64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2049 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_2049  hypothetical protein  100 
 
 
433 aa  868    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000101437  hitchhiker  0.0000000146402 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1997  PDZ domain-containing protein  70.86 
 
 
433 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0347733  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1774  hypothetical protein  67.21 
 
 
430 aa  600  1e-170  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0164491  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2966  hypothetical protein  63.64 
 
 
436 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0640841  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3279  protein of unknown function DUF512  66.13 
 
 
432 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0981  protein of unknown function DUF512  65.43 
 
 
432 aa  561  1e-158  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000360347  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0990  protein of unknown function DUF512  56.31 
 
 
444 aa  475  1e-133  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000932101  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1984  hypothetical protein  41.59 
 
 
438 aa  376  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1159  hypothetical protein  45.22 
 
 
439 aa  372  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000801932  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1631  protein of unknown function DUF512  42.01 
 
 
454 aa  362  6e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00530205 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1173  hypothetical protein  45.27 
 
 
451 aa  357  1.9999999999999998e-97  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.734459  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2132  protein of unknown function DUF512  41.78 
 
 
438 aa  355  8.999999999999999e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00526746  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2391  hypothetical protein  42.06 
 
 
450 aa  353  2.9999999999999997e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000589442  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1025  hypothetical protein  40.65 
 
 
445 aa  348  1e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0603945  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1883  FeS-containing oxidoreductase  43.72 
 
 
451 aa  348  1e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.64586  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1323  hypothetical protein  45.73 
 
 
443 aa  347  3e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.106789 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2107  protein of unknown function DUF512  43.5 
 
 
440 aa  341  2e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00107289  normal  0.222005 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0632  hypothetical protein  42.96 
 
 
446 aa  332  7.000000000000001e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.674286 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2296  FeS-containing organism-specific oxidoreductase  41.33 
 
 
453 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00042763  normal  0.0619176 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2244  FeS-containing oxidoreductase  41.33 
 
 
453 aa  327  3e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2331  Fe-S oxidoreductase  41.2 
 
 
465 aa  323  4e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.308629  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1326  Fe-S oxidoreductase  40.98 
 
 
451 aa  322  7e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1968  hypothetical protein  42.11 
 
 
452 aa  322  9.999999999999999e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.161355  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3382  protein of unknown function DUF512  41.16 
 
 
442 aa  319  7.999999999999999e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.322973  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0359  Fe-S oxidoreductase  40.18 
 
 
465 aa  315  7e-85  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2541  FeS-containing oxidoreductase  42.04 
 
 
448 aa  315  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2009  hypothetical protein  38.85 
 
 
445 aa  315  9.999999999999999e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1727  hypothetical protein  38.85 
 
 
445 aa  315  9.999999999999999e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.519845  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02221  putative Fe-S oxidoreductase  39.95 
 
 
465 aa  313  3.9999999999999997e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1225  protein of unknown function DUF512  42.92 
 
 
442 aa  311  2e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.767388  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1466  putative Fe-S oxidoreductase  40.33 
 
 
449 aa  311  2e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.455289  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0459  FeS-containing organism-specific oxidoreductase  40.38 
 
 
441 aa  309  5e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.320532  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01101  putative Fe-S oxidoreductase  38.53 
 
 
470 aa  308  9e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.277769  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4507  hypothetical protein  40.46 
 
 
456 aa  308  1.0000000000000001e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01141  putative Fe-S oxidoreductase  38.5 
 
 
459 aa  307  2.0000000000000002e-82  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01681  putative Fe-S oxidoreductase  40.09 
 
 
449 aa  307  3e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.911896  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01111  putative Fe-S oxidoreductase  37.21 
 
 
464 aa  301  2e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.980262  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0102  putative Fe-S oxidoreductase  37.41 
 
 
470 aa  298  1e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.383242  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01131  putative Fe-S oxidoreductase  37.74 
 
 
459 aa  297  3e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.104938  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0750  protein of unknown function DUF512  38.37 
 
 
433 aa  292  7e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0401  protein of unknown function DUF512  40.66 
 
 
487 aa  286  5e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3571  hypothetical protein  34.32 
 
 
523 aa  266  4e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.630428  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2144  hypothetical protein  35.25 
 
 
501 aa  246  8e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.831905  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2747  protein of unknown function DUF512  34.12 
 
 
508 aa  243  7e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.112314  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3528  hypothetical protein  35.03 
 
 
515 aa  239  5.999999999999999e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0727  protein of unknown function DUF512  34.74 
 
 
460 aa  232  1e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0961895 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0304  hypothetical protein  35.09 
 
 
496 aa  221  9.999999999999999e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.874468 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1348  protein of unknown function DUF512  37.61 
 
 
450 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09690  Fe-S oxidoreductase  33.71 
 
 
457 aa  217  2.9999999999999998e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.268372  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06880  Fe-S oxidoreductase  33.64 
 
 
455 aa  216  5.9999999999999996e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.364621 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1336  protein of unknown function DUF512  34.02 
 
 
477 aa  213  3.9999999999999995e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.506965 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1262  hypothetical protein  23.64 
 
 
455 aa  49.7  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0022  hypothetical protein  21.25 
 
 
436 aa  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3427  membrane-associated zinc metalloprotease  29.91 
 
 
450 aa  45.1  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000034207  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0867  hypothetical protein  20.48 
 
 
436 aa  45.4  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00173  hypothetical protein  29.91 
 
 
450 aa  45.1  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.131717  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0178  zinc metallopeptidase RseP  29.91 
 
 
450 aa  45.1  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111428  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00174  zinc metallopeptidase  29.91 
 
 
450 aa  45.1  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0881068  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3484  zinc metallopeptidase RseP  29.91 
 
 
450 aa  45.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00175231  normal  0.0731606 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0186  zinc metallopeptidase RseP  29.91 
 
 
450 aa  45.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000411751  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0187  zinc metallopeptidase RseP  29.91 
 
 
450 aa  45.1  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000756829  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0169  zinc metallopeptidase RseP  29.91 
 
 
450 aa  45.1  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000438283  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1116  methanogenesis marker protein 10  20.15 
 
 
436 aa  44.3  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0801  hypothetical protein  20.88 
 
 
436 aa  43.9  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>