More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1889 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1889  dihydropteroate synthase  100 
 
 		 290 aa  578  1e-164  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000220218  hitchhiker  0.00000000634632 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2253  dihydropteroate synthase  62.54 
 
 		 400 aa  355  5e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.379586  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1808  dihydropteroate synthase  71.27 
 
 		 303 aa  352  2.9999999999999997e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.70358  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2733  dihydropteroate synthase  65.36 
 
 		 284 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0148953  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1596  dihydropteroate synthase  62.37 
 
 		 278 aa  330  2e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2638  dihydropteroate synthase  61.65 
 
 		 278 aa  328  6e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.578756  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2523  dihydropteroate synthase  58.7 
 
 		 413 aa  310  2e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.974941  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2581  dihydropteroate synthase  53.62 
 
 		 393 aa  298  9e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0998  dihydropteroate synthase  53.15 
 
 		 306 aa  275  5e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000543452  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0812  dihydropteroate synthase  49.27 
 
 		 270 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000234542  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0154  dihydropteroate synthase  50.37 
 
 		 399 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.465574  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1883  dihydropteroate synthase  54.1 
 
 		 394 aa  268  7e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.436317  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3289  dihydropteroate synthase  49.26 
 
 		 287 aa  267  2e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0069  dihydropteroate synthase  51.88 
 
 		 283 aa  267  2e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0784  dihydropteroate synthase  49.1 
 
 		 279 aa  263  3e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.362908  unclonable  0.000000150876 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0072  dihydropteroate synthase  50.74 
 
 		 285 aa  261  8e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0110  dihydropteroate synthase  51.5 
 
 		 402 aa  260  2e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0235  dihydropteroate synthase  50.75 
 
 		 394 aa  259  4e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.683276 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4007  dihydropteroate synthase  50.94 
 
 		 280 aa  257  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0856154 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0939  dihydropteroate synthase  52.44 
 
 		 397 aa  257  2e-67  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0067  dihydropteroate synthase  47.06 
 
 		 277 aa  256  3e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0070  dihydropteroate synthase  47.79 
 
 		 280 aa  255  5e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0080  dihydropteroate synthase  47.43 
 
 		 277 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000343414 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0071  dihydropteroate synthase  47.43 
 
 		 280 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  47.43 
 
 		 280 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  47.43 
 
 		 280 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5237  dihydropteroate synthase  47.43 
 
 		 277 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121132 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0071  dihydropteroate synthase  47.43 
 
 		 280 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0067  dihydropteroate synthase  47.43 
 
 		 286 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0079  dihydropteroate synthase  47.79 
 
 		 277 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.863078  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0083  dihydropteroate synthase  46.69 
 
 		 277 aa  253  3e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.944677  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2635  dihydropteroate synthase  50 
 
 		 277 aa  250  2e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0550  dihydropteroate synthase  45.96 
 
 		 286 aa  248  7e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2568  dihydropteroate synthase  47.43 
 
 		 286 aa  245  4.9999999999999997e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.032898  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1098  dihydropteroate synthase  45.05 
 
 		 269 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0139197  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1330  dihydropteroate synthase  43.84 
 
 		 274 aa  243  3e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.144104  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1276  dihydropteroate synthase  44.69 
 
 		 269 aa  243  3e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000186218  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2354  dihydropteroate synthase  45.79 
 
 		 279 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2404  dihydropteroate synthase  45.79 
 
 		 279 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1381  dihydropteroate synthase  46.69 
 
 		 281 aa  242  5e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.131538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62850  dihydropteroate synthase  51.99 
 
 		 283 aa  242  5e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3045  dihydropteroate synthase  50.18 
 
 		 291 aa  242  6e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0675  dihydropteroate synthase  46.76 
 
 		 347 aa  241  7.999999999999999e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2261  dihydropteroate synthase  49.59 
 
 		 258 aa  240  2e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00525567  hitchhiker  0.00000000957493 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3614  dihydropteroate synthase  48.74 
 
 		 283 aa  239  4e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1925  dihydropteroate synthase  46.79 
 
 		 291 aa  238  5.999999999999999e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00000353988  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2076  dihydropteroate synthase  46.72 
 
 		 285 aa  237  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.495698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0729  dihydropteroate synthase  45.49 
 
 		 275 aa  236  2e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5470  dihydropteroate synthase  50.18 
 
 		 283 aa  236  3e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592135  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1075  dihydropteroate synthase  48.85 
 
 		 282 aa  236  4e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0462  dihydropteroate synthase  46.55 
 
 		 291 aa  235  8e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0095  dihydropteroate synthase  48.13 
 
 		 396 aa  234  9e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0905  dihydropteroate synthase  47.91 
 
 		 278 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0884892  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0147  dihydropteroate synthase  51.84 
 
 		 257 aa  233  4.0000000000000004e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0098  dihydropteroate synthase  45.14 
 
 		 275 aa  231  8.000000000000001e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0619  dihydropteroate synthase  44.8 
 
 		 397 aa  231  8.000000000000001e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000204624  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0868  dihydropteroate synthase  45.38 
 
 		 266 aa  231  1e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0883  dihydropteroate synthase  46.77 
 
 		 278 aa  231  1e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0252047  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1769  dihydropteroate synthase  51.82 
 
 		 286 aa  231  1e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.633789  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0955  dihydropteroate synthase  46.36 
 
 		 279 aa  231  1e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0212772  normal  0.281578 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3066  dihydropteroate synthase  45.56 
 
 		 280 aa  230  2e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000940885  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4718  dihydropteroate synthase  47.65 
 
 		 283 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1971  dihydropteroate synthase  47.31 
 
 		 289 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.305951 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0984  dihydropteroate synthase  46.18 
 
 		 287 aa  230  2e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000265095  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0151  dihydropteroate synthase  47.37 
 
 		 407 aa  230  3e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.355211  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3166  dihydropteroate synthase  45.77 
 
 		 418 aa  229  3e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00152005  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0097  dihydropteroate synthase  43.73 
 
 		 412 aa  229  4e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4496  dihydropteroate synthase  44.91 
 
 		 302 aa  229  5e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.470248  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0167  dihydropteroate synthase  46.24 
 
 		 278 aa  229  5e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000848147  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3451  dihydropteroate synthase  44.18 
 
 		 286 aa  229  6e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1198  dihydropteroate synthase  46.12 
 
 		 277 aa  228  1e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0715  dihydropteroate synthase  48.03 
 
 		 283 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.964503  normal  0.0739685 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0111  dihydropteroate synthase  43.45 
 
 		 356 aa  228  1e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4717  dihydropteroate synthase  47.65 
 
 		 283 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00896074 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0511  dihydropteroate synthase  50 
 
 		 345 aa  227  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3395  dihydropteroate synthase  45.02 
 
 		 280 aa  227  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000218907  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0616  dihydropteroate synthase  44.77 
 
 		 400 aa  226  2e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03042  7,8-dihydropteroate synthase  46.07 
 
 		 282 aa  226  3e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000457475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0530  dihydropteroate synthase  46.07 
 
 		 282 aa  226  3e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0023005  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3473  dihydropteroate synthase  46.07 
 
 		 282 aa  226  3e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000584102  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02993  hypothetical protein  46.07 
 
 		 282 aa  226  3e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000407498  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3369  dihydropteroate synthase  46.07 
 
 		 282 aa  226  3e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000338476  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3662  dihydropteroate synthase  46.07 
 
 		 282 aa  226  3e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000648754  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4499  dihydropteroate synthase  46.07 
 
 		 282 aa  226  3e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00232473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0523  dihydropteroate synthase  46.07 
 
 		 282 aa  226  3e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00018335  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1485  dihydropteroate synthase  44.93 
 
 		 284 aa  226  4e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0106007  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3567  dihydropteroate synthase  44.69 
 
 		 279 aa  226  4e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00503342  hitchhiker  0.00000448434 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3593  dihydropteroate synthase  45.69 
 
 		 282 aa  226  4e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346067  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4583  dihydropteroate synthase  47.65 
 
 		 283 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.918855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2337  dihydropteroate synthase  54.88 
 
 		 280 aa  226  5.0000000000000005e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.968107 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1024  dihydropteroate synthase  45.74 
 
 		 277 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0113899  hitchhiker  0.0000441656 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1020  dihydropteroate synthase  45.74 
 
 		 277 aa  225  7e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000388358  hitchhiker  0.000398045 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1862  dihydropteroate synthase  49.62 
 
 		 345 aa  225  8e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.405755  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2184  dihydropteroate synthase  50.57 
 
 		 284 aa  225  8e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1572  dihydropteroate synthase  46.61 
 
 		 274 aa  225  8e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0119126  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4186  dihydropteroate synthase  46.24 
 
 		 283 aa  224  9e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1882  dihydropteroate synthase  44.36 
 
 		 274 aa  224  1e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.747516  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3735  dihydropteroate synthase  44.31 
 
 		 277 aa  223  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00714217  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1349  dihydropteroate synthase  42.96 
 
 		 282 aa  224  2e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.694482  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3601  dihydropteroate synthase  44.31 
 
 		 277 aa  223  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000106991  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>