More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1790 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_1790  NUDIX hydrolase  100 
 
 
154 aa  319  7e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2482  NUDIX hydrolase  77.34 
 
 
138 aa  217  3.9999999999999997e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0910  NUDIX hydrolase  74.02 
 
 
141 aa  211  2.9999999999999995e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.479251  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1931  NUDIX hydrolase  63.08 
 
 
133 aa  174  3e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000285208  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2984  NUDIX hydrolase  60.48 
 
 
136 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000021571  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3270  NUDIX hydrolase  69.05 
 
 
139 aa  167  4e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196596  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0979  NUDIX hydrolase  66.67 
 
 
147 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.353962 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0428  NUDIX hydrolase  51.94 
 
 
138 aa  135  2e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.834318  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3691  NUDIX hydrolase  47.54 
 
 
141 aa  128  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.27613 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0787  NUDIX hydrolase  51.24 
 
 
128 aa  123  8.000000000000001e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.585292  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3078  NUDIX hydrolase  48.03 
 
 
134 aa  118  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3099  mutator protein; oxidative damage repair protein  41.86 
 
 
137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0513  NUDIX hydrolase  46.28 
 
 
138 aa  114  6.9999999999999995e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117627  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2053  MutT/nudix family protein  43.44 
 
 
132 aa  112  3e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.381111  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1921  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 
133 aa  104  3e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.11755  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2516  NUDIX hydrolase  43.9 
 
 
130 aa  105  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2568  NUDIX hydrolase  43.9 
 
 
130 aa  105  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2414  NUDIX hydrolase  43.55 
 
 
126 aa  104  5e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.143725  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1106  NUDIX hydrolase  40.15 
 
 
139 aa  103  9e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000361121  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0356  mutator MutT protein  41.41 
 
 
136 aa  101  5e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2684  CTP pyrophosphohydrolase  36.72 
 
 
134 aa  98.2  4e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00235226  normal  0.16537 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11810  ADP-ribose pyrophosphatase  39.37 
 
 
131 aa  94.4  6e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1617  NUDIX hydrolase  37.01 
 
 
132 aa  93.6  9e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267139  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2447  NUDIX hydrolase  38.02 
 
 
129 aa  92.8  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000652481  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1031  putative mutator mutT protein  39.84 
 
 
131 aa  93.6  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0898  mutator MutT protein, putative  39.84 
 
 
131 aa  93.6  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0730911  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0870  mutator mutT protein  39.66 
 
 
137 aa  89.4  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1486  NUDIX hydrolase  37.4 
 
 
131 aa  87  8e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00282357  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0299  mutator mutT protein  39.18 
 
 
139 aa  86.7  9e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0361617  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2586  NUDIX hydrolase  39.67 
 
 
138 aa  86.7  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1237  NUDIX hydrolase  37.82 
 
 
137 aa  86.7  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  38.21 
 
 
137 aa  86.3  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2457  putative mutT-like protein  42.97 
 
 
147 aa  85.9  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8468  NUDIX hydrolase  38.58 
 
 
130 aa  85.9  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410235  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  36.57 
 
 
142 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11430  ADP-ribose pyrophosphatase  37.8 
 
 
129 aa  85.9  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.250404  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0634  NUDIX hydrolase  37.6 
 
 
143 aa  85.5  3e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2293  mutator MutT protein  37.93 
 
 
129 aa  85.1  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.192428  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  39.83 
 
 
134 aa  84.7  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3838  NUDIX hydrolase  40.8 
 
 
144 aa  84.7  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0218718  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  37.82 
 
 
135 aa  84  6e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2716  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.8 
 
 
133 aa  84  7e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0892  A/G-specific adenine glycosylase  35.61 
 
 
373 aa  84  7e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.243357  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2042  NUDIX hydrolase  38.02 
 
 
129 aa  83.6  8e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000547499 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1775  NUDIX hydrolase  38.33 
 
 
129 aa  83.6  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.296323  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2341  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.89 
 
 
128 aa  83.6  9e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000814495  normal  0.025223 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2086  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.89 
 
 
128 aa  83.6  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.16532  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1977  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.89 
 
 
128 aa  83.6  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000101182  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7592  putative mutator protein mutT  38.46 
 
 
136 aa  83.6  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2204  NUDIX hydrolase  41.27 
 
 
141 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3528  NUDIX hydrolase  37.01 
 
 
138 aa  82.4  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.321169  normal  0.283085 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1983  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.58 
 
 
135 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000136061  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0387  NUDIX hydrolase  37.82 
 
 
129 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3053  NUDIX hydrolase  37.01 
 
 
128 aa  82  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0321786  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2479  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36 
 
 
135 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  37.9 
 
 
151 aa  81.6  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2157  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
129 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2654  NUDIX hydrolase  35.56 
 
 
139 aa  81.3  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2065  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
129 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01728  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36 
 
 
135 aa  81.3  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.10262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1883  NUDIX hydrolase  36 
 
 
135 aa  81.3  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01716  hypothetical protein  36 
 
 
135 aa  81.3  0.000000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.15744  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1873  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36 
 
 
135 aa  81.3  0.000000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.440168  hitchhiker  0.000083786 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1487  NUDIX hydrolase  40.34 
 
 
147 aa  80.9  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000137627 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1430  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36 
 
 
135 aa  80.5  0.000000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.166534  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2519  NUDIX hydrolase  38.02 
 
 
133 aa  80.1  0.000000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1687  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.86 
 
 
140 aa  79.7  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1170  NUDIX hydrolase  36.13 
 
 
137 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000110534  normal  0.0271169 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  37.21 
 
 
360 aa  79.7  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  38.79 
 
 
132 aa  80.1  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  39.83 
 
 
132 aa  79  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0388  mutator MutT protein  40.71 
 
 
138 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  39.83 
 
 
132 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  39.83 
 
 
132 aa  79  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5502  NUDIX hydrolase  36.21 
 
 
134 aa  79.3  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.985254 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1843  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.2 
 
 
135 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.910246  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0482  NUDIX hydrolase  36.13 
 
 
150 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  37.82 
 
 
137 aa  78.6  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  36.97 
 
 
135 aa  78.6  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  36.13 
 
 
138 aa  78.2  0.00000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  36.13 
 
 
138 aa  78.2  0.00000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2289  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 
132 aa  77.8  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.648467  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0742  NUDIX hydrolase  39.06 
 
 
169 aa  77.4  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.478674 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2201  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 
132 aa  77.4  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4321  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
291 aa  77.4  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3770  NUDIX hydrolase  39.34 
 
 
200 aa  77  0.00000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.288059 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0110  NUDIX hydrolase  36.97 
 
 
133 aa  77  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1712  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 
138 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148507  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4811  NUDIX hydrolase  40.18 
 
 
138 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.304627  decreased coverage  0.0000674364 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  36.13 
 
 
137 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1547  NUDIX hydrolase  34.45 
 
 
334 aa  75.9  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  34.45 
 
 
138 aa  75.5  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  33.33 
 
 
352 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1657  NUDIX hydrolase  32.82 
 
 
132 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.809555  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  36.64 
 
 
383 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0312  mutator MutT protein  40.91 
 
 
138 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.672809  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0523  NUDIX hydrolase  36.13 
 
 
133 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1106  NUDIX hydrolase  41.38 
 
 
145 aa  75.9  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00400603  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0356  mutator MutT protein  40.91 
 
 
138 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0223709  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1154  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
124 aa  75.9  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.271981  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>