More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1882 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1882  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 149 aa  295  1e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000211918  hitchhiker  0.00000438045 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1801  CBS domain-containing protein  79.73 
 
 		 149 aa  246  5e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0256126  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3021  CBS domain containing membrane protein  64.86 
 
 		 149 aa  218  3e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1262  CBS domain containing membrane protein  64.86 
 
 		 149 aa  218  3e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178252  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2320  CBS domain-containing protein  72.48 
 
 		 150 aa  193  7e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000465345  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2260  CBS domain-containing protein  59.73 
 
 		 150 aa  190  4e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000586041  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2529  CBS domain containing membrane protein  61.49 
 
 		 149 aa  189  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00130386  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1004  CBS domain-containing protein  53.06 
 
 		 149 aa  164  4e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024412  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  44.59 
 
 		 152 aa  138  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  40.14 
 
 		 150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  40.54 
 
 		 148 aa  118  3e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1201  CBS domain-containing protein  37.16 
 
 		 152 aa  118  3e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0278  CBS domain containing membrane protein  40.14 
 
 		 150 aa  117  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10697 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  38.46 
 
 		 153 aa  117  6e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  37.84 
 
 		 153 aa  117  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  37.84 
 
 		 153 aa  117  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2046  CBS  37.84 
 
 		 150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  35.62 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  38.62 
 
 		 154 aa  113  7.999999999999999e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  34.69 
 
 		 153 aa  110  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  36.05 
 
 		 152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  37.16 
 
 		 155 aa  107  5e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  33.33 
 
 		 147 aa  106  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  31.76 
 
 		 149 aa  105  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1851  CBS domain containing membrane protein  35.14 
 
 		 151 aa  105  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.309684  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1887  CBS domain containing membrane protein  38.67 
 
 		 153 aa  103  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278261  normal  0.114824 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0960  CBS domain-containing protein  35.37 
 
 		 153 aa  103  8e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0461508  hitchhiker  0.00174257 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3596  CBS domain-containing protein  36.18 
 
 		 241 aa  103  9e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1824  CBS  35.81 
 
 		 154 aa  103  9e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.539518 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  34.25 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  32.43 
 
 		 247 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  32.88 
 
 		 246 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  36.05 
 
 		 230 aa  97.4  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4751  CBS domain containing membrane protein  36.81 
 
 		 154 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142923  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0803  signal transduction protein  36.11 
 
 		 160 aa  93.6  8e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.708068  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  32.65 
 
 		 249 aa  92  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3570  CBS domain-containing protein  31.51 
 
 		 246 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  34.01 
 
 		 230 aa  90.9  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  34.46 
 
 		 230 aa  89.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1597  CBS domain containing membrane protein  31.33 
 
 		 151 aa  88.6  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.105679 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1925  CBS domain protein  31.33 
 
 		 151 aa  88.6  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1630  signal-transduction protein  29.93 
 
 		 233 aa  86.7  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  33.79 
 
 		 132 aa  86.7  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4019  hypothetical protein  34.81 
 
 		 339 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.191976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5821  signal-transduction protein  30.28 
 
 		 231 aa  84  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.12685 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5888  CBS domain-containing protein  32.21 
 
 		 242 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17501  IMP dehydrogenase-like protein  29.66 
 
 		 156 aa  83.2  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1228  signal-transduction protein  32.69 
 
 		 339 aa  82  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  30.13 
 
 		 161 aa  82.4  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  35.76 
 
 		 158 aa  81.6  0.000000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0675  signal transduction protein  28.57 
 
 		 147 aa  80.9  0.000000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  34.44 
 
 		 348 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  31.97 
 
 		 242 aa  80.5  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0774  CBS  29.73 
 
 		 157 aa  79.7  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  31.33 
 
 		 229 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1413  putative signal-transduction protein with CBS domains  33.77 
 
 		 338 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  31.54 
 
 		 229 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1023  hypothetical protein  31.54 
 
 		 243 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2980  signal transduction protein  32.21 
 
 		 423 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1933  CBS domain-containing protein  27.21 
 
 		 228 aa  79  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1134  signal transduction protein  29.53 
 
 		 151 aa  78.6  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1902  CBS domain-containing protein  31.97 
 
 		 231 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1649  CBS domain-containing membrane protein  34.78 
 
 		 234 aa  78.2  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0176167  normal  0.734042 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0646  CBS  34.93 
 
 		 332 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1947  signal-transduction protein  29.73 
 
 		 226 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.489577  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3042  CBS  31.13 
 
 		 241 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1281  signal transduction protein  33.54 
 
 		 153 aa  75.5  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.366949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  28.08 
 
 		 155 aa  75.9  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4486  CBS domain-containing protein  30.2 
 
 		 373 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16132  normal  0.433507 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2202  putative signal transduction protein with CBS domains  32.43 
 
 		 236 aa  75.9  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2138  putative signal transduction protein with CBS domains  34.29 
 
 		 151 aa  75.1  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1879  CBS  27.7 
 
 		 157 aa  75.1  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2521  signal transduction protein  30.61 
 
 		 161 aa  74.3  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  31.51 
 
 		 210 aa  73.9  0.0000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1365  signal-transduction protein  28.38 
 
 		 243 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.831809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0675  signal transduction protein  33.54 
 
 		 153 aa  73.9  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.302021  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1344  putative signal-transduction protein with CBS domains  28.38 
 
 		 243 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  36.05 
 
 		 141 aa  72.8  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2233  CBS domain-containing protein  29.25 
 
 		 232 aa  73.2  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4814  CBS domain containing membrane protein  29.61 
 
 		 226 aa  73.2  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1395  signal transduction protein  32.91 
 
 		 153 aa  72.4  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  34.87 
 
 		 428 aa  72.4  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.69 
 
 		 628 aa  72.8  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0591  signal-transduction protein  30.07 
 
 		 155 aa  72  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0331315  normal  0.426072 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  32.89 
 
 		 427 aa  72.8  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  29.17 
 
 		 223 aa  71.6  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1912  signal-transduction protein  27.21 
 
 		 242 aa  71.6  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0206039  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  28.86 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0317  CBS domain-containing protein  25.97 
 
 		 394 aa  71.6  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2041  CBS domain containing membrane protein  32.45 
 
 		 227 aa  70.9  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000255814  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2675  CBS:HPP  30.61 
 
 		 379 aa  70.1  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2232  CBS domain containing membrane protein  30.38 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2906  signal transduction protein  28.12 
 
 		 291 aa  70.1  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0019  CBS domain-containing protein  28.39 
 
 		 410 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1105  CBS domain containing membrane protein  30.97 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  32.39 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  28.38 
 
 		 242 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0098  CBS domain-containing protein  29.93 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1473  CBS domain-containing protein  25.81 
 
 		 390 aa  68.6  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103531 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0098  CBS domain-containing protein  29.25 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>