More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2023 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2023  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 275 aa  571  1.0000000000000001e-162  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.385946 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3076  polysaccharide deacetylase  35.74 
 
 		 258 aa  142  7e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  34.29 
 
 		 282 aa  135  5e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  32.43 
 
 		 321 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1249  polysaccharide deacetylase  34.03 
 
 		 254 aa  125  6e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.651285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  32.77 
 
 		 279 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  31.86 
 
 		 306 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  31.74 
 
 		 306 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  32.98 
 
 		 319 aa  119  7e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1595  polysaccharide deacetylase  31.8 
 
 		 510 aa  113  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0639378  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  32.17 
 
 		 278 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3589  polysaccharide deacetylase  36.75 
 
 		 264 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525818  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2381  polysaccharide deacetylase  28.81 
 
 		 336 aa  106  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.437029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3249  polysaccharide deacetylase  32.06 
 
 		 266 aa  105  5e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2676  polysaccharide deacetylase  30.8 
 
 		 289 aa  105  6e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  33.48 
 
 		 274 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2127  polysaccharide deacetylase  29.81 
 
 		 256 aa  99  7e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0336  polysaccharide deacetylase family protein  33.66 
 
 		 233 aa  98.2  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1858  polysaccharide deacetylase  28.45 
 
 		 347 aa  98.6  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000052436  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0320  polysaccharide deacetylase family protein  33.66 
 
 		 233 aa  97.8  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2320  polysaccharide deacetylase  33.16 
 
 		 313 aa  97.1  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0918  polysaccharide deacetylase  28.12 
 
 		 234 aa  95.9  6e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00302194  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1971  putative xylanase/chitin deacetylase  30.47 
 
 		 239 aa  95.9  7e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0644502  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0171  polysaccharide deacetylase  27.23 
 
 		 259 aa  95.5  9e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0521886  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  29.29 
 
 		 271 aa  95.1  1e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1905  polysaccharide deacetylase  30.47 
 
 		 239 aa  95.1  1e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371349  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1402  xylanase/chitin deacetylase  26.83 
 
 		 256 aa  94.7  1e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0167631  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0414  polysaccharide deacetylase  28.21 
 
 		 233 aa  94  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  27.75 
 
 		 255 aa  93.6  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4397  polysaccharide deacetylase  32.27 
 
 		 244 aa  93.2  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  25.79 
 
 		 224 aa  93.2  4e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2752  polysaccharide deacetylase  33.66 
 
 		 251 aa  92.8  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0091  xylanase/chitin deacetylase  31.02 
 
 		 318 aa  92.8  5e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1976  polysaccharide deacetylase  28.8 
 
 		 257 aa  92.8  6e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.924862 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0136  polysaccharide deacetylase  30.48 
 
 		 316 aa  92.4  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5079  polysaccharide deacetylase  32.27 
 
 		 244 aa  92.4  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5781  polysaccharide deacetylase  32.27 
 
 		 244 aa  92.4  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.878477 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1457  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  26.41 
 
 		 237 aa  92  9e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.645637  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0310  putative polysaccharide deacetylase  31.58 
 
 		 270 aa  91.7  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.341957 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3089  polysaccharide deacetylase  32.89 
 
 		 239 aa  90.9  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1736  polysaccharide deacetylase  29.52 
 
 		 249 aa  90.9  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.70256 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  30.26 
 
 		 1015 aa  90.5  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2950  glycosyl transferase family 2  31.03 
 
 		 1001 aa  89.4  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.611527 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0504  hypothetical protein  28.65 
 
 		 277 aa  89.4  6e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5057  polysaccharide deacetylase  26.82 
 
 		 645 aa  89  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0273  polysaccharide deacetylase  29.39 
 
 		 627 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4456  polysaccharide deacetylase  30.51 
 
 		 253 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0895  polysaccharide deacetylase  29.47 
 
 		 615 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0313662  normal  0.429695 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0869  polysaccharide deacetylase  29.47 
 
 		 615 aa  87  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0287  polysaccharide deacetylase  27.52 
 
 		 319 aa  85.5  9e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.316315  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0156  polysaccharide deacetylase  26.28 
 
 		 276 aa  83.2  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8504  polysaccharide deacetylase  34.78 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  0.0143221 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1932  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 244 aa  83.2  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.656935  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1796  polysaccharide deacetylase  30.26 
 
 		 344 aa  83.2  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4617  polysaccharide deacetylase  34.1 
 
 		 266 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0110578 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4676  polysaccharide deacetylase  26.7 
 
 		 322 aa  82.8  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4855  polysaccharide deacetylase family protein  24.8 
 
 		 273 aa  82.4  0.000000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1580  glycosyl transferase family protein  29.63 
 
 		 598 aa  82.4  0.000000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.47169 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1121  polysaccharide deacetylase family protein  28.1 
 
 		 295 aa  81.6  0.00000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0046  polysaccharide deacetylase family protein  24.8 
 
 		 273 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0060  polysaccharide deacetylase family protein  24.8 
 
 		 273 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0976  polysaccharide deacetylase  26.03 
 
 		 274 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000769924  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0229  polysaccharide deacetylase family protein  30.4 
 
 		 238 aa  80.1  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00859248  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2084  polysaccharide deacetylase  29.5 
 
 		 249 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5301  polysaccharide deacetylase  30.29 
 
 		 272 aa  80.1  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2837  polysaccharide deacetylase  26.32 
 
 		 285 aa  80.5  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0405  polysaccharide deacetylase  30.4 
 
 		 238 aa  80.1  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0189593 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4616  polysaccharide deacetylase family protein  29.5 
 
 		 348 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0111  polysaccharide deacetylase family protein  25 
 
 		 273 aa  79.7  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.565524  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2241  polysaccharide deacetylase  27.44 
 
 		 297 aa  79.7  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3801  polysaccharide deacetylase  28 
 
 		 348 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0792  polysaccharide deacetylase  30.39 
 
 		 278 aa  79  0.00000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.623292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0653  regulatory protein, LacI  28.83 
 
 		 363 aa  79  0.00000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.773413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4122  polysaccharide deacetylase  27.31 
 
 		 348 aa  79  0.00000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3100  polysaccharide deacetylase  27.67 
 
 		 262 aa  79  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1542  polysaccharide deacetylase  26.79 
 
 		 273 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.04781e-18 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0260  polysaccharide deacetylase family protein  24.12 
 
 		 273 aa  78.2  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3874  polysaccharide deacetylase  28 
 
 		 348 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0340  polysaccharide deacetylase family protein  24.71 
 
 		 273 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.059566 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0145  polysaccharide deacetylase  26.91 
 
 		 348 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0658  xylanase/chitin deacetylase-like protein  35.43 
 
 		 221 aa  78.2  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4321  polysaccharide deacetylase  26.91 
 
 		 348 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3105  polysaccharide deacetylase  30 
 
 		 336 aa  77  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000266277  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0476  NhaD  24.37 
 
 		 256 aa  77.4  0.0000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.336062  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1452  polysaccharide deacetylase  27.13 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0440  polysaccharide deacetylase  28.14 
 
 		 283 aa  77  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.522067  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2170  polysaccharide deacetylase family protein  25.63 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3791  polysaccharide deacetylase  24.91 
 
 		 348 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2926  polysaccharide deacetylase  27.86 
 
 		 659 aa  76.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0616  polysaccharide deacetylase  26.47 
 
 		 373 aa  76.3  0.0000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0678  polysaccharide deacetylase  28.75 
 
 		 415 aa  75.9  0.0000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.945313  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1828  polysaccharide deacetylase  25.63 
 
 		 278 aa  76.3  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3011  polysaccharide deacetylase  27.48 
 
 		 659 aa  75.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.245243  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3118  polysaccharide deacetylase  27.48 
 
 		 660 aa  75.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0340  polysaccharide deacetylase family protein  24.41 
 
 		 273 aa  75.5  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.568999  normal  0.212352 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4000  polysaccharide deacetylase  28 
 
 		 348 aa  75.5  0.0000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4976  deacetylase  21.77 
 
 		 373 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.765353  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2104  polysaccharide deacetylase  27.04 
 
 		 276 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4541  polysaccharide deacetylase  29.3 
 
 		 263 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00515582 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4408  polysaccharide deacetylase  29.3 
 
 		 263 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158219  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>