More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1572 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
259 aa  515  1.0000000000000001e-145  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1936  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  46.15 
 
 
260 aa  238  8e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  45.77 
 
 
260 aa  237  1e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  41.6 
 
 
262 aa  232  5e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  44.62 
 
 
260 aa  231  6e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.62 
 
 
260 aa  228  5e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.85 
 
 
260 aa  228  5e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  43.24 
 
 
259 aa  227  1e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.38 
 
 
260 aa  224  8e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.38 
 
 
260 aa  224  1e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.28 
 
 
258 aa  223  3e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.95 
 
 
260 aa  222  4e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.69 
 
 
260 aa  221  9e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.38 
 
 
260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  41.15 
 
 
260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.19 
 
 
260 aa  219  3e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  40.77 
 
 
260 aa  218  6e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  45.17 
 
 
260 aa  217  1e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.23 
 
 
260 aa  217  1e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1484  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  41.92 
 
 
260 aa  215  5e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  47.22 
 
 
258 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1377  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  43.97 
 
 
260 aa  212  3.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  42.02 
 
 
258 aa  212  3.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.15 
 
 
259 aa  209  3e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2787  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.48 
 
 
258 aa  208  9e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43440  enoyl-CoA hydratase  45.93 
 
 
261 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.75 
 
 
267 aa  207  2e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2792  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.63 
 
 
259 aa  206  4e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.552079 
 
 
-
 
NC_002950  PG1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  42.97 
 
 
256 aa  205  7e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.209168 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  44.44 
 
 
258 aa  205  7e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1462  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.84 
 
 
259 aa  204  8e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8123  enoyl-CoA hydratase  44.49 
 
 
257 aa  204  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.402683 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.85 
 
 
260 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2191  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.85 
 
 
260 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.572895  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  43.75 
 
 
661 aa  204  2e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  39.45 
 
 
662 aa  203  2e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.18 
 
 
258 aa  202  3e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1666  short chain enoyl-CoA hydratase  43.85 
 
 
260 aa  203  3e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.88 
 
 
257 aa  202  3e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509119  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0716  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.92 
 
 
254 aa  202  4e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.439165  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3644  enoyl-CoA hydratase  45.12 
 
 
261 aa  202  4e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.63 
 
 
259 aa  202  4e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  41.44 
 
 
257 aa  202  6e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.87 
 
 
266 aa  201  8e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.63 
 
 
260 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  41.06 
 
 
257 aa  201  9.999999999999999e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4681  enoyl-CoA hydratase  44.4 
 
 
260 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417656  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1716  short chain enoyl-CoA hydratase  46.92 
 
 
260 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.923335  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.34 
 
 
269 aa  201  9.999999999999999e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.01 
 
 
267 aa  201  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2036  enoyl-CoA hydratase  43.13 
 
 
257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.189819 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.54 
 
 
259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  41.6 
 
 
257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  43.78 
 
 
260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1171  enoyl-CoA hydratase  40.55 
 
 
258 aa  199  3e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.37 
 
 
265 aa  199  3e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  43.62 
 
 
262 aa  199  3e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0932  hypothetical protein  43.55 
 
 
258 aa  199  3.9999999999999996e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0901  hypothetical protein  43.55 
 
 
258 aa  199  3.9999999999999996e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0222  enoyl-CoA hydratase  45.02 
 
 
253 aa  199  5e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1117  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.67 
 
 
259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1122  short chain enoyl-CoA hydratase  43.9 
 
 
262 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  41.44 
 
 
257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2136  enoyl-CoA hydratase  42.23 
 
 
260 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.259318  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  42.75 
 
 
258 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  40.31 
 
 
659 aa  196  2.0000000000000003e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.91 
 
 
260 aa  196  3e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.02 
 
 
255 aa  196  3e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3101  enoyl-CoA hydratase-isomerase  40.96 
 
 
275 aa  196  4.0000000000000005e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.429404  hitchhiker  0.000105979 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1234  enoyl-CoA hydratase  40.56 
 
 
258 aa  196  4.0000000000000005e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134815  normal  0.668233 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.89 
 
 
253 aa  195  8.000000000000001e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000837602 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  44.05 
 
 
263 aa  195  8.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1206  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.98 
 
 
257 aa  194  9e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3593  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.65 
 
 
264 aa  194  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.127236  normal  0.0102117 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0254  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.54 
 
 
262 aa  193  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.168242  normal  0.0914474 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1099  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.95 
 
 
257 aa  194  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0490806  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2165  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.43 
 
 
258 aa  193  2e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192446  normal  0.593108 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1545  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.24 
 
 
258 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  42.4 
 
 
260 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0590  short chain enoyl-CoA hydratase  45.38 
 
 
262 aa  193  3e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44 
 
 
268 aa  192  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00240  enoyl-CoA hydratase, putative  41.22 
 
 
283 aa  192  4e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0589051  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0453  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  39.45 
 
 
662 aa  192  4e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.840152  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3030  short chain enoyl-CoA hydratase  40.93 
 
 
258 aa  192  4e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4172  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.16 
 
 
258 aa  192  5e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  41.86 
 
 
258 aa  192  5e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.86 
 
 
258 aa  192  5e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04650  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  43.36 
 
 
278 aa  192  5e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.54 
 
 
258 aa  192  6e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  41.83 
 
 
257 aa  192  7e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0384  short chain enoyl-CoA hydratase  41.15 
 
 
251 aa  191  8e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  43.14 
 
 
259 aa  191  8e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1806  enoyl-CoA hydratase  42.28 
 
 
262 aa  190  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.595083  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  38.74 
 
 
663 aa  190  2e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.31 
 
 
261 aa  190  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4849  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.13 
 
 
257 aa  190  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2552  enoyl-CoA hydratase  42.8 
 
 
262 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2515  enoyl-CoA hydratase  42.8 
 
 
262 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2591  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.47 
 
 
258 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.000604766  decreased coverage  0.0000000224287 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2564  enoyl-CoA hydratase  42.8 
 
 
262 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45986e-17 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>