36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1763 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1763  hypothetical protein  100 
 
 		 183 aa  370  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.4783800000000001e-18  normal  0.040844 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1247  hypothetical protein  63.47 
 
 		 188 aa  186  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2496  hypothetical protein  50.79 
 
 		 188 aa  186  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000377569  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3620  hypothetical protein  47.87 
 
 		 184 aa  153  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.794068  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0384  hypothetical protein  38.16 
 
 		 202 aa  127  7.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2263  hypothetical protein  42.08 
 
 		 213 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000459083  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3095  hypothetical protein  41.38 
 
 		 214 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1180  hypothetical protein  39.77 
 
 		 232 aa  101  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0953  hypothetical protein  40.65 
 
 		 195 aa  99.8  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.585982 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3294  hypothetical protein  38.12 
 
 		 203 aa  97.4  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157417  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3170  hypothetical protein  41.28 
 
 		 187 aa  90.1  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1752  hypothetical protein  36.64 
 
 		 173 aa  90.1  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000963449  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0232  hypothetical protein  50 
 
 		 189 aa  88.6  5e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.12225  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1092  hypothetical protein  42.86 
 
 		 180 aa  86.7  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0908  hypothetical protein  45.65 
 
 		 174 aa  84.7  6e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000542792  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1038  hypothetical protein  43.96 
 
 		 135 aa  83.6  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0131  hypothetical protein  41.94 
 
 		 213 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0766  hypothetical protein  37.29 
 
 		 255 aa  82.8  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00180926  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1040  hypothetical protein  50.63 
 
 		 174 aa  82.8  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.194155  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1359  hypothetical protein  36 
 
 		 182 aa  82.4  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0526065  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1431  hypothetical protein  43.48 
 
 		 145 aa  82.4  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000637648  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1035  hypothetical protein  50.63 
 
 		 177 aa  82  0.000000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.214662  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1042  hypothetical protein  30.89 
 
 		 288 aa  79  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0835293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1496  hypothetical protein  34.59 
 
 		 353 aa  71.6  0.000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1442  hypothetical protein  33.33 
 
 		 265 aa  70.9  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.658193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1497  hypothetical protein  42.71 
 
 		 170 aa  65.9  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.844823  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1260  hypothetical protein  29.21 
 
 		 267 aa  63.9  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.541563  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1095  hypothetical protein  37.04 
 
 		 171 aa  63.2  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000152193  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2248  hypothetical protein  31.07 
 
 		 165 aa  62  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000924261  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0782  hypothetical protein  38.68 
 
 		 177 aa  57.4  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.674637  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1978  hypothetical protein  27.84 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1053  hypothetical protein  29.32 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.308187 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0935  hypothetical protein  29.32 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.879201  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3436  hypothetical protein  27.92 
 
 		 283 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4081  hypothetical protein  29.37 
 
 		 273 aa  42.4  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000218694  normal  0.0348171 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1284  hypothetical protein  31.33 
 
 		 128 aa  40.8  0.01  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000190603  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>