More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1782 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_1782  integral membrane protein TerC  100 
 
 
248 aa  491  1e-138  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.72493 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1336  TerC family membrane protein  84.49 
 
 
245 aa  394  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120091  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0899  integral membrane protein TerC  80.08 
 
 
257 aa  385  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  4.07273e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1936  Integral membrane protein TerC  77.42 
 
 
250 aa  383  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00215857  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2281  Integral membrane protein TerC  77.42 
 
 
250 aa  369  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.95379e-06 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0786  integral membrane protein TerC  78.78 
 
 
253 aa  366  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0111606  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3668  integral membrane protein TerC  65.99 
 
 
259 aa  334  9e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.424271  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1505  integral membrane protein TerC  68.72 
 
 
244 aa  322  4e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0655  Integral membrane protein TerC  67.34 
 
 
253 aa  322  4e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0238  integral membrane protein TerC  63.56 
 
 
252 aa  317  8e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.606793  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2706  integral membrane protein TerC  65.06 
 
 
255 aa  317  1e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  2.4631e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2234  integral membrane protein TerC  64.9 
 
 
247 aa  314  1e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2105  integral membrane protein TerC  62.65 
 
 
250 aa  307  1e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2148  Integral membrane protein TerC  60 
 
 
250 aa  304  7e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.252885  normal  0.0306348 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0273  integral membrane protein TerC  63.45 
 
 
241 aa  304  8e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0052  integral membrane protein TerC  62.15 
 
 
253 aa  304  9e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.418667 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0299  hypothetical protein  62.25 
 
 
251 aa  302  3e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.481455  hitchhiker  7.10089e-05 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0026  protein YegH  64.1 
 
 
238 aa  301  6e-81  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3292  integral membrane protein TerC  61.48 
 
 
248 aa  301  7e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.604318 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2223  Integral membrane protein TerC  62.1 
 
 
259 aa  296  2e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1686  TerC protein  62.13 
 
 
239 aa  293  2e-78  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1926  integral membrane protein TerC  59.34 
 
 
249 aa  290  1e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.615249  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1919  Integral membrane protein TerC  60.49 
 
 
253 aa  288  5e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.996169 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1505  protein YegH  60 
 
 
246 aa  288  7e-77  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  6.14006e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0055  Integral membrane protein TerC  62.4 
 
 
253 aa  286  2e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0051  integral membrane protein TerC  62.8 
 
 
253 aa  285  3e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.653903  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4337  Integral membrane protein TerC  60.73 
 
 
295 aa  285  5e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0067  Integral membrane protein TerC  62 
 
 
253 aa  284  7e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.645865  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1725  Integral membrane protein TerC  62.4 
 
 
268 aa  280  1e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9165  integral membrane protein TerC  62.6 
 
 
254 aa  280  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.870486  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2160  integral membrane protein TerC  65.29 
 
 
249 aa  279  3e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4229  Integral membrane protein TerC  62.2 
 
 
264 aa  279  4e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0769944  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1601  integral membrane protein TerC  56.07 
 
 
250 aa  278  8e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2953  Integral membrane protein TerC  59.76 
 
 
258 aa  275  4e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  3.21183e-07  unclonable  3.29078e-08 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1753  hypothetical protein  62.65 
 
 
253 aa  275  6e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1787  S-adenosylmethionine synthetase (methionineadenosyltransferase; AdoMet synthetase; MAT)  60.26 
 
 
241 aa  273  1e-72  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5729  Integral membrane protein TerC  61.63 
 
 
249 aa  274  1e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0901  Integral membrane protein TerC  58.72 
 
 
238 aa  268  7e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00975959  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2490  Integral membrane protein TerC  62.24 
 
 
251 aa  268  7e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6267  hypothetical protein  57.87 
 
 
254 aa  268  8e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47510  integral membrane protein  59.04 
 
 
252 aa  267  1e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2087  Integral membrane protein TerC  64.05 
 
 
248 aa  267  1e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2187  Integral membrane protein TerC  62.04 
 
 
245 aa  265  6e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.574145  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1180  integral membrane protein TerC  60.17 
 
 
241 aa  265  8e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  8.73859e-07 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49600  Integral membrane protein TerC family  57.61 
 
 
248 aa  263  3e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0164  integral membrane protein TerC  57.32 
 
 
256 aa  262  3e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.665926 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3094  integral membrane protein TerC  55.08 
 
 
518 aa  261  5e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.403437  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3874  integral membrane protein TerC  57.26 
 
 
253 aa  261  7e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0146  integral membrane protein TerC  58.13 
 
 
265 aa  261  8e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.125302 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0162  integral membrane protein TerC  57.72 
 
 
256 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5081  integral membrane protein TerC  59.23 
 
 
256 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0792895 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0787  integral membrane protein TerC  59.92 
 
 
256 aa  259  3e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.792989 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2326  integral membrane protein TerC  52.02 
 
 
523 aa  258  5e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0032  integral membrane protein TerC  55.92 
 
 
255 aa  258  9e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.43134  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3437  CBS domain-containing protein  52.02 
 
 
523 aa  258  9e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527422  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3020  Integral membrane protein TerC  56.84 
 
 
238 aa  257  1e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000258386  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3200  Integral membrane protein TerC  59.24 
 
 
238 aa  255  4e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5995  hypothetical protein  59.27 
 
 
252 aa  255  5e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2499  integral membrane protein TerC  51.61 
 
 
523 aa  254  6e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0124068  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2436  integral membrane protein TerC  51.81 
 
 
523 aa  254  6e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3038  Integral membrane protein TerC  55.02 
 
 
577 aa  254  6e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69320  putative integral membrane transport protein  59.68 
 
 
252 aa  254  7e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0038  Integral membrane protein TerC  56.9 
 
 
249 aa  253  3e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1293  Integral membrane protein TerC  54.39 
 
 
528 aa  252  5e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3826  integral membrane protein TerC  57.38 
 
 
238 aa  252  5e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  6.78399e-05  normal  0.474132 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2979  TerC family integral membrane protein  57.87 
 
 
237 aa  251  9e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  7.02037e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3152  TerC family integral membrane protein  57.87 
 
 
237 aa  251  9e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  2.51436e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0883  integral membrane protein TerC  57.87 
 
 
237 aa  251  9e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0104396  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0858  Integral membrane protein TerC  57.87 
 
 
237 aa  251  9e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  3.83082e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4099  integral membrane protein, TerC family  57.87 
 
 
237 aa  251  9e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  1.2685e-06  hitchhiker  0.00127098 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3030  integral membrane protein, TerC family  57.87 
 
 
237 aa  251  9e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.30968e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02641  hypothetical protein  57.87 
 
 
237 aa  251  9e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  4.21681e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2980  TerC family integral membrane protein  57.87 
 
 
237 aa  251  9e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  2.9602e-05  normal  0.0103566 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02680  predicted inner membrane protein  57.87 
 
 
237 aa  251  9e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  4.74889e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72180  putative membrane protein TerC  57.87 
 
 
254 aa  250  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.559812  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2342  CBS:transporter-associated region:integral membrane protein TerC  52.72 
 
 
522 aa  250  1e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.112753 
 
 
-
 
NC_004310  BR1332  CBS domain-containing protein  54.01 
 
 
518 aa  250  1e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3234  hypothetical protein  57.87 
 
 
237 aa  249  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00228616  hitchhiker  9.95784e-07 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3219  hypothetical protein  57.87 
 
 
237 aa  249  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0516172  hitchhiker  0.00113241 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2812  integral membrane protein TerC  52.03 
 
 
514 aa  249  3e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0276679 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3334  hypothetical protein  57.87 
 
 
237 aa  249  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00486837  hitchhiker  0.00634804 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3171  protein YegH  57.87 
 
 
237 aa  249  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00710454  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3153  protein YegH  57.87 
 
 
237 aa  249  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  1.96217e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2806  integral membrane protein TerC  50.63 
 
 
242 aa  248  5e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.225648  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2220  Integral membrane protein TerC  52.23 
 
 
518 aa  248  6e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1292  CBS domain-containing protein  53.59 
 
 
522 aa  248  8e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2532  membrane protein, TerC family  51.88 
 
 
522 aa  247  1e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11570  Integral membrane protein, TerC family  54.24 
 
 
518 aa  247  1e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1762  integral membrane protein TerC  55.26 
 
 
530 aa  246  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171934  normal  0.106093 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2045  integral membrane protein TerC  56.77 
 
 
241 aa  245  4e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.7344  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1580  integral membrane protein TerC  53.25 
 
 
528 aa  244  1e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.424407  normal  0.735145 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4909  Integral membrane protein TerC  55.41 
 
 
250 aa  244  1e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.240908  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2868  Integral membrane protein TerC  53.51 
 
 
529 aa  243  1e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2948  Integral membrane protein TerC  54.62 
 
 
240 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1852  integral membrane protein TerC  54.74 
 
 
522 aa  240  2e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3663  integral membrane protein TerC  53.95 
 
 
510 aa  240  2e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1505  integral membrane protein TerC  56.07 
 
 
241 aa  240  2e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0874873 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2677  integral membrane protein TerC  52.84 
 
 
527 aa  239  3e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.15378 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3192  CBS domain-containing protein  53.71 
 
 
528 aa  239  3e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.237895  hitchhiker  0.00326333 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2549  integral membrane protein TerC  53.71 
 
 
528 aa  239  3e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.584861  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>