More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1821 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_1821  inner-membrane translocator  100 
 
 
328 aa  637    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1732  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  84.21 
 
 
326 aa  494  1e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2128  inner-membrane translocator  76.92 
 
 
337 aa  489  1e-137  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1863  inner-membrane translocator  73.79 
 
 
321 aa  454  1e-127  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1673  inner-membrane translocator  72.1 
 
 
319 aa  440  9.999999999999999e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2187  inner-membrane translocator  68.75 
 
 
320 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2040  inner-membrane translocator  67.19 
 
 
320 aa  390  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000437253 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1679  inner-membrane translocator  53.77 
 
 
317 aa  307  1.0000000000000001e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1407  inner-membrane translocator  49.49 
 
 
332 aa  277  1e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.14353  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1482  inner-membrane translocator  50.72 
 
 
360 aa  266  5e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3820  inner-membrane translocator  47.99 
 
 
328 aa  262  4.999999999999999e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0270491  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4071  inner-membrane translocator  43.69 
 
 
327 aa  261  1e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0997  inner-membrane translocator  45.67 
 
 
321 aa  260  2e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.915307  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0384  ABC transporter related  47.68 
 
 
614 aa  257  2e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0835  inner-membrane translocator  45.08 
 
 
335 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0400978  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0366  inner-membrane translocator  47.12 
 
 
310 aa  252  5.000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000392686  unclonable  0.0000000558621 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0670  inner-membrane translocator  45.6 
 
 
335 aa  242  5e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0678  inner-membrane translocator  46.15 
 
 
314 aa  235  7e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.297461  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3103  inner-membrane translocator  45.83 
 
 
354 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4551  inner-membrane translocator  45.79 
 
 
314 aa  222  7e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1517  inner-membrane translocator  46.67 
 
 
309 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4795  inner-membrane translocator  39.94 
 
 
319 aa  213  3.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.341671  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1047  inner-membrane translocator  41.28 
 
 
314 aa  208  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.210224 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0891  inner-membrane translocator  42.26 
 
 
320 aa  206  4e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1480  inner-membrane translocator  37.37 
 
 
407 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3206  inner-membrane translocator  40.13 
 
 
318 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1944  inner-membrane translocator  38.87 
 
 
297 aa  194  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2365  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.58 
 
 
339 aa  192  5e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.554509  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2609  inner-membrane translocator  35.83 
 
 
415 aa  192  6e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2754  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  38.03 
 
 
325 aa  192  9e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.129032  normal  0.265528 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2395  inner-membrane translocator  35.92 
 
 
407 aa  191  1e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2363  inner-membrane translocator  40.14 
 
 
325 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0322104  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3393  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  40 
 
 
307 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0091  ABC transporter related  36.3 
 
 
594 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1326  ABC transporter-like protein  38.43 
 
 
590 aa  187  2e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.051365 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0112  inner-membrane translocator  37.23 
 
 
327 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1722  inner-membrane translocator  39.52 
 
 
300 aa  187  3e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3273  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  35.59 
 
 
594 aa  186  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.841496  normal  0.164323 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4098  inner-membrane translocator:ABC transporter related  35.76 
 
 
950 aa  186  5e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2500  inner-membrane translocator  38.39 
 
 
317 aa  186  5e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.193513 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2942  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  35.24 
 
 
594 aa  186  6e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1601  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.24 
 
 
594 aa  186  6e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3369  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.24 
 
 
594 aa  186  6e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3001  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.24 
 
 
594 aa  186  6e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2964  ABC transporter related  34.98 
 
 
594 aa  185  8e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3984  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.24 
 
 
594 aa  185  8e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0091  ABC transporter related  34.98 
 
 
594 aa  185  8e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0108  ABC transporter related  34.42 
 
 
594 aa  185  9e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0192  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  35.24 
 
 
594 aa  185  9e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0833757  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4058  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.24 
 
 
594 aa  185  9e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0260  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  40.49 
 
 
322 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2111  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  38.69 
 
 
298 aa  184  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0082  ABC transporter related  35.59 
 
 
594 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.999385  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0092  ABC transporter related  35.59 
 
 
594 aa  183  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.500773 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3322  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  35.76 
 
 
594 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0026  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  33.89 
 
 
594 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0836  inner-membrane translocator  38.49 
 
 
318 aa  182  5.0000000000000004e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3907  ABC transporter related  33.56 
 
 
594 aa  182  6e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1135  inner-membrane translocator  41.58 
 
 
298 aa  182  9.000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.433507  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2318  ABC transporter related protein  38.32 
 
 
589 aa  181  1e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2500  inner-membrane translocator  35.84 
 
 
407 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.62609  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  36.11 
 
 
562 aa  179  4e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2271  inner-membrane translocator  39.22 
 
 
297 aa  179  4e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.900398 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1129  inner-membrane translocator  37.72 
 
 
299 aa  179  5.999999999999999e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1395  inner-membrane translocator  39.57 
 
 
293 aa  178  9e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1259  inner-membrane translocator  38.64 
 
 
357 aa  177  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0934  inner-membrane translocator  36.39 
 
 
327 aa  177  2e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000511533  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0535  inner-membrane translocator  37.1 
 
 
401 aa  177  2e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000217655 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1820  ABC transporter related  39.48 
 
 
599 aa  177  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3041  ABC transporter related  33.22 
 
 
594 aa  176  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3363  inner-membrane translocator  38.06 
 
 
358 aa  175  7e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.585542 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3027  inner-membrane translocator  35.76 
 
 
393 aa  176  7e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.56847  normal  0.739943 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0354  inner-membrane translocator  39.85 
 
 
311 aa  175  8e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.112024  normal  0.284931 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1608  inner-membrane translocator  37.88 
 
 
356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0142848  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1994  ABC transporter related  34.59 
 
 
590 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2711  inner-membrane translocator  37.74 
 
 
358 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2752  inner-membrane translocator  39.78 
 
 
330 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0065  inner-membrane translocator  40 
 
 
282 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.123483 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1674  inner-membrane translocator  37.88 
 
 
358 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0777  ABC transporter related  34.88 
 
 
590 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1891  ABC transporter related  35.53 
 
 
589 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.553447  normal  0.571968 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0567  inner-membrane translocator  33.44 
 
 
443 aa  172  5.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.856247  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0474  inner-membrane translocator  37.94 
 
 
336 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01987  amino-acid transmembrane ABC transporter protein  40.66 
 
 
299 aa  172  6.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.130303  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2252  inner-membrane translocator  39.04 
 
 
317 aa  172  9e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4096  inner-membrane translocator  40.14 
 
 
358 aa  171  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.949458  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3055  inner-membrane translocator  34.97 
 
 
324 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0554  inner-membrane translocator  33.23 
 
 
433 aa  170  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0237898  normal  0.469815 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6000  branched-chain amino acid transport system permease protein  37.98 
 
 
321 aa  169  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108703  normal  0.0256137 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2738  inner-membrane translocator  38.41 
 
 
360 aa  169  6e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3534  inner-membrane translocator  37.23 
 
 
333 aa  169  6e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0406  inner-membrane translocator  39.5 
 
 
327 aa  169  7e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0311713  normal  0.305027 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0643  inner-membrane translocator  34.62 
 
 
347 aa  169  7e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19630  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  32.52 
 
 
418 aa  168  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000188502  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3572  branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  33.78 
 
 
589 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.317873 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4632  ABC transporter ATPase component  32.69 
 
 
590 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3838  inner-membrane translocator  34.46 
 
 
315 aa  168  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.242692  normal  0.204744 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2521  inner-membrane translocator  33.72 
 
 
389 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.561391  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2414  inner-membrane translocator  33.43 
 
 
389 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0405273 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2496  inner-membrane translocator  33.72 
 
 
389 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381259  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>