa  115  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0857117  hitchhiker  0.0000430951 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1184  fusaric acid resistance protein region  28.12 
 
 
662 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.476236  normal  0.23816 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4155  hypothetical protein  26.05 
 
 
672 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0306653  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0760  hypothetical protein  28.31 
 
 
698 aa  111  4.0000000000000004e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.183091  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4470  fusaric acid resistance protein region  39.88 
 
 
676 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435927  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1867  fusaric acid resistance protein region  26.13 
 
 
733 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00213786 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2164  Fusaric acid resistance protein conserved region  27.37 
 
 
670 aa  111  5e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1677  fusaric acid resistance domain-containing protein  26.97 
 
 
733 aa  111  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0934  fusaric acid resistance protein, putative  26.97 
 
 
733 aa  110  6e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1467  putative fusaric acid resistance protein  26.97 
 
 
733 aa  110  6e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0414  putative fusaric acid resistance protein  26.97 
 
 
733 aa  110  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.800995  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1699  putative fusaric acid resistance protein  26.97 
 
 
733 aa  110  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.143561  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0748  putative fusaric acid resistance protein  26.97 
 
 
733 aa  110  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1853  fusaric acid resistance protein, putative  26.97 
 
 
733 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4316  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.68 
 
 
672 aa  110  8.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.888384  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4011  Fusaric acid resistance protein conserved region  30.11 
 
 
679 aa  110  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0926911 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1952  fusaric acid resistance protein region  27.27 
 
 
704 aa  109  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4864  fusaric acid resistance protein region  28.78 
 
 
679 aa  108  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.436364  normal  0.382045 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2253  Fusaric acid resistance protein conserved region  27.21 
 
 
653 aa  107  4e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1818  hypothetical protein  26.54 
 
 
664 aa  108  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0240  Fusaric acid resistance protein conserved region  28.33 
 
 
680 aa  107  9e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.182295 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0867  Fusaric acid resistance protein conserved region  28.93 
 
 
692 aa  106  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0171  fusaric acid resistance protein region  25.35 
 
 
687 aa  105  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1345  AraE family aromatic acid exporter  24.46 
 
 
736 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3343  Fusaric acid resistance protein conserved region  25.49 
 
 
688 aa  104  4e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1583  fusaric acid resistance protein region  23.61 
 
 
744 aa  103  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.434957  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2583  fusaric acid resistance protein region  23.46 
 
 
727 aa  103  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2682  fusaric acid resistance protein region  23.45 
 
 
691 aa  102  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2636  Fusaric acid resistance protein conserved region  23.24 
 
 
741 aa  102  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1796  fusaric acid resistance protein region  26.97 
 
 
625 aa  102  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00451003  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0201  fusaric acid resistance protein region  27.51 
 
 
695 aa  101  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1401  fusaric acid resistance protein region  24.63 
 
 
714 aa  101  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.855004 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4083  fusaric acid resistance protein region  26.72 
 
 
682 aa  100  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4593  fusaric acid resistance protein  27.3 
 
 
734 aa  100  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131682  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1808  Fusaric acid resistance protein conserved region  24.89 
 
 
742 aa  99.4  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0176  fusaric acid resistance protein region  26.14 
 
 
695 aa  98.2  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.314543  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1330  fusaric acid resistance protein region  27.91 
 
 
733 aa  97.8  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1369  fusaric acid resistance protein region  26.83 
 
 
733 aa  97.4  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.205794  normal  0.721238 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1426  fusaric acid resistance protein region  27.72 
 
 
734 aa  97.4  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0966  fusaric acid resistance protein region  27.83 
 
 
734 aa  97.4  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.499354  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1448  fusaric acid resistance protein region  27.83 
 
 
734 aa  97.4  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0197  fusaric acid resistance protein region  26.14 
 
 
695 aa  97.1  8e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0487942  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5051  fusaric acid resistance protein region  27.37 
 
 
695 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3618  hypothetical protein  23.1 
 
 
688 aa  96.3  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.94953  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2983  Fusaric acid resistance protein conserved region  24.25 
 
 
697 aa  95.9  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33190  hypothetical protein  38 
 
 
724 aa  94.7  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014137 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2782  Fusaric acid resistance protein conserved region  23.02 
 
 
739 aa  95.1  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.747937 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2821  hypothetical protein  37.33 
 
 
724 aa  93.6  9e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.596664  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4793  putative inner membrane efflux transporter  25.42 
 
 
659 aa  93.2  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.310622  normal  0.638285 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3378  fusaric acid resistance protein region  23.61 
 
 
695 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.926577  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2211  fusaric acid resistance protein region  22.46 
 
 
670 aa  92.8  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0710968  hitchhiker  0.000740189 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0485  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  26.71 
 
 
651 aa  92  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0421  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  26.71 
 
 
651 aa  92  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48340  hypothetical protein  27.91 
 
 
679 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00973423  normal  0.112211 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1175  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  26.71 
 
 
651 aa  92  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193331 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4582  fusaric acid resistance protein region  25.41 
 
 
725 aa  91.3  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0691108  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1264  fusaric acid resistance protein region  25.41 
 
 
725 aa  90.1  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4459  fusaric acid resistance protein region  25.41 
 
 
725 aa  90.1  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1250  hypothetical protein  25.48 
 
 
690 aa  89.4  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04000  Fusaric acid resistance domain protein  24.67 
 
 
725 aa  89  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.302401  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0595  fusaric acid resistance domain-containing protein  37.33 
 
 
745 aa  87.8  6e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2328  fusaric acid resistance domain-containing protein  37.33 
 
 
745 aa  87.8  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0873  fusaric acid resistance domain-containing protein  37.33 
 
 
745 aa  87.8  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1840  fusaric acid resistance domain-containing protein  37.33 
 
 
745 aa  87.8  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.868681  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1110  putative fusaric acid resistance protein  37.33 
 
 
745 aa  87.4  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.853894  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1024  putative fusaric acid resistance protein  37.33 
 
 
745 aa  87.4  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0867  fusaric acid resistance protein region  25 
 
 
725 aa  87.4  8e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0939  fusaric acid resistance protein region  23.11 
 
 
730 aa  87  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1292  fusaric acid resistance protein region  24.3 
 
 
681 aa  86.7  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.944306 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3501  fusaric acid resistance protein region  26.78 
 
 
639 aa  87  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0466  Fusaric acid resistance protein conserved region  25.61 
 
 
655 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3429  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  25.61 
 
 
655 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5075  fusaric acid resistance protein region  35.86 
 
 
726 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0750969  normal  0.788772 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3536  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  25.61 
 
 
655 aa  85.9  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>