46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1490 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1490  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 479 aa  968    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2770  polysaccharide biosynthesis protein  39.14 
 
 		 460 aa  260  4e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2629  polysaccharide biosynthesis protein  33.33 
 
 		 474 aa  179  1e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.105104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  24.26 
 
 		 490 aa  62.8  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  21.66 
 
 		 512 aa  62  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1796  polysaccharide biosynthesis protein  21.22 
 
 		 453 aa  60.8  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0929  polysaccharide biosynthesis protein  22.92 
 
 		 489 aa  60.5  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  21.97 
 
 		 488 aa  56.2  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  23.49 
 
 		 423 aa  54.7  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2568  peptidase M24A  25.88 
 
 		 533 aa  53.1  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3996  polysaccharide biosynthesis protein  22.81 
 
 		 416 aa  51.2  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0920288  normal  0.168346 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4195  polysaccharide biosynthesis protein  23.4 
 
 		 416 aa  50.8  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185065  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4003  polysaccharide biosynthesis protein  23.88 
 
 		 416 aa  49.3  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0933  stage V sporulation protein B  24.44 
 
 		 520 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0040  polysaccharide biosynthesis protein  21.37 
 
 		 435 aa  48.5  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000125854  normal  0.0319641 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3553  polysaccharide biosynthesis protein  29.81 
 
 		 458 aa  47.8  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4156  polysaccharide biosynthesis protein  23.57 
 
 		 416 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1836  polysaccharide biosynthesis protein  20.89 
 
 		 446 aa  47.4  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0190  polysaccharide biosynthesis protein  24.07 
 
 		 418 aa  47.8  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.308685  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0520  polysaccharide biosynthesis protein  24.07 
 
 		 418 aa  47.4  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2225  polysaccharide biosynthesis protein  26.91 
 
 		 495 aa  47  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00989737  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4025  polysaccharide biosynthesis protein  23.84 
 
 		 418 aa  46.6  0.0009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4009  polysaccharide biosynthesis protein  23.44 
 
 		 416 aa  46.2  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.419331  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4184  polysaccharide biosynthesis protein  23.44 
 
 		 416 aa  46.2  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03619  hypothetical protein  23.44 
 
 		 416 aa  46.6  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3270  polysaccharide synthase family protein  21.71 
 
 		 459 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6414  polysaccharide biosynthesis protein  20.7 
 
 		 502 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0705751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1612  polysaccharide biosynthesis protein  20.24 
 
 		 495 aa  46.6  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03670  O-antigen translocase  23.44 
 
 		 416 aa  46.6  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4304  polysaccharide biosynthesis protein  23.44 
 
 		 416 aa  46.6  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.114384  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4129  polysaccharide biosynthesis protein  23.44 
 
 		 416 aa  46.2  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.924452  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4211  polysaccharide biosynthesis protein  23.44 
 
 		 416 aa  46.2  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5225  polysaccharide biosynthesis protein  23.25 
 
 		 416 aa  45.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.115958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  26.52 
 
 		 499 aa  45.4  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2515  stage V sporulation protein B  20.95 
 
 		 520 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0654527  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1391  polysaccharide biosynthesis protein  37.18 
 
 		 456 aa  45.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0076  polysaccharide biosynthesis protein  27.78 
 
 		 499 aa  45.1  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.160586  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0079  polysaccharide biosynthesis protein  27.78 
 
 		 499 aa  45.1  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.75242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4001  polysaccharide biosynthesis protein  24.19 
 
 		 455 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.443077 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2104  stage V sporulation protein B  26.42 
 
 		 529 aa  44.7  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.624718  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2039  polysaccharide synthase family protein  21.45 
 
 		 459 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1392  hypothetical protein  20.15 
 
 		 860 aa  43.9  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0642  integral membrane protein MviN  23.7 
 
 		 512 aa  43.5  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.180976 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1411  polysaccharide biosynthesis protein  37.21 
 
 		 456 aa  43.5  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0601  MviN family membrane protein  23.7 
 
 		 512 aa  43.5  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2754  polysaccharide biosynthesis protein  27.88 
 
 		 460 aa  43.1  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.316209  normal  0.518814 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>