More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1686 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_1686  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
220 aa  457  9.999999999999999e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000734571  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3616  glycosyl transferase family protein  69.09 
 
 
222 aa  332  3e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00297369  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2209  glycosyl transferase family 2  68.64 
 
 
220 aa  326  2.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0245  glycosyl transferase, group 2 family protein  70.91 
 
 
220 aa  322  3e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1247  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  38.32 
 
 
270 aa  150  2e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1217  glycosyl transferase family protein  38.32 
 
 
274 aa  150  2e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.906875  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02881  glycosyltransferase  36.49 
 
 
273 aa  146  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03835  dolichyl-phosphate mannose synthase-like protein  32.44 
 
 
397 aa  134  9.999999999999999e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.125771  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1872  glycosyl transferase family 2  34.3 
 
 
401 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803329  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2653  glycosyltransferase  37.44 
 
 
389 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2109  b-glycosyltransferase  33.18 
 
 
400 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0591091  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0471  glycosyl transferase family 2  39.73 
 
 
246 aa  126  3e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1079  glycosyl transferase family protein  29.44 
 
 
395 aa  125  7e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1984  glycosyl transferase family 2  32.76 
 
 
386 aa  124  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0480  glycosyl transferase family 2  30.09 
 
 
377 aa  113  2.0000000000000002e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0370888  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1061  glycosyl transferase family 2  33.18 
 
 
448 aa  112  4.0000000000000004e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0400  glycosyl transferase family protein  32.98 
 
 
344 aa  109  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156434  normal  0.0492083 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0985  cell wall biogenesis glycosyltransferase  29.11 
 
 
247 aa  107  1e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3842  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.66 
 
 
253 aa  106  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.42785 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0165  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 
321 aa  103  3e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000128177 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2408  glycosyl transferase family 2  32.99 
 
 
293 aa  102  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2302  glycosyl transferase family protein  30.93 
 
 
287 aa  102  5e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2098  glycosyl transferase family 2  31.72 
 
 
234 aa  101  7e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32660  glycosyl transferase  33.48 
 
 
377 aa  102  7e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2413  glycosyl transferase family 2  34.43 
 
 
243 aa  101  8e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.367693 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0417  glycosyl transferase family protein  32.31 
 
 
230 aa  100  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.304436  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2396  glycosyl transferase family protein  31.36 
 
 
313 aa  99.8  3e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2568  glycosyl transferase family 2  32.29 
 
 
250 aa  98.6  7e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.238514  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2933  glycosyl transferase family 2  32.14 
 
 
355 aa  98.2  8e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.175593 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1238  glycosyl transferase family protein  34.08 
 
 
340 aa  97.1  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0299197  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0418  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
230 aa  96.3  3e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0496978  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1501  glycosyl transferase family protein  33.7 
 
 
230 aa  96.3  3e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0720079  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0347  glycosyl transferase family protein  30.04 
 
 
606 aa  95.9  4e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0345  dolichol-phosphate mannosyltransferase  28.86 
 
 
266 aa  95.5  5e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.855294  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3898  glycosyl transferase family 2  33.93 
 
 
285 aa  95.5  5e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2133  glycosyl transferase family 2  34.02 
 
 
340 aa  95.5  6e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0441778  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3224  glycosyltransferase  32.03 
 
 
374 aa  95.1  7e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2228  glycosyl transferase family protein  31.75 
 
 
229 aa  94.7  8e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000017115 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0044  glycosyltransferase  28.31 
 
 
352 aa  94.7  9e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117079  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3050  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 
227 aa  94.7  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1311  glycosyl transferase family 2  29.44 
 
 
261 aa  94.4  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3250  glycosyl transferase family 2  36.41 
 
 
245 aa  94.7  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0680662  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1276  glycosyl transferase family 2  33.17 
 
 
246 aa  94.4  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0381743  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3384  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.44 
 
 
552 aa  94.4  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3099  glycosyl transferase family protein  29.8 
 
 
232 aa  94.4  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000071788  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004069  acyltransferase  30.67 
 
 
568 aa  93.6  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1230  glycosyl transferase family 2  34.02 
 
 
340 aa  93.6  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3149  glycosyl transferase family 2  36.41 
 
 
245 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.754874  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2592  glycosyl transferase family 2  35.23 
 
 
235 aa  94  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1919  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.03 
 
 
241 aa  92.8  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000025482  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3681  glycosyl transferase family protein  30.57 
 
 
610 aa  93.2  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0221  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.73 
 
 
260 aa  93.2  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.746242  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0794  glycosyl transferase family 2  32.74 
 
 
291 aa  92.4  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0345  glycosyl transferase family protein  30.57 
 
 
610 aa  92.8  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0276  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  26.7 
 
 
245 aa  92.4  4e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.50271  decreased coverage  0.0000266916 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5753  glycosyl transferase family 2  28.1 
 
 
246 aa  92.8  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3051  glycosyl transferase family protein  36.92 
 
 
245 aa  92.4  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1925  glycosyl transferase family 2  30.65 
 
 
242 aa  92.4  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000240959  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0734  glycosyl transferase family protein  31.12 
 
 
230 aa  92  6e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0939265  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1821  glycosyl transferase family protein  35.9 
 
 
237 aa  92  6e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0335  glycosyl transferase family protein  31.39 
 
 
619 aa  92  6e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0337  glycosyl transferase family protein  31.39 
 
 
619 aa  92  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2339  glycosyl transferase family 2  29.61 
 
 
248 aa  92  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.231367  normal  0.416225 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4601  glycosyl transferase family protein  29.69 
 
 
567 aa  91.7  8e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228674 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0441  glycosyl transferase family protein  31.39 
 
 
629 aa  91.7  8e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2355  glycosyl transferase family 2  33.95 
 
 
250 aa  91.7  9e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.024577  hitchhiker  0.0000348766 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3039  methyltransferase type 12  30.63 
 
 
578 aa  91.3  9e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0345  glycosyl transferase family 2  30.94 
 
 
623 aa  91.3  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00259601 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3516  glycosyl transferase family protein  30.94 
 
 
572 aa  90.9  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0336  glycosyl transferase family protein  30.13 
 
 
606 aa  90.9  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2691  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.43 
 
 
262 aa  90.9  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.58271  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5097  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.73 
 
 
244 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0433  glycosyl transferase family protein  31.8 
 
 
244 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.310079  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1831  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.19 
 
 
232 aa  90.5  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.298246  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1132  dolichol-phosphate mannosyltransferase  34.03 
 
 
299 aa  90.5  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0997  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 
226 aa  90.1  2e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0342  glycosyl transferase family protein  30.57 
 
 
619 aa  90.1  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1323  glycosyl transferase family protein  29.19 
 
 
247 aa  90.9  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000286825  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2177  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.87 
 
 
536 aa  90.5  2e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000219359  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4373  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.69 
 
 
594 aa  90.1  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08600  glycosyl transferase  31.98 
 
 
225 aa  89.7  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.36917 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4051  glycosyl transferase family 2  29.52 
 
 
251 aa  89.7  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3168  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 
299 aa  89.7  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.912354  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0554  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29 
 
 
241 aa  89.7  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0490  glycosyl transferase family protein  29.38 
 
 
230 aa  89.4  3e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.49136  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3007  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.66 
 
 
246 aa  89.4  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0582425 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0895  glycosyl transferase family protein  32.29 
 
 
572 aa  89.4  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.661363  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5220  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 
242 aa  89  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1789  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.56 
 
 
239 aa  88.6  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3944  glycosyl transferase family protein  26.76 
 
 
242 aa  88.6  7e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3893  glycosyl transferase family protein  30.7 
 
 
585 aa  88.6  8e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0220  glycosyl transferase family 2  32.12 
 
 
353 aa  88.2  8e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0972  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.27 
 
 
535 aa  88.2  8e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000724117  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  28.97 
 
 
298 aa  88.2  9e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0396  glycosyl transferase family protein  27.89 
 
 
229 aa  87.4  1e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.54121  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0320  glycosyl transferase family protein  29.15 
 
 
567 aa  87.4  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187922 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5098  glycosyl transferase family protein  30.48 
 
 
336 aa  87.4  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1007  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.88 
 
 
238 aa  86.7  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000779145  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0184  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.94 
 
 
249 aa  86.7  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0888944  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0752  glycosyl transferase family protein  32.34 
 
 
243 aa  86.3  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000917436  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>