More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1581 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1581  dethiobiotin synthase  100 
 
 		 241 aa  488  1e-137  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.413996 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1583  dethiobiotin synthase  74.89 
 
 		 240 aa  357  8e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0552587  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2165  dethiobiotin synthase  62.98 
 
 		 239 aa  308  4e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2243  dethiobiotin synthase  62.18 
 
 		 243 aa  305  4.0000000000000004e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.519579  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2052  dethiobiotin synthase  61.7 
 
 		 239 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2369  dethiobiotin synthase  61.6 
 
 		 264 aa  294  9e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0971494  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1176  dethiobiotin synthase  58.82 
 
 		 243 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.592702  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1459  dethiobiotin synthase  45.15 
 
 		 244 aa  181  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175087  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1327  dethiobiotin synthase  44.69 
 
 		 263 aa  177  1e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1836  dethiobiotin synthase  42.54 
 
 		 242 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.354399  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0103  dethiobiotin synthase  46.63 
 
 		 241 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.188104  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3950  dithiobiotin synthetase  41.7 
 
 		 242 aa  157  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2817  dithiobiotin synthetase  42.25 
 
 		 242 aa  156  4e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0885  dethiobiotin synthase  45.71 
 
 		 211 aa  151  8e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1008  dithiobiotin synthetase  42.51 
 
 		 242 aa  150  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4229  dithiobiotin synthetase  39.91 
 
 		 242 aa  149  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.411801  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4188  dithiobiotin synthetase  42.65 
 
 		 242 aa  149  5e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4252  dithiobiotin synthetase  43.14 
 
 		 242 aa  149  5e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3874  dithiobiotin synthetase  39.46 
 
 		 242 aa  146  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4027  dithiobiotin synthetase  41.55 
 
 		 242 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4340  dithiobiotin synthetase  41.55 
 
 		 242 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4142  dithiobiotin synthetase  41.55 
 
 		 242 aa  142  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3860  dithiobiotin synthetase  41.55 
 
 		 242 aa  142  5e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6892  dethiobiotin synthase  44.29 
 
 		 234 aa  137  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4265  dithiobiotin synthetase  38.57 
 
 		 245 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0554323 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1157  dethiobiotin synthase  38.94 
 
 		 217 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.125346  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0021  dethiobiotin synthase  37.14 
 
 		 244 aa  135  5e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00210748  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1794  dithiobiotin synthetase  32.13 
 
 		 228 aa  135  7.000000000000001e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26269  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0823  dethiobiotin synthase  36.23 
 
 		 228 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0599522 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0883  dethiobiotin synthase  40.91 
 
 		 212 aa  132  5e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.619901  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0445  dithiobiotin synthetase  37.66 
 
 		 247 aa  132  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2160  dethiobiotin synthase  43.18 
 
 		 228 aa  132  6e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0153  dethiobiotin synthase  37.86 
 
 		 238 aa  129  3e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0526  dethiobiotin synthase  37.77 
 
 		 248 aa  129  3e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0372  dithiobiotin synthetase  37.73 
 
 		 239 aa  129  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.356167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2543  dethiobiotin synthase  35.78 
 
 		 243 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000737689  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2097  dethiobiotin synthase  40.19 
 
 		 243 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0396  dithiobiotin synthetase  38.91 
 
 		 226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0704487  normal  0.887363 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4330  dithiobiotin synthetase  37.07 
 
 		 228 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.112465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0398  dethiobiotin synthase  40.98 
 
 		 213 aa  126  3e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4836  dithiobiotin synthetase  39.37 
 
 		 226 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.519377 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4084  dithiobiotin synthetase  37.39 
 
 		 228 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.610971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1675  dethiobiotin synthetase  43.43 
 
 		 251 aa  124  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1373  dethiobiotin synthase  43.43 
 
 		 262 aa  124  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0149  dethiobiotin synthase  41.95 
 
 		 248 aa  124  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2812  dethiobiotin synthase  39.51 
 
 		 266 aa  124  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00660538  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1133  dithiobiotin synthetase  39.55 
 
 		 226 aa  124  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0820  dethiobiotin synthase  39.18 
 
 		 186 aa  124  1e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.22019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0304  dethiobiotin synthase  37.02 
 
 		 225 aa  123  3e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0392  dithiobiotin synthetase  38.46 
 
 		 226 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0465  dithiobiotin synthetase  37.1 
 
 		 230 aa  122  6e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000224118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4683  dithiobiotin synthetase  38.01 
 
 		 226 aa  122  7e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.462604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0116  dethiobiotin synthase  41.71 
 
 		 254 aa  120  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173766  normal  0.959156 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0003  dethiobiotin synthase  39.6 
 
 		 186 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2293  dethiobiotin synthase  35.45 
 
 		 220 aa  120  3e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0366  dithiobiotin synthetase  38.01 
 
 		 226 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.55843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3426  dithiobiotin synthetase  36.89 
 
 		 234 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2678  dithiobiotin synthetase  36.89 
 
 		 234 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2900  dithiobiotin synthetase  37.38 
 
 		 221 aa  118  6e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.380379  normal  0.231577 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3453  dethiobiotin synthase  36.19 
 
 		 225 aa  118  7e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0498  dethiobiotin synthetase  37.33 
 
 		 226 aa  118  9e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.545472  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5172  dithiobiotin synthetase  37.1 
 
 		 226 aa  118  9e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0206613  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3096  dethiobiotin synthase  33.47 
 
 		 238 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1097  dethiobiotin synthase  33.51 
 
 		 190 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.110147  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0857  dithiobiotin synthetase  33.79 
 
 		 227 aa  116  3e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0071  dethiobiotin synthase  40.09 
 
 		 223 aa  115  5e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.255458  normal  0.0373724 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2855  dethiobiotin synthase  36.7 
 
 		 249 aa  115  6e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2946  dethiobiotin synthase  37.57 
 
 		 239 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00040484  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6277  dithiobiotin synthetase  38.32 
 
 		 239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1269  dithiobiotin synthetase  37.32 
 
 		 238 aa  113  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000478349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2887  dethiobiotin synthase  36.32 
 
 		 226 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.5609  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4370  dethiobiotin synthase  39.27 
 
 		 225 aa  113  3e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.497713  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2554  dethiobiotin synthase  34.39 
 
 		 287 aa  113  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0309873  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2536  dethiobiotin synthase  34.84 
 
 		 226 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000213384  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45930  dithiobiotin synthetase  36.2 
 
 		 231 aa  112  6e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.460318  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0082  dithiobiotin synthetase  37.16 
 
 		 227 aa  112  7.000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2053  dithiobiotin synthetase  37.97 
 
 		 217 aa  111  1.0000000000000001e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0534973 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2454  dethiobiotin synthase  38.89 
 
 		 224 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.101684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2066  dithiobiotin synthetase  35.43 
 
 		 231 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3699  dethiobiotin synthase  38.92 
 
 		 240 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0969414  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4031  dethiobiotin synthase  37.32 
 
 		 240 aa  109  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.677394 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2835  dethiobiotin synthase  39.43 
 
 		 225 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2753  dithiobiotin synthetase  34.96 
 
 		 234 aa  109  4.0000000000000004e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11733  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1047  dethiobiotin synthase  40.34 
 
 		 216 aa  108  5e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.113648  normal  0.557843 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0246  dethiobiotin synthetase  38.65 
 
 		 234 aa  108  6e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.187676  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0422  dethiobiotin synthase  38.65 
 
 		 234 aa  108  6e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000789598 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1833  dethiobiotin synthase  35.62 
 
 		 233 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0633  dithiobiotin synthetase  33.79 
 
 		 238 aa  107  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000700922  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3643  dethiobiotin synthase  37.93 
 
 		 236 aa  107  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1373  dithiobiotin synthetase  36.49 
 
 		 235 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.409918  normal  0.0708007 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0899  dethiobiotin synthase  40.46 
 
 		 232 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.579086 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2384  dethiobiotin synthase  39.89 
 
 		 238 aa  106  3e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.393597  normal  0.141052 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0700  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  31.96 
 
 		 646 aa  106  3e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2961  dithiobiotin synthetase  32.41 
 
 		 227 aa  106  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0450029  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1437  dithiobiotin synthetase  36.19 
 
 		 235 aa  105  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.895386  normal  0.581627 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1568  dethiobiotin synthase  40.88 
 
 		 231 aa  105  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.248853  normal  0.275033 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1163  dethiobiotin synthase  35.75 
 
 		 255 aa  105  6e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0926  dithiobiotin synthetase  33.98 
 
 		 225 aa  105  8e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000415248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1842  dithiobiotin synthetase  33.49 
 
 		 244 aa  105  9e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.709275  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1508  dithiobiotin synthetase  32.87 
 
 		 226 aa  104  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000663248  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>