75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1501 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_1501  heparinase II/III-like  100 
 
 
561 aa  1155  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0392  Heparinase II/III family protein  41.08 
 
 
557 aa  364  2e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.276932  normal  0.686057 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00700  hypothetical protein  39.5 
 
 
541 aa  357  2e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23430  putative heparinase  38.9 
 
 
550 aa  344  2e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  7.12421e-12  hitchhiker  0.00765921 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0809  heparinase II/III family protein  36.31 
 
 
547 aa  326  7e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3329  heparinase II/III family protein  35.81 
 
 
528 aa  268  3e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4069  Heparinase II/III family protein  32.8 
 
 
545 aa  218  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2158  heparinase II/III family protein  33.85 
 
 
587 aa  209  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0083  Heparinase II/III family protein  29 
 
 
603 aa  191  3e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.137335 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5558  hypothetical protein  25.19 
 
 
651 aa  164  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.030932  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4954  hypothetical protein  24.67 
 
 
651 aa  163  7e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.2677e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1300  heparinase II/III-like  31.26 
 
 
680 aa  161  3e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1686  heparinase II/III family protein  30.12 
 
 
594 aa  153  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08631  hypothetical protein  25.94 
 
 
600 aa  151  3e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.143582  hitchhiker  7.50178e-06 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3884  heparinase II/III family protein  34.14 
 
 
617 aa  118  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0024  heparinase II/III-like  26.5 
 
 
592 aa  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1321  heparinase II/III family protein  26.04 
 
 
629 aa  99  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213971  hitchhiker  8.59361e-08 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4294  hypothetical protein  26 
 
 
518 aa  97.8  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.166644  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0433  heparinase II/III family protein  24.41 
 
 
668 aa  96.3  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0485794 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2926  heparinase II/III family protein  28.68 
 
 
610 aa  95.1  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0023  heparinase II/III family protein  25.91 
 
 
524 aa  95.1  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0030  Heparinase II/III family protein  26.5 
 
 
584 aa  94.7  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0471  heparinase II/III-like protein  24.25 
 
 
630 aa  92  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  5.00761e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0718  heparinase II/III-like  25.69 
 
 
628 aa  90.9  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.79901 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0324  hypothetical protein  25.58 
 
 
571 aa  89.7  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.674427  normal  0.116041 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0625  Heparinase II/III family protein  24.56 
 
 
597 aa  89.7  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.27993 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3419  heparinase II/III-like  26.33 
 
 
568 aa  89.4  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.784393  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0085  heparinase II/III-like  27 
 
 
584 aa  89  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.265496  normal  0.158685 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0196  heparinase II/III-like  25.69 
 
 
584 aa  88.2  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.9561  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0157  heparinase II/III-like  25.46 
 
 
584 aa  86.3  1e-15  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.901723  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3797  Heparinase II/III family protein  25.27 
 
 
670 aa  84.3  5e-15  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3793  heparinase II/III-like  23.62 
 
 
627 aa  80.9  6e-14  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4034  Heparinase II/III family protein  23.99 
 
 
630 aa  79.7  1e-13  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0114283 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3022  heparinase II/III family protein  22 
 
 
657 aa  79  2e-13  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  4.0262e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3916  Heparinase II/III family protein  26.24 
 
 
548 aa  79.3  2e-13  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.729618  normal  0.655355 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0090  heparinase II/III-like  25.49 
 
 
581 aa  79  2e-13  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.379483  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4241  Heparinase II/III family protein  25.77 
 
 
548 aa  78.6  3e-13  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.222931 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0073  heparinase II/III-like family protein  23.13 
 
 
569 aa  76.6  1e-12  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  1.68541e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1748  hypothetical protein  23.39 
 
 
617 aa  75.9  2e-12  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.560293  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1815  hypothetical protein  23.39 
 
 
543 aa  75.5  2e-12  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.277258  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1088  heparinase II/III family protein  24.81 
 
 
580 aa  73.9  7e-12  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0039  heparinase II/III family protein  25.12 
 
 
614 aa  73.2  1e-11  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.644544  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1423  Heparinase II/III family protein  24.02 
 
 
569 aa  71.2  5e-11  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.332975 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0460  heparinase II/III-like protein  21.46 
 
 
627 aa  70.1  9e-11  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00058619  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3190  heparinase II/III family protein  25.39 
 
 
568 aa  69.7  1e-10  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2070  heparinase II/III family protein  25.59 
 
 
581 aa  68.6  3e-10  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2499  Heparinase II/III family protein  26.82 
 
 
570 aa  68.2  4e-10  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.307447  normal  0.508108 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5363  hypothetical protein  20.65 
 
 
896 aa  68.2  4e-10  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2473  heparinase II/III-like  28.13 
 
 
702 aa  67.8  5e-10  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.21542  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5513  hypothetical protein  20.65 
 
 
896 aa  67.4  6e-10  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5121  hypothetical protein  20.65 
 
 
908 aa  67.4  7e-10  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2790  Heparinase II/III family protein  26.79 
 
 
570 aa  65.9  2e-09  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5221  Heparinase II/III family protein  25.16 
 
 
573 aa  65.5  2e-09  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.452357  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2964  heparinase II/III family protein  25.84 
 
 
573 aa  64.7  4e-09  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.534511  normal  0.040363 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2567  heparinase II/III family protein  26.53 
 
 
570 aa  64.7  4e-09  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.974647  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4968  hypothetical protein  21.38 
 
 
906 aa  62.4  2e-08  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1385  Heparinase II/III family protein  27.63 
 
 
702 aa  60.8  6e-08  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.16373  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1481  Heparinase II/III family protein  33.55 
 
 
702 aa  58.5  3e-07  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.608961  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3032  heparinase II/III family protein  23.32 
 
 
572 aa  55.8  2e-06  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.310136 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08820  glycosyltransferase  25 
 
 
1188 aa  54.7  4e-06  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.338698  normal  0.471651 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2927  heparinase II/III family protein  24.07 
 
 
565 aa  53.9  7e-06  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.298148  normal  0.0379947 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2764  heparinase II/III family protein  24.18 
 
 
567 aa  53.5  9e-06  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4041  heparinase II/III-like  23.54 
 
 
584 aa  52.8  1e-05  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0124  Heparinase II/III family protein  18.92 
 
 
594 aa  52.8  2e-05  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1969  hypothetical protein  24.57 
 
 
760 aa  52.8  2e-05  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1101  hypothetical protein  24.29 
 
 
567 aa  52.4  2e-05  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3879  Heparinase II/III family protein  28.24 
 
 
766 aa  52  3e-05  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3127  heparinase II/III-like protein  25.35 
 
 
592 aa  49.7  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8037  hypothetical protein  23.24 
 
 
560 aa  50.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1891  heparinase II/III family protein  30.07 
 
 
968 aa  49.3  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.857248 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0406  heparinase II/III-like protein  20.9 
 
 
672 aa  47.4  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.242919  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0105  heparinase II/III-like  24.34 
 
 
628 aa  47.4  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0402  hypothetical protein  20.95 
 
 
672 aa  47.4  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.813066  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5592  heparinase II/III family protein  24.7 
 
 
582 aa  45.1  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.658626  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6521  heparinase II/III family protein  29.25 
 
 
874 aa  43.9  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0494474 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>