139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1814 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1814  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  315  2e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2773  hypothetical protein  64.24 
 
 		 151 aa  211  1.9999999999999998e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000119865  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1592  quinol:cytochrome c oxidoreductase monoheme cytochrome subunit  36.75 
 
 		 205 aa  77.4  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0844  hypothetical protein  30.61 
 
 		 190 aa  68.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.205332  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0097  hypothetical protein  27.16 
 
 		 166 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000663376 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1466  hypothetical protein  27.98 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4431  hypothetical protein  30.07 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.074977  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5668  cytochrome c class I  32.63 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1241  hypothetical protein  30.91 
 
 		 213 aa  64.3  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0847  hypothetical protein  29.66 
 
 		 190 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0760  cytochrome c, class I  35.8 
 
 		 101 aa  63.5  0.0000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.957716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0851  hypothetical protein  28.97 
 
 		 190 aa  62  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0799  hypothetical protein  28.97 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2443  cytochrome c class I  35.16 
 
 		 143 aa  62  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.113106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0116  hypothetical protein  25.61 
 
 		 166 aa  62  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0225  quinol:cytochrome c oxidoreductase monoheme cytochrome subunit  32.65 
 
 		 209 aa  60.5  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.416605  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0161  cytochrome c class I  39.08 
 
 		 254 aa  60.5  0.000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000207523  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2710  hypothetical protein  29.79 
 
 		 200 aa  60.1  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.198699 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3473  cytochrome c family protein  30.53 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349058  normal  0.204914 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3866  cytochrome c class I  30.39 
 
 		 388 aa  58.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5952  hypothetical protein  25.32 
 
 		 175 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2209  hypothetical protein  34.23 
 
 		 200 aa  57.8  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0120932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4143  hypothetical protein  24.85 
 
 		 194 aa  57  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1422  hypothetical protein  26.21 
 
 		 177 aa  57  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000667886  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0219  hypothetical protein  27.5 
 
 		 175 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1817  iron permease FTR1  39.36 
 
 		 640 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.214502 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4184  hypothetical protein  28.57 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35994  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0885  cytochrome c, class I  30.85 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.457158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0202  cytochrome c, class I  34.94 
 
 		 647 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01295  hypothetical protein  23.13 
 
 		 231 aa  54.3  0.0000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3000  hypothetical protein  25.6 
 
 		 218 aa  54.3  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000963462 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0163  hypothetical protein  25.83 
 
 		 175 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143101  normal  0.013868 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4590  cytochrome c class I  29.17 
 
 		 388 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4456  cytochrome c class I  29.17 
 
 		 388 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103229  normal  0.67524 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5470  cytochrome c, class I  37.04 
 
 		 631 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.343465  normal  0.0783661 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5945  Pb(II)-uptake protein PbrT  36.17 
 
 		 642 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.925731 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2222  cytochrome c, class I  30.61 
 
 		 395 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000427443  normal  0.28108 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3705  hypothetical protein  29.55 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5282  iron permease FTR1  38.3 
 
 		 642 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1641  iron permease FTR1  38.3 
 
 		 642 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0525  cytochrome c class I  28.12 
 
 		 214 aa  53.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0180  cytochrome c family protein  35.8 
 
 		 636 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.558942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0482  iron permease FTR1  35.11 
 
 		 649 aa  52.4  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0759  cytochrome c, class I  30.59 
 
 		 100 aa  52  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.940622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0021  hypothetical protein  25 
 
 		 175 aa  52  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0049  cytochrome c, class I:Iron permease FTR1  36.14 
 
 		 632 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5350  iron permease FTR1  38.3 
 
 		 640 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.620494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3675  cytochrome c, class I  25.25 
 
 		 393 aa  51.2  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.924475 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0205  cytochrome c class I  34.57 
 
 		 647 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844315 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1760  hypothetical protein  26.53 
 
 		 394 aa  51.2  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00200685 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0291  cytochrome c, class I  31.25 
 
 		 546 aa  51.2  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6226  hypothetical protein  29.27 
 
 		 175 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.185967  normal  0.0332919 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1638  hypothetical protein  24.72 
 
 		 181 aa  50.4  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0654191  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1001  cytochrome c550  30 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1240  iron permease FTR1  32.98 
 
 		 644 aa  49.7  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0480  cytochrome c550  30.48 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.594777  normal  0.0444818 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0292  iron permease FTR1  35.37 
 
 		 629 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3266  cytochrome c class I  25.51 
 
 		 394 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1874  cytochrome c class I  27.66 
 
 		 220 aa  50.1  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0991365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2320  cytochrome c, class I  31.63 
 
 		 702 aa  49.3  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2760  cytochrome c, class I  31.63 
 
 		 702 aa  49.3  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2151  iron permease FTR1  32.98 
 
 		 643 aa  49.7  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.301053  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3931  hypothetical protein  36.46 
 
 		 212 aa  48.9  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119057  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0141  lead uptake protein, putative  36.36 
 
 		 632 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4115  hypothetical protein  25.51 
 
 		 394 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.675645  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4251  hypothetical protein  25.51 
 
 		 394 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0931386  normal  0.175621 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4148  cytochrome c, class I  24.24 
 
 		 393 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782083  normal  0.108785 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0824  cytochrome c class I  28.7 
 
 		 296 aa  48.5  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000780419  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1883  iron permease FTR1  32.99 
 
 		 645 aa  48.1  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.895356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1526  hypothetical protein  21.92 
 
 		 201 aa  48.1  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.859315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1827  cytochrome c, class I  31.25 
 
 		 159 aa  47.8  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2714  cytochrome c, class I  31.71 
 
 		 101 aa  47.8  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.30061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11631  cytochrome cM  35.71 
 
 		 100 aa  47.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.362816  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4339  cytochrome c, class I  23.47 
 
 		 393 aa  47.4  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4349  hypothetical protein  26.61 
 
 		 184 aa  47  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00411477  normal  0.348874 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11621  hypothetical protein  35.71 
 
 		 100 aa  46.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3953  Quinoprotein glucose dehydrogenase  34.57 
 
 		 747 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0832  hypothetical protein  27.46 
 
 		 185 aa  45.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0857853 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0691  hypothetical protein  28.44 
 
 		 165 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0439304  normal  0.48902 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1219  putative bifunctional cbb3-type cytochrome c oxidase subunit II/cytochrome c  28.91 
 
 		 343 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.983776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5620  cytochrome c, mono-and diheme variant-like protein  26.47 
 
 		 398 aa  46.2  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235606 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1041  hypothetical protein  28.05 
 
 		 176 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24091  normal  0.0488069 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2435  cytochrome c class I  30 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2814  cytochrome c class I  27.27 
 
 		 149 aa  45.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.482319  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1425  cytochrome c, class I  30 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2954  iron permease FTR1  30.25 
 
 		 652 aa  45.4  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69300  hypothetical protein  33.77 
 
 		 633 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5821  hypothetical protein  25.23 
 
 		 194 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.272849  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6106  putative cytochrome protein CopT  37.21 
 
 		 254 aa  45.1  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484622  normal  0.0345591 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0963  cytochrome c, class I  35.87 
 
 		 268 aa  45.1  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0745087 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1789  cytochrome c550  28.18 
 
 		 159 aa  44.7  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000264045 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6890  hypothetical protein  24.39 
 
 		 172 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1068  cytochrome cM  34.52 
 
 		 128 aa  44.7  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0435  hypothetical protein  27.84 
 
 		 314 aa  44.3  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0471891 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1058  iron permease FTR1  31.37 
 
 		 683 aa  44.7  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0352795  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2302  iron permease FTR1  32.61 
 
 		 652 aa  44.3  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2415  hypothetical protein  27.47 
 
 		 499 aa  43.9  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00358029  normal  0.14874 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4116  cytochrome c class I  29.35 
 
 		 124 aa  43.9  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.115646 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6249  cytochrome c550  24.41 
 
 		 164 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2522  cytochrome c class I  30.67 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>