More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1486 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1486  UDP-galactose 4-epimerase  100 
 
 		 330 aa  678    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.608224 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  64.74 
 
 		 337 aa  426  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2493  UDP-glucose 4-epimerase  58.48 
 
 		 350 aa  388  1e-107  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1657  UDP-glucose 4-epimerase  61.64 
 
 		 322 aa  383  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.408778  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1711  UDP-glucose 4-epimerase  55.35 
 
 		 329 aa  380  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0857741  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0368  UDP-glucose 4-epimerase  53.46 
 
 		 323 aa  360  1e-98  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2339  UDP-glucose 4-epimerase  54.63 
 
 		 338 aa  358  6e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000378791  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  55.8 
 
 		 331 aa  357  1.9999999999999998e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3795  UDP-glucose 4-epimerase  53.68 
 
 		 353 aa  355  5.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.611688 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0529  UDP-glucose 4-epimerase  52.05 
 
 		 341 aa  352  5e-96  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00475144  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2451  UDP-glucose 4-epimerase  57.54 
 
 		 341 aa  351  8e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0563953  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  53.87 
 
 		 329 aa  351  1e-95  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2240  UDP-glucose 4-epimerase  56.88 
 
 		 326 aa  348  6e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1047  UDP-galactose 4-epimerase  53.58 
 
 		 336 aa  346  3e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240501 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3171  UDP-glucose 4-epimerase  54.77 
 
 		 327 aa  346  3e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2340  UDP-glucose 4-epimerase  55.62 
 
 		 328 aa  342  5.999999999999999e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169139  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3215  UDP-glucose 4-epimerase  54.77 
 
 		 329 aa  341  1e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00104083  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0877  UDP-glucose 4-epimerase  56.21 
 
 		 330 aa  340  2e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0489  UDP-glucose 4-epimerase  53.56 
 
 		 332 aa  340  2e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1249  UDP-glucose 4-epimerase  51.23 
 
 		 328 aa  338  5.9999999999999996e-92  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0040  UDP-glucose 4-epimerase  53.96 
 
 		 330 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4279  UDP-galactose 4-epimerase  52.98 
 
 		 333 aa  337  9.999999999999999e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.277879  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1573  UDP-glucose 4-epimerase  54.66 
 
 		 328 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.95776  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1048  UDP-glucose 4-epimerase  55.45 
 
 		 329 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00034868 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  50.63 
 
 		 326 aa  336  2.9999999999999997e-91  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  54.04 
 
 		 320 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4141  UDP-glucose 4-epimerase  52.66 
 
 		 332 aa  332  5e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4181  UDP-glucose 4-epimerase  52.66 
 
 		 332 aa  332  7.000000000000001e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1065  UDP-glucose 4-epimerase  51.66 
 
 		 336 aa  330  1e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0777  UDP-galactose 4-epimerase  53.37 
 
 		 329 aa  331  1e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.107594  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4827  UDP-glucose 4-epimerase  53.61 
 
 		 329 aa  330  1e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.321852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1148  UDP-glucose 4-epimerase  50.31 
 
 		 328 aa  330  2e-89  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.602539  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2973  UDP-glucose 4-epimerase  54.21 
 
 		 331 aa  330  2e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  53.92 
 
 		 332 aa  330  3e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0590  UDP-glucose 4-epimerase  50.31 
 
 		 328 aa  329  4e-89  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1224  UDP-glucose 4-epimerase  52.91 
 
 		 328 aa  329  5.0000000000000004e-89  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00236591  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  52.83 
 
 		 327 aa  329  5.0000000000000004e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0320  UDP-galactose 4-epimerase  52.31 
 
 		 332 aa  329  5.0000000000000004e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1273  UDP-glucose 4-epimerase  50 
 
 		 328 aa  328  6e-89  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.138557  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1957  UDP-galactose 4-epimerase  52.66 
 
 		 332 aa  328  7e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880811  normal  0.626313 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0208  UDP-glucose 4-epimerase  52.87 
 
 		 328 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163102  normal  0.146368 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1806  UDP-glucose 4-epimerase  52.12 
 
 		 330 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.217645 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1175  UDP-glucose 4-epimerase  52.89 
 
 		 330 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5674  UDP-galactose 4-epimerase  52.91 
 
 		 337 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.304425 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3696  UDP-glucose 4-epimerase  54.57 
 
 		 329 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0207521 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1866  UDP-glucose 4-epimerase  51.88 
 
 		 330 aa  325  5e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2329  UDP-galactose 4-epimerase  54.6 
 
 		 335 aa  325  6e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00335064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1293  UDP-glucose 4-epimerase  51.52 
 
 		 336 aa  325  6e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.606002  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1081  UDP-glucose 4-epimerase  50.63 
 
 		 321 aa  324  1e-87  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000142619  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  51.26 
 
 		 328 aa  323  2e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3065  UDP-glucose 4-epimerase  51.39 
 
 		 328 aa  323  2e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3273  UDP-glucose 4-epimerase  52.74 
 
 		 330 aa  322  5e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779876  normal  0.995045 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  51.27 
 
 		 329 aa  322  5e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1597  UDP-glucose 4-epimerase  52.94 
 
 		 337 aa  321  9.000000000000001e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.903427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3597  UDP-glucose 4-epimerase  52.44 
 
 		 330 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.55309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3471  UDP-glucose 4-epimerase  51.83 
 
 		 330 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1427  UDP-glucose 4-epimerase  52.31 
 
 		 337 aa  320  3e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.60129 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1609  UDP-glucose 4-epimerase  52.32 
 
 		 337 aa  320  3e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.647452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0464  UDP-glucose 4-epimerase  51.68 
 
 		 327 aa  319  3.9999999999999996e-86  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0781477  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2299  UDP-glucose 4-epimerase  50.47 
 
 		 332 aa  319  3.9999999999999996e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3672  UDP-glucose 4-epimerase  54.14 
 
 		 328 aa  319  5e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0118315 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0186  UDP-galactose 4-epimerase  50.47 
 
 		 354 aa  318  6e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347724  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1807  UDP-glucose 4-epimerase  50.63 
 
 		 324 aa  317  2e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4513  UDP-glucose 4-epimerase  51.37 
 
 		 337 aa  317  3e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0576  UDP-glucose 4-epimerase  48.92 
 
 		 325 aa  316  3e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0136  UDP-glucose 4-epimerase  52.53 
 
 		 324 aa  316  3e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.763249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0608  UDP-glucose 4-epimerase  50.47 
 
 		 324 aa  316  4e-85  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000293819  hitchhiker  0.00261597 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1923  UDP-glucose 4-epimerase  48.76 
 
 		 331 aa  315  8e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0783  UDP-glucose 4-epimerase  50.76 
 
 		 329 aa  314  9.999999999999999e-85  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.297847  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4998  UDP-glucose 4-epimerase  50.3 
 
 		 330 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.163773  normal  0.0224202 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0940  UDP-glucose 4-epimerase  50.32 
 
 		 327 aa  313  1.9999999999999998e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1089  UDP-glucose 4-epimerase  51.24 
 
 		 323 aa  313  2.9999999999999996e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0168  UDP-glucose 4-epimerase  52.28 
 
 		 342 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.566405 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3275  UDP-galactose 4-epimerase  52.16 
 
 		 333 aa  312  5.999999999999999e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.768237  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5062  UDP-glucose 4-epimerase  52.65 
 
 		 327 aa  312  5.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0282  UDP-glucose 4-epimerase  49.06 
 
 		 328 aa  311  7.999999999999999e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4306  UDP-glucose 4-epimerase  51.57 
 
 		 324 aa  310  2e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0064009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0322  UDP-glucose 4-epimerase  49.53 
 
 		 326 aa  309  2.9999999999999997e-83  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0339  UDP-galactose 4-epimerase  48.59 
 
 		 331 aa  309  4e-83  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  50.94 
 
 		 328 aa  309  4e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3237  UDP-glucose 4-epimerase  47.48 
 
 		 328 aa  308  6.999999999999999e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218159  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1342  UDP-glucose 4-epimerase  52.35 
 
 		 332 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0273  UDP-glucose 4-epimerase  48.74 
 
 		 328 aa  308  1.0000000000000001e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0474  UDP-glucose 4-epimerase  48.58 
 
 		 328 aa  306  3e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.814056  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0543  UDP-glucose 4-epimerase  49.04 
 
 		 328 aa  306  4.0000000000000004e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  48.28 
 
 		 337 aa  305  7e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1369  UDP-glucose 4-epimerase  49.69 
 
 		 333 aa  305  7e-82  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1392  UDP-glucose 4-epimerase  49.24 
 
 		 330 aa  305  7e-82  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1115  UDP-glucose 4-epimerase  51.71 
 
 		 326 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.423931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3859  UDP-glucose 4-epimerase  48.42 
 
 		 327 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142705  normal  0.126757 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0041  UDP-glucose 4-epimerase  47.96 
 
 		 337 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2978  UDP-galactose 4-epimerase  51.08 
 
 		 339 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.295177 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  49.53 
 
 		 331 aa  302  4.0000000000000003e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4249  UDP-galactose 4-epimerase  48.43 
 
 		 327 aa  302  5.000000000000001e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.444052 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  47.65 
 
 		 330 aa  302  5.000000000000001e-81  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  47.65 
 
 		 330 aa  302  5.000000000000001e-81  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4187  UDP-glucose 4-epimerase  48.1 
 
 		 327 aa  301  9e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0159  UDP-galactose 4-epimerase  51.27 
 
 		 330 aa  301  9e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.15603  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4439  UDP-glucose 4-epimerase  52.02 
 
 		 332 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4942  UDP-glucose 4-epimerase  49.84 
 
 		 328 aa  300  2e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0332152  normal  0.293116 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>