139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1746 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_1746  hypothetical protein  100 
 
 
324 aa  658    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.227035 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1230  hypothetical protein  67.19 
 
 
320 aa  449  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2289  hypothetical protein  56.6 
 
 
320 aa  384  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3116  protein of unknown function DUF534  52.27 
 
 
309 aa  347  2e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1146  protein of unknown function DUF534  51.37 
 
 
292 aa  332  5e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0867  hypothetical protein  30.69 
 
 
317 aa  137  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4046  protein of unknown function DUF534  27.57 
 
 
317 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0325  hypothetical protein  30.03 
 
 
337 aa  130  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000093059  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4553  protein of unknown function DUF534  28.19 
 
 
329 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3723  protein of unknown function DUF534  27.24 
 
 
317 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0619  hypothetical protein  30.88 
 
 
321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1974  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.45 
 
 
321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2053  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  30 
 
 
321 aa  127  3e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3067  hypothetical protein  26.75 
 
 
317 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002970  ABC transporter substrate-binding protein  30.3 
 
 
321 aa  123  5e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02940  hypothetical protein  30.53 
 
 
322 aa  122  8e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0047  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.31 
 
 
327 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2828  protein of unknown function DUF534  29.72 
 
 
341 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000067856  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2867  hypothetical protein  27.76 
 
 
316 aa  114  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2218  hypothetical protein  27.14 
 
 
321 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.792913  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2831  hypothetical protein  27.14 
 
 
321 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2842  hypothetical protein  27.14 
 
 
321 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.838657  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1712  hypothetical protein  26.76 
 
 
343 aa  112  9e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6161  hypothetical protein  27.14 
 
 
321 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0472  hypothetical protein  26.67 
 
 
321 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.997143 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0522  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.3 
 
 
323 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0210  hypothetical protein  29.77 
 
 
320 aa  109  6e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0440  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  26.3 
 
 
323 aa  109  6e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.173038  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19990  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  25.7 
 
 
325 aa  108  9.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  9.09791e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0687  hypothetical protein  25.93 
 
 
323 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.695936  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2106  hypothetical protein  26.69 
 
 
323 aa  108  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.363313  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0109  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.93 
 
 
323 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1479  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.93 
 
 
323 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0505  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.93 
 
 
323 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2907  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.93 
 
 
323 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0708  protein of unknown function DUF534  27.8 
 
 
315 aa  108  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14390  putative ABC-type transport protein, periplasmic c  26.01 
 
 
325 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1277  ABC transporter periplasmic protein  25.68 
 
 
325 aa  106  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3140  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  25.56 
 
 
323 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.226285  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1461  protein of unknown function DUF534  26.94 
 
 
326 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  hitchhiker  0.000000785059 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1315  hypothetical protein  27.74 
 
 
322 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.710416  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2364  protein of unknown function DUF534  29.24 
 
 
328 aa  103  3e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000124724  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1740  putative signal peptide protein  27.63 
 
 
329 aa  103  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.324025  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1502  protein of unknown function DUF534  26.2 
 
 
326 aa  103  6e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0497356  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0821  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  25.71 
 
 
319 aa  102  7e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0105624 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1949  protein of unknown function DUF534  25.25 
 
 
323 aa  102  8e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.325569  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2584  protein of unknown function DUF534  26.87 
 
 
322 aa  102  9e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.78214e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1211  hypothetical protein  26.28 
 
 
323 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0959108 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1949  hypothetical protein  27.53 
 
 
322 aa  100  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.521982  normal  0.530099 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0723  protein of unknown function DUF534  27.69 
 
 
332 aa  100  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000763859  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1435  ABC transporter, substrate-binding protein  24.92 
 
 
341 aa  99.8  5e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.457922 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2840  hypothetical protein  23.43 
 
 
329 aa  99.4  7e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146979  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1089  hypothetical protein  22.71 
 
 
324 aa  99  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.623165  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1599  hypothetical protein  24.92 
 
 
341 aa  97.8  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.164938  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0079  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  21.77 
 
 
334 aa  97.8  2e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0035536  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1750  protein of unknown function DUF534  26.83 
 
 
322 aa  98.2  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2856  protein of unknown function DUF534  26.22 
 
 
337 aa  97.8  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1473  protein of unknown function DUF534  24.82 
 
 
335 aa  97.8  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2161  protein of unknown function DUF534  21.45 
 
 
324 aa  97.1  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.321904 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0249  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  22.08 
 
 
584 aa  97.4  3e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1155  ABC transporter substrate-binding protein  23.88 
 
 
333 aa  96.7  5e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000138162  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03810  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  28.57 
 
 
336 aa  96.7  5e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3141  hypothetical protein  26.83 
 
 
344 aa  95.9  8e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.774643 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1098  hypothetical protein  25.61 
 
 
313 aa  95.9  9e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1817  hypothetical protein  24.37 
 
 
331 aa  95.5  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00011469  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0736  protein of unknown function DUF534  27.24 
 
 
332 aa  95.5  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000204583 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2227  hypothetical protein  25.54 
 
 
338 aa  95.1  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00471107  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0258  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  23.62 
 
 
347 aa  93.6  4e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000182856  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4311  hypothetical protein  24.08 
 
 
323 aa  92  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2365  protein of unknown function DUF534  25.78 
 
 
331 aa  91.3  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00100062  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2078  protein of unknown function/lipoprotein, putative  23.28 
 
 
320 aa  89.7  5e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000317435  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1189  hypothetical protein  25.09 
 
 
334 aa  89  9e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00418408  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1947  protein of unknown function DUF534  23.69 
 
 
327 aa  89  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.734312  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3978  hypothetical protein  27.76 
 
 
328 aa  86.3  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.890464  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0267  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  23.21 
 
 
359 aa  85.9  9e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0239321  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0251  protein of unknown function DUF534  22.91 
 
 
320 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00303449  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0039  putative ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  26.34 
 
 
327 aa  84.3  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2904  hypothetical protein  23.93 
 
 
320 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0853596  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2038  hypothetical protein  25.38 
 
 
324 aa  83.6  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0401201 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2494  hypothetical protein  23.84 
 
 
340 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2525  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  26.28 
 
 
352 aa  82  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.285848  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0657  protein of unknown function DUF534  24.09 
 
 
330 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.342868  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2388  protein of unknown function DUF534  28.52 
 
 
326 aa  79.3  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382961  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0026  hypothetical protein  25.35 
 
 
328 aa  79  0.0000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.35198  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1569  hypothetical protein  23.53 
 
 
270 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1434  ABC transporter, substrate-binding protein  23.69 
 
 
349 aa  76.3  0.0000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.681297 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0747  protein of unknown function DUF534  24.25 
 
 
319 aa  76.3  0.0000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.99763e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1505  hypothetical protein  26 
 
 
640 aa  74.7  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1052  hypothetical protein  28.57 
 
 
354 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0655813  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0042  protein of unknown function DUF534  21.95 
 
 
322 aa  73.9  0.000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.920382  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1116  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  25.17 
 
 
344 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1113  hypothetical protein  24.3 
 
 
344 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0994451  normal  0.363021 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7008  hypothetical protein  27.31 
 
 
328 aa  72.8  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5660  hypothetical protein  25 
 
 
325 aa  72.8  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.857486  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1598  hypothetical protein  23.9 
 
 
349 aa  71.6  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108913  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2818  putative ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  25.2 
 
 
326 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4371  hypothetical protein  25.23 
 
 
331 aa  72.4  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2646  protein of unknown function DUF534  22.34 
 
 
329 aa  71.6  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5292  hypothetical protein  27.18 
 
 
327 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.562532  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2884  hypothetical protein  24.65 
 
 
365 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>