More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1605 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  85.75 
 
 		 415 aa  747    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  93 
 
 		 415 aa  800    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  86.47 
 
 		 415 aa  751    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  78.43 
 
 		 416 aa  674    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 415 aa  846    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  86.23 
 
 		 415 aa  751    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  85.3 
 
 		 415 aa  748    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  84.43 
 
 		 413 aa  729    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1719  serine hydroxymethyltransferase  68.37 
 
 		 412 aa  593  1e-168  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  70.02 
 
 		 410 aa  594  1e-168  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  69.78 
 
 		 410 aa  591  1e-168  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1854  serine hydroxymethyltransferase  72.52 
 
 		 412 aa  585  1e-166  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3097  serine hydroxymethyltransferase  71.78 
 
 		 412 aa  587  1e-166  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0175089 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  68.22 
 
 		 415 aa  586  1e-166  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  67.88 
 
 		 412 aa  583  1.0000000000000001e-165  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  67.96 
 
 		 418 aa  582  1.0000000000000001e-165  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  67.88 
 
 		 412 aa  583  1.0000000000000001e-165  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1241  glycine hydroxymethyltransferase  65.37 
 
 		 414 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  69.02 
 
 		 411 aa  578  1e-164  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16130  Glycine hydroxymethyltransferase  67.89 
 
 		 412 aa  580  1e-164  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2432  serine hydroxymethyltransferase  72.68 
 
 		 412 aa  580  1e-164  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.139104  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  68.45 
 
 		 413 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1463  glycine hydroxymethyltransferase  64.55 
 
 		 415 aa  574  1.0000000000000001e-163  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5165  serine hydroxymethyltransferase  68.46 
 
 		 414 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104225  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  68.46 
 
 		 414 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  68.7 
 
 		 414 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5114  serine hydroxymethyltransferase  68.45 
 
 		 413 aa  574  1.0000000000000001e-163  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000619413  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  68.2 
 
 		 413 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  68.54 
 
 		 413 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  69.48 
 
 		 417 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020982  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  68.2 
 
 		 413 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129833  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  67.32 
 
 		 412 aa  576  1.0000000000000001e-163  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1813  serine hydroxymethyltransferase  64.15 
 
 		 414 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  67.8 
 
 		 412 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2836  serine hydroxymethyltransferase  68.3 
 
 		 417 aa  575  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.359128  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  68.78 
 
 		 413 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2928  serine hydroxymethyltransferase  68.8 
 
 		 417 aa  577  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  68.05 
 
 		 413 aa  571  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2316  serine hydroxymethyltransferase  65.29 
 
 		 412 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1680  serine hydroxymethyltransferase  64.39 
 
 		 412 aa  572  1.0000000000000001e-162  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0810  serine hydroxymethyltransferase  67.8 
 
 		 414 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.210619  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  67.72 
 
 		 413 aa  571  1.0000000000000001e-162  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2744  serine hydroxymethyltransferase  68.55 
 
 		 417 aa  574  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0064  serine hydroxymethyltransferase  70.07 
 
 		 412 aa  569  1e-161  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0031  Glycine hydroxymethyltransferase  67.57 
 
 		 420 aa  570  1e-161  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2733  serine hydroxymethyltransferase  67.32 
 
 		 417 aa  565  1e-160  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1377  glycine hydroxymethyltransferase  65.45 
 
 		 411 aa  567  1e-160  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1418  serine hydroxymethyltransferase  66.42 
 
 		 420 aa  561  1.0000000000000001e-159  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0614522  normal  0.461409 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1617  serine hydroxymethyltransferase  69.06 
 
 		 414 aa  558  1e-158  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  64.15 
 
 		 412 aa  558  1e-158  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0686  serine hydroxymethyltransferase  64.44 
 
 		 424 aa  559  1e-158  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.138461  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1094  serine hydroxymethyltransferase  64.63 
 
 		 417 aa  555  1e-157  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.383314 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1160  serine hydroxymethyltransferase  64.88 
 
 		 417 aa  556  1e-157  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  64.39 
 
 		 413 aa  555  1e-157  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1094  serine hydroxymethyltransferase  64.88 
 
 		 417 aa  556  1e-157  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.412028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2147  glycine hydroxymethyltransferase  66.67 
 
 		 415 aa  553  1e-156  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40970  serine hydroxymethyltransferase  65.28 
 
 		 417 aa  552  1e-156  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1209  serine hydroxymethyltransferase  64.39 
 
 		 417 aa  553  1e-156  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2390  serine hydroxymethyltransferase  67 
 
 		 416 aa  554  1e-156  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0832592 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1014  serine hydroxymethyltransferase  64.15 
 
 		 417 aa  552  1e-156  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3305  serine hydroxymethyltransferase  64.39 
 
 		 417 aa  554  1e-156  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.297219  hitchhiker  0.000907019 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3162  serine hydroxymethyltransferase  64.15 
 
 		 417 aa  552  1e-156  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.911286  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1185  serine hydroxymethyltransferase  63.9 
 
 		 417 aa  554  1e-156  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3161  serine hydroxymethyltransferase  64.15 
 
 		 417 aa  551  1e-156  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.261571  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0573  serine hydroxymethyltransferase  63.9 
 
 		 417 aa  551  1e-155  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3471  serine hydroxymethyltransferase  64.15 
 
 		 417 aa  550  1e-155  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0759  serine hydroxymethyltransferase  64.48 
 
 		 417 aa  549  1e-155  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2780  serine hydroxymethyltransferase  63.9 
 
 		 417 aa  550  1e-155  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1025  serine hydroxymethyltransferase  64.08 
 
 		 422 aa  550  1e-155  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1142  serine hydroxymethyltransferase  63.75 
 
 		 417 aa  548  1e-155  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.510367  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0207  serine hydroxymethyltransferase  65.16 
 
 		 427 aa  549  1e-155  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0209  serine hydroxymethyltransferase  65.16 
 
 		 427 aa  550  1e-155  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0671  serine hydroxymethyltransferase  63.99 
 
 		 417 aa  544  1e-154  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.557812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0902  serine hydroxymethyltransferase  63.55 
 
 		 416 aa  545  1e-154  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0085  serine hydroxymethyltransferase  64.98 
 
 		 422 aa  545  1e-154  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1344  serine hydroxymethyltransferase  64.72 
 
 		 417 aa  545  1e-154  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.538197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2082  serine hydroxymethyltransferase  64.48 
 
 		 419 aa  545  1e-154  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000584892  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0702  serine hydroxymethyltransferase  63.99 
 
 		 417 aa  544  1e-154  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0603318  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2392  glycine hydroxymethyltransferase  64.13 
 
 		 415 aa  546  1e-154  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60890  serine hydroxymethyltransferase  64.23 
 
 		 417 aa  546  1e-154  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3162  serine hydroxymethyltransferase  64.71 
 
 		 413 aa  543  1e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.243328  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0253  serine hydroxymethyltransferase  64.15 
 
 		 431 aa  544  1e-153  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4513  serine hydroxymethyltransferase  63.5 
 
 		 417 aa  541  1e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0695784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0703  serine hydroxymethyltransferase  63.75 
 
 		 417 aa  544  1e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1033  serine hydroxymethyltransferase  63.41 
 
 		 417 aa  544  1e-153  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414818  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5243  serine hydroxymethyltransferase  63.75 
 
 		 417 aa  541  1e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383038  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2083  serine hydroxymethyltransferase  61.52 
 
 		 418 aa  538  9.999999999999999e-153  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.112354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5930  glycine hydroxymethyltransferase  63.39 
 
 		 438 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224958  normal  0.0770182 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4877  serine hydroxymethyltransferase  63.02 
 
 		 417 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.402887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04405  serine hydroxymethyltransferase  63.41 
 
 		 417 aa  539  9.999999999999999e-153  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1468  serine hydroxymethyltransferase  62.53 
 
 		 423 aa  539  9.999999999999999e-153  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0322  serine hydroxymethyltransferase  63.33 
 
 		 417 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.457346  decreased coverage  0.0000286459 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4270  serine hydroxymethyltransferase  62.77 
 
 		 417 aa  537  1e-151  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4712  serine hydroxymethyltransferase  62.59 
 
 		 417 aa  538  1e-151  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4885  serine hydroxymethyltransferase  63.33 
 
 		 417 aa  535  1e-151  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.994809  normal  0.551008 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2091  serine hydroxymethyltransferase  62.93 
 
 		 429 aa  536  1e-151  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1917  serine hydroxymethyltransferase  63.08 
 
 		 430 aa  537  1e-151  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.584505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0373  serine hydroxymethyltransferase  64.06 
 
 		 419 aa  537  1e-151  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.238829  normal  0.155765 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6203  serine hydroxymethyltransferase  63.33 
 
 		 417 aa  534  1e-151  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0377267  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0295  serine hydroxymethyltransferase  63.88 
 
 		 414 aa  535  1e-151  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>