More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1853 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  84.23 
 
 		 443 aa  754    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  73.77 
 
 		 444 aa  644    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  74.66 
 
 		 444 aa  647    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  77.75 
 
 		 444 aa  697    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  100 
 
 		 443 aa  897    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  71.69 
 
 		 452 aa  644    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  69.56 
 
 		 455 aa  626  1e-178  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  63.31 
 
 		 441 aa  553  1e-156  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  57.95 
 
 		 450 aa  495  1e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  58.85 
 
 		 444 aa  491  1e-137  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  56.95 
 
 		 457 aa  487  1e-136  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  57.05 
 
 		 438 aa  487  1e-136  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  51.73 
 
 		 461 aa  444  1e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  51.17 
 
 		 439 aa  432  1e-120  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1646  carboxyl-terminal protease  54.48 
 
 		 458 aa  432  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2567  carboxyl-terminal protease  54.01 
 
 		 456 aa  426  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000043041 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  52.85 
 
 		 439 aa  417  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  49.88 
 
 		 441 aa  412  1e-114  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2453  carboxyl-terminal protease  49.01 
 
 		 455 aa  411  1e-114  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493491  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  53.52 
 
 		 445 aa  410  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2392  peptidase S41A, protease  50.93 
 
 		 468 aa  408  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  54.29 
 
 		 439 aa  408  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  47.28 
 
 		 476 aa  410  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  51.76 
 
 		 438 aa  410  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  53.65 
 
 		 438 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  52.13 
 
 		 432 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  53.65 
 
 		 438 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1119  carboxyl-terminal protease  51.28 
 
 		 481 aa  408  1.0000000000000001e-112  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  49.28 
 
 		 440 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  53.67 
 
 		 438 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  53.16 
 
 		 437 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  51.86 
 
 		 468 aa  399  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2159  carboxyl-terminal protease  49.05 
 
 		 422 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  50.61 
 
 		 428 aa  401  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  52.64 
 
 		 436 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  52.14 
 
 		 436 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  51.46 
 
 		 445 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  50.74 
 
 		 439 aa  392  1e-108  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0608  peptidase S41A, C-terminal protease  44.7 
 
 		 480 aa  389  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  50.59 
 
 		 444 aa  389  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  47.95 
 
 		 446 aa  385  1e-106  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0703  carboxyl-terminal protease  48.87 
 
 		 437 aa  388  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0704  carboxyl-terminal protease  48.87 
 
 		 437 aa  388  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  49.01 
 
 		 445 aa  383  1e-105  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  49.01 
 
 		 445 aa  383  1e-105  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0669  C-terminal processing peptidase-3  49.12 
 
 		 437 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  50 
 
 		 426 aa  380  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  47.22 
 
 		 440 aa  375  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0381  carboxyl-terminal protease  46.91 
 
 		 441 aa  375  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0713  carboxyl-terminal protease  50.41 
 
 		 459 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.290846  normal  0.150395 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  48.4 
 
 		 458 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  47.76 
 
 		 462 aa  373  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2755  carboxyl-terminal protease  47.15 
 
 		 445 aa  372  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1546  carboxyl-terminal protease  46.1 
 
 		 483 aa  370  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0199003  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  46.91 
 
 		 451 aa  369  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0923  carboxyl-terminal protease  47.22 
 
 		 428 aa  365  1e-100  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.315177  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  47.54 
 
 		 443 aa  367  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  49.88 
 
 		 423 aa  365  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0643  carboxyl-terminal protease  47.89 
 
 		 447 aa  365  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  47.24 
 
 		 433 aa  368  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  47.85 
 
 		 442 aa  366  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1770  carboxyl-terminal protease  49.16 
 
 		 424 aa  365  1e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1837  carboxyl-terminal protease  49.16 
 
 		 424 aa  364  1e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  48.69 
 
 		 451 aa  363  2e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0449  carboxy-terminal processing protease precursor  47.02 
 
 		 456 aa  362  6e-99  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0166  carboxyl-terminal protease  47.72 
 
 		 452 aa  362  6e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.97074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  47.22 
 
 		 456 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  46.62 
 
 		 445 aa  362  8e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  47.45 
 
 		 457 aa  361  1e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  47.22 
 
 		 440 aa  361  1e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1812  carboxyl-terminal protease  44.47 
 
 		 478 aa  362  1e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1722  C-terminal processing peptidase  46.78 
 
 		 456 aa  360  3e-98  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2508  carboxyl-terminal protease  46.08 
 
 		 471 aa  360  3e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0091  carboxyl-terminal protease  46.06 
 
 		 445 aa  359  5e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0132582  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2591  carboxyl-terminal protease  44.72 
 
 		 448 aa  358  9e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.837496  normal  0.635906 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0932  S41 family peptidase  44.95 
 
 		 448 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0235658  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  50 
 
 		 444 aa  358  9.999999999999999e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  45.45 
 
 		 429 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  52.12 
 
 		 482 aa  356  3.9999999999999996e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  52.12 
 
 		 482 aa  356  3.9999999999999996e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0324  C-terminal processing peptidase  49.63 
 
 		 434 aa  356  5e-97  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2983  carboxyl-terminal protease  45.31 
 
 		 449 aa  356  5e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.44239  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4209  carboxyl-terminal protease  47.28 
 
 		 440 aa  355  6.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.194144 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  50.14 
 
 		 410 aa  355  6.999999999999999e-97  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  47.18 
 
 		 444 aa  355  8.999999999999999e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3885  carboxyl-terminal protease  47.04 
 
 		 440 aa  355  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26921  normal  0.039138 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2287  carboxyl-terminal protease  48.18 
 
 		 440 aa  355  1e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2562  carboxyl-terminal protease  48.18 
 
 		 440 aa  355  1e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4223  carboxyl-terminal protease  45.6 
 
 		 440 aa  354  1e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  48.54 
 
 		 446 aa  354  2e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2244  carboxyl-terminal protease  46.08 
 
 		 440 aa  352  5e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0625684  normal  0.355809 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4104  carboxyl-terminal protease  43.92 
 
 		 481 aa  352  5.9999999999999994e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228139  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3016  carboxyl-terminal protease  47.41 
 
 		 440 aa  352  7e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0035  carboxyl-terminal protease  43.4 
 
 		 478 aa  351  1e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.118794  normal  0.879403 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2072  carboxyl-terminal protease  47.12 
 
 		 453 aa  351  1e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0885  carboxyl-terminal protease  43.87 
 
 		 479 aa  350  2e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1084  C-terminal processing peptidase  42.28 
 
 		 480 aa  348  1e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.207844  normal  0.316164 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3859  C-terminal processing peptidase-3  42.68 
 
 		 479 aa  347  2e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3506  C-terminal processing peptidase-3  43.22 
 
 		 478 aa  347  2e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0926  carboxyl-terminal protease  43.38 
 
 		 479 aa  348  2e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.388847  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>