96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1798 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_1798  hypothetical protein  100 
 
 
197 aa  401  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.520115  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3598  death-on-curing family protein  79.17 
 
 
328 aa  320  9.000000000000001e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2570  hypothetical protein  73.96 
 
 
210 aa  281  5.000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0685  death-on-curing family protein  70.9 
 
 
324 aa  275  4e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0834  death-on-curing family protein  70.9 
 
 
324 aa  275  4e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.674738 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0194  hypothetical protein  45.5 
 
 
319 aa  179  2e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0381  death-on-curing family protein  46.49 
 
 
332 aa  167  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0280  death-on-curing protein  48.02 
 
 
329 aa  163  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000133606 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0969  hypothetical protein  59.2 
 
 
281 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1420  prophage maintenance system killer protein (DOC)  41.8 
 
 
192 aa  162  3e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1805  death-on-curing protein  44.92 
 
 
337 aa  159  3e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2013  death-on-curing protein  44.07 
 
 
330 aa  158  5e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1123  death-on-curing protein  42.33 
 
 
333 aa  154  9e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.637266 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1889  hypothetical protein  57.14 
 
 
369 aa  150  8.999999999999999e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1373  death-on-curing protein  40 
 
 
336 aa  150  1e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.726784 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0428  hypothetical protein  58.77 
 
 
340 aa  145  5e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0294  hypothetical protein  51.15 
 
 
337 aa  145  5e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0879  death-on-curing family protein  40.91 
 
 
330 aa  143  1e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4076  hypothetical protein  47.11 
 
 
341 aa  144  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0367  hypothetical protein  51.56 
 
 
339 aa  143  1e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3119  putative DNA-binding protein  52 
 
 
342 aa  142  4e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2422  hypothetical protein  56.2 
 
 
334 aa  141  7e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419078  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0243  hypothetical protein  51.94 
 
 
353 aa  141  8e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0032  putative cytoplasmic protein  46.28 
 
 
341 aa  141  8e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4009  hypothetical protein  52.42 
 
 
340 aa  140  8e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1866  putative DNA-binding protein  50.75 
 
 
335 aa  140  9.999999999999999e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1180  virulence protein-like protein  47.58 
 
 
354 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3988  putative cytoplasmic protein  49.19 
 
 
344 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0360  death-on-curing family protein  41.86 
 
 
198 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0259  hypothetical protein  50.41 
 
 
334 aa  139  3e-32  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1490  hypothetical protein  51.24 
 
 
344 aa  137  7e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.507722  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1636  death-on-curing family protein  38.89 
 
 
334 aa  137  7.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4168  hypothetical protein  50.4 
 
 
366 aa  136  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0966  hypothetical protein  48.31 
 
 
355 aa  135  4e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal  0.835513 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3012  hypothetical protein  51.24 
 
 
331 aa  135  4e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410222  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0828  hypothetical protein  48.31 
 
 
355 aa  135  4e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1567  putative DNA-binding protein  50.4 
 
 
356 aa  134  6.0000000000000005e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0208212  unclonable  0.0000160594 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2041  hypothetical protein  50.4 
 
 
350 aa  133  9.999999999999999e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0513  putative DNA-binding protein  42.31 
 
 
291 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.63298  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0131  DNA-binding protein  37.65 
 
 
335 aa  131  7.999999999999999e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.413083 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2347  putative DNA-binding protein  49.18 
 
 
338 aa  130  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.169677  normal  0.0120651 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3353  virulence protein  34.16 
 
 
336 aa  129  3e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0319779  normal  0.0105196 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2544  hypothetical protein  55.93 
 
 
127 aa  129  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.712716  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0354  hypothetical protein  46.02 
 
 
352 aa  127  8.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0007  putative DNA-binding protein  49.18 
 
 
336 aa  127  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.341702  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3721  putative DNA-binding protein  44.09 
 
 
352 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.299367  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2487  hypothetical protein  42.98 
 
 
345 aa  125  4.0000000000000003e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1087  DNA-binding protein  43.08 
 
 
141 aa  125  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.251597 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1500  hypothetical protein  48.39 
 
 
242 aa  124  1e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.510294 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1340  virulence protein  33.54 
 
 
334 aa  123  2e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1469  death-on-curing protein  32.49 
 
 
327 aa  122  3e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.285933  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1215  hypothetical protein  43.51 
 
 
344 aa  121  7e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1093  hypothetical protein  42.74 
 
 
342 aa  120  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0998  hypothetical protein  46.77 
 
 
356 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000328283 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1273  hypothetical protein  50.82 
 
 
126 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2497  hypothetical protein  41.59 
 
 
351 aa  117  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0074171  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0891  hypothetical protein  41.41 
 
 
359 aa  117  9e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  unclonable  0.00000000006304  unclonable  0.000000000000289019 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0640  hypothetical protein  41.59 
 
 
352 aa  117  9.999999999999999e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.914788  normal  0.827759 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4371  hypothetical protein  44.09 
 
 
343 aa  117  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.634323 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0687  putative DNA-binding protein  43.2 
 
 
342 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.30359  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2655  hypothetical protein  41.98 
 
 
352 aa  117  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0598  hypothetical protein  42.75 
 
 
333 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1091  virulence protein-like protein  40.15 
 
 
332 aa  115  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1487  hypothetical protein  44.72 
 
 
358 aa  114  8.999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.011312  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2189  hypothetical protein  41.59 
 
 
353 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3664  putative DNA-binding protein  41.09 
 
 
343 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.676016 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4641  hypothetical protein  39.68 
 
 
333 aa  112  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1243  hypothetical protein  41.59 
 
 
353 aa  112  3e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.568171  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0996  death-on-curing family protein  32.8 
 
 
326 aa  111  7.000000000000001e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1126  RhuM  32.8 
 
 
328 aa  111  7.000000000000001e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52340  cytoplasmic protein  37.61 
 
 
357 aa  108  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2605  virulence protein  32.14 
 
 
365 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4765  hypothetical protein  35.48 
 
 
344 aa  105  5e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0596  hypothetical protein  39.02 
 
 
342 aa  102  3e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2815  hypothetical protein  33.33 
 
 
344 aa  102  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.213356  normal  0.859247 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1214  hypothetical protein  36.72 
 
 
342 aa  102  5e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4082  virulence protein  34.68 
 
 
345 aa  101  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.276809  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4145  virulence protein  34.68 
 
 
345 aa  101  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.373189  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4094  hypothetical protein  33.06 
 
 
256 aa  98.6  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1011  hypothetical protein  62.86 
 
 
81 aa  97.1  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000108458  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0746  hypothetical protein  40 
 
 
350 aa  96.3  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.126739 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2318  Virulence protein-like protein  47.37 
 
 
121 aa  95.5  4e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0348  hypothetical protein  40.52 
 
 
342 aa  92  5e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000520981  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0656  putative virulence protein  39.47 
 
 
135 aa  91.7  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0644  hypothetical protein  40.34 
 
 
144 aa  90.9  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.628012  normal  0.733979 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0293  putative cytoplasmic protein  28.7 
 
 
361 aa  84.7  8e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0821  DNA-binding protein  47.44 
 
 
164 aa  80.5  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.496709  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0780  Virulence protein-like protein  44.74 
 
 
108 aa  72.8  0.000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1749  DNA-binding protein  36.9 
 
 
90 aa  70.1  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2024  hypothetical protein  49.06 
 
 
88 aa  64.3  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.454055 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0339  putative cytoplasmic protein  37.5 
 
 
105 aa  57.8  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3988  death-on-curing family protein  46.3 
 
 
55 aa  57.4  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1807  HTH-type DNA-binding domain/DOC/FIC domain-containing protein  38.89 
 
 
81 aa  52.4  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0821  putative lipoprotein  27.59 
 
 
120 aa  49.3  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1452  putative lipoprotein  27.59 
 
 
120 aa  49.3  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3008  hypothetical protein  37.5 
 
 
77 aa  47.4  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.610277  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>