More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1524 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1524  short chain enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 256 aa  527  1e-149  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4267  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.6 
 
 		 258 aa  224  1e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.728636  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4306  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.39 
 
 		 258 aa  219  3.9999999999999997e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3481  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.52 
 
 		 266 aa  218  6e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0267  short chain enoyl-CoA hydratase  43.41 
 
 		 257 aa  216  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5310  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.51 
 
 		 269 aa  195  7e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.181246 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  40.39 
 
 		 259 aa  194  9e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1794  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.15 
 
 		 270 aa  191  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.836656 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.6 
 
 		 260 aa  191  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.2 
 
 		 260 aa  190  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.43 
 
 		 260 aa  189  5e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  38.46 
 
 		 260 aa  186  3e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.1 
 
 		 260 aa  186  3e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  36.76 
 
 		 258 aa  186  3e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  39.22 
 
 		 260 aa  185  6e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  38.82 
 
 		 260 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2455  enoyl-CoA hydratase  40.38 
 
 		 265 aa  181  8.000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00942261  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  39.76 
 
 		 260 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.06 
 
 		 261 aa  181  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0322  short chain enoyl-CoA hydratase  40.16 
 
 		 256 aa  180  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.173694 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0177  enoyl-CoA hydratase  39.3 
 
 		 267 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3750  short chain enoyl-CoA hydratase  40.61 
 
 		 257 aa  178  5.999999999999999e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  41.27 
 
 		 258 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.27 
 
 		 258 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  38 
 
 		 260 aa  176  3e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  42.69 
 
 		 257 aa  175  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.53 
 
 		 258 aa  174  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3593  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.8 
 
 		 264 aa  174  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.127236  normal  0.0102117 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  37.65 
 
 		 260 aa  174  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.24 
 
 		 261 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  37.4 
 
 		 260 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.04 
 
 		 258 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1377  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  42 
 
 		 260 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.89 
 
 		 268 aa  172  5.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  38.74 
 
 		 258 aa  172  5.999999999999999e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1171  enoyl-CoA hydratase  39.06 
 
 		 258 aa  171  7.999999999999999e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.82 
 
 		 263 aa  171  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  41.27 
 
 		 257 aa  171  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.04 
 
 		 269 aa  171  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3574  enoyl-CoA hydratase  41.63 
 
 		 257 aa  170  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000415637 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.3 
 
 		 265 aa  169  3e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0858  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.49 
 
 		 264 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.229661  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.6 
 
 		 260 aa  168  6e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.3 
 
 		 267 aa  168  7e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2792  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.8 
 
 		 259 aa  167  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.552079 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.29 
 
 		 259 aa  168  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  39.15 
 
 		 260 aa  167  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  39.04 
 
 		 263 aa  167  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.9 
 
 		 260 aa  167  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4369  enoyl-CoA hydratase  41.11 
 
 		 257 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0156166 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1234  enoyl-CoA hydratase  38.67 
 
 		 258 aa  167  2e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134815  normal  0.668233 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1936  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  36.03 
 
 		 260 aa  167  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.6 
 
 		 261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1736  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.55 
 
 		 271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.841182 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.67 
 
 		 258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  35.89 
 
 		 262 aa  166  2.9999999999999998e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2591  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.48 
 
 		 258 aa  166  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.000604766  decreased coverage  0.0000000224287 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  36.18 
 
 		 663 aa  165  5e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.3 
 
 		 260 aa  166  5e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0149  short chain enoyl-CoA hydratase  38.98 
 
 		 266 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.227059  normal  0.14158 
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  39.68 
 
 		 257 aa  165  6.9999999999999995e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4763  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.36 
 
 		 265 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254643  normal  0.582812 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.13 
 
 		 260 aa  165  6.9999999999999995e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  39.15 
 
 		 262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0344  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.7 
 
 		 252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  36.65 
 
 		 258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.98 
 
 		 260 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  39.29 
 
 		 257 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3101  enoyl-CoA hydratase-isomerase  38.15 
 
 		 275 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.429404  hitchhiker  0.000105979 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.94 
 
 		 267 aa  163  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1462  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.8 
 
 		 259 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3042  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  36.8 
 
 		 259 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  38.74 
 
 		 258 aa  163  3e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1762  short chain enoyl-CoA hydratase  37.65 
 
 		 267 aa  163  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0266496  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  35.32 
 
 		 662 aa  162  6e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5509  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.55 
 
 		 265 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5352  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.55 
 
 		 265 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3078  short chain enoyl-CoA hydratase  40.61 
 
 		 258 aa  162  6e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.13392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0040  carnitinyl-CoA dehydratase  36.96 
 
 		 297 aa  162  7e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3270  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.89 
 
 		 255 aa  161  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.868271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3219  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.89 
 
 		 255 aa  161  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0206173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3208  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.89 
 
 		 255 aa  161  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5239  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0037  carnitinyl-CoA dehydratase  36.96 
 
 		 261 aa  161  9e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3563  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.96 
 
 		 261 aa  161  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0040  carnitinyl-CoA dehydratase  36.96 
 
 		 261 aa  161  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3619  carnitinyl-CoA dehydratase  36.96 
 
 		 261 aa  161  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.291673 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1806  enoyl-CoA hydratase  39.15 
 
 		 262 aa  160  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.595083  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00040  carnitinyl-CoA dehydratase  36.96 
 
 		 297 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0932  hypothetical protein  36.61 
 
 		 258 aa  160  2e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00039  hypothetical protein  36.96 
 
 		 297 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.4 
 
 		 260 aa  160  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  35.22 
 
 		 260 aa  160  2e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1484  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  36.4 
 
 		 260 aa  160  2e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2552  enoyl-CoA hydratase  39.53 
 
 		 262 aa  160  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0901  hypothetical protein  36.61 
 
 		 258 aa  159  3e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2359  enoyl-CoA hydratase  39.15 
 
 		 262 aa  159  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2921  enoyl-CoA hydratase  39.29 
 
 		 259 aa  159  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2607  enoyl-CoA hydratase  39.15 
 
 		 262 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.43779  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0860  short chain enoyl-CoA hydratase  41.5 
 
 		 261 aa  159  4e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0074  carnitinyl-CoA dehydratase  36.96 
 
 		 261 aa  159  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>