More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1832 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1745  OmpA domain-containing protein  67.11 
 
 		 524 aa  712    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.155252  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1832  OmpA/MotB  100 
 
 		 523 aa  1059    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2141  OmpA/MotB domain-containing protein  51.76 
 
 		 520 aa  545  1e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0276844  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0908  OmpA/MotB domain-containing protein  46.23 
 
 		 224 aa  87.8  4e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.685511 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  39.69 
 
 		 263 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  39.69 
 
 		 263 aa  87.4  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0716  OmpA/MotB domain-containing protein  45.28 
 
 		 226 aa  87  7e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.12728 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  39.69 
 
 		 263 aa  87  8e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1522  conserved repeat domain protein  42.57 
 
 		 1984 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000121408 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 		 454 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  39 
 
 		 466 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  38.17 
 
 		 262 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2718  conserved repeat domain protein  42.57 
 
 		 2000 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  40.38 
 
 		 230 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  39.22 
 
 		 468 aa  84.7  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  40.38 
 
 		 230 aa  84.3  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0823  OmpA/MotB  42.45 
 
 		 248 aa  84  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  42.31 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0708  OmpA/MotB domain-containing protein  45.28 
 
 		 228 aa  84.3  0.000000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.808623  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  40.38 
 
 		 230 aa  84.3  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3969  OmpA family protein  43.4 
 
 		 228 aa  83.6  0.000000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  45.28 
 
 		 352 aa  83.6  0.000000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03402  predicted outer membrane lipoprotein  38.69 
 
 		 219 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0160  OmpA/MotB domain protein  38.69 
 
 		 219 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3859  putative outer membrane lipoprotein  38.69 
 
 		 220 aa  82.8  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4928  putative outer membrane lipoprotein  38.69 
 
 		 219 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3873  putative outer membrane lipoprotein  38.69 
 
 		 219 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4028  putative outer membrane lipoprotein  38.69 
 
 		 220 aa  82.8  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0388504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3753  putative outer membrane lipoprotein  38.69 
 
 		 219 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  42.31 
 
 		 294 aa  83.2  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  38.69 
 
 		 220 aa  82.8  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03353  hypothetical protein  38.69 
 
 		 219 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  38.69 
 
 		 220 aa  82.8  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.835288 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  37.5 
 
 		 669 aa  83.2  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4047  putative outer membrane lipoprotein  38.69 
 
 		 219 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3840  putative outer membrane lipoprotein  38.69 
 
 		 220 aa  82.8  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  39.42 
 
 		 230 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  38.24 
 
 		 466 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0164  putative outer membrane lipoprotein  38.69 
 
 		 219 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  32.91 
 
 		 260 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1167  OmpA family protein  44.23 
 
 		 243 aa  82.4  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0821  ompA family protein  41.9 
 
 		 168 aa  82  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0700  OmpA/MotB domain protein  42.45 
 
 		 230 aa  82  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0120  OmpA/MotB domain protein  42.2 
 
 		 218 aa  82.4  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0679  OmpA/MotB domain-containing protein  42.45 
 
 		 230 aa  82  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0519812  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3096  OmpA family protein  42.45 
 
 		 222 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.625816  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3488  ompA family protein  41.9 
 
 		 168 aa  82  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3974  putative outer membrane lipoprotein  38.69 
 
 		 219 aa  82.4  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2246  OmpA/MotB  42.11 
 
 		 167 aa  82.4  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.18876  normal  0.277213 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3675  OmpA/MotB domain-containing protein  42.45 
 
 		 230 aa  82  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000026276  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3617  OmpA/MotB domain-containing protein  41.9 
 
 		 168 aa  82  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0666  OmpA/MotB domain-containing protein  43.4 
 
 		 230 aa  82  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000515803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3356  OmpA/MotB domain-containing protein  43.4 
 
 		 230 aa  82  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000065492  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0709  OmpA/MotB domain-containing protein  42.45 
 
 		 230 aa  82  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000940918  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0665  OmpA/MotB domain-containing protein  41.09 
 
 		 230 aa  82  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000180741  normal  0.0736379 
 
 
-
 
NC_004310  BR1204  OmpA family protein  44.23 
 
 		 220 aa  81.6  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  38.32 
 
 		 420 aa  82  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4248  OmpA/MotB domain-containing protein  43.4 
 
 		 224 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000908263  unclonable  0.0000000127118 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3652  OmpA/MotB domain-containing protein  38.94 
 
 		 166 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.549445  normal  0.986121 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  42.31 
 
 		 219 aa  81.3  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  35.88 
 
 		 261 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  40.57 
 
 		 261 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0293  OmpA/MotB domain protein  43.14 
 
 		 213 aa  80.5  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0608822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  40.57 
 
 		 261 aa  80.9  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  37.14 
 
 		 212 aa  80.5  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1814  OmpA/MotB  36.51 
 
 		 321 aa  80.5  0.00000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0898802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  41.35 
 
 		 219 aa  80.5  0.00000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  37.74 
 
 		 222 aa  80.1  0.00000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  36.27 
 
 		 459 aa  80.1  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  32.28 
 
 		 260 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3624  OmpA/MotB domain-containing protein  42.45 
 
 		 224 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0928297  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1340  OmpA/MotB domain protein  40.59 
 
 		 207 aa  79.7  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000111461  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  35.64 
 
 		 457 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  40.38 
 
 		 242 aa  79.7  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  41.35 
 
 		 607 aa  79.3  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3118  OmpA/MotB family outer membrane protein  36.13 
 
 		 242 aa  79.7  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  33.56 
 
 		 510 aa  79.3  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0492  OmpA/MotB domain-containing protein  42.31 
 
 		 187 aa  80.1  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142767  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1985  OmpA/MotB domain-containing protein  42.72 
 
 		 221 aa  79  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0172  putative outer membrane lipoprotein  37.96 
 
 		 220 aa  79.3  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  42.24 
 
 		 231 aa  78.6  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1468  OmpA/MotB domain protein  43.27 
 
 		 227 aa  79  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.831013  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2223  OmpA/MotB  49.33 
 
 		 186 aa  79.3  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2813  OmpA/MotB domain protein  41.35 
 
 		 221 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  41.35 
 
 		 218 aa  79.3  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  41.35 
 
 		 244 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  36.43 
 
 		 294 aa  78.6  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15220  outer membrane protein, OmpA/MotB family  39.62 
 
 		 270 aa  79  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  41.35 
 
 		 218 aa  79.3  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1865  OmpA family protein  40 
 
 		 241 aa  78.6  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1793  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 241 aa  78.6  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1267  OmpA/MotB  42.45 
 
 		 223 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164342  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  38.83 
 
 		 210 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  36.43 
 
 		 209 aa  78.6  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2554  OmpA/MotB domain protein  41.35 
 
 		 221 aa  78.6  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.900658 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  38.24 
 
 		 193 aa  78.6  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2601  OmpA/MotB domain protein  37.04 
 
 		 403 aa  78.6  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.278208  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0386  outer membrane fibronectin-binding protein  40.95 
 
 		 328 aa  77.8  0.0000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.323091  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50880  hypothetical protein  39.25 
 
 		 210 aa  78.2  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000407187 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4338  hypothetical protein  39.25 
 
 		 210 aa  78.2  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>