196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1438 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_1438  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 
86 aa  178  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0544  excinuclease ABC subunit C  71.76 
 
 
86 aa  130  3.9999999999999996e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2278  excinuclease ABC subunit C  64.63 
 
 
89 aa  113  6.9999999999999995e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0732686  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0019  Excinuclease ABC C subunit domain protein  62.2 
 
 
93 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0018  Excinuclease ABC C subunit domain protein  62.2 
 
 
93 aa  110  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1435  excinuclease ABC subunit C  46.34 
 
 
88 aa  87.4  6e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3752  Excinuclease ABC C subunit domain protein  53.33 
 
 
84 aa  85.1  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1952  Excinuclease ABC C subunit domain protein  54.05 
 
 
130 aa  84.7  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2919  endonuclease  50.62 
 
 
106 aa  84.3  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1697  GIY-YIG domain-containing protein  46.25 
 
 
97 aa  84  7e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00497401  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1431  GIY-YIG domain-containing protein  46.84 
 
 
96 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00206814  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1103  excinuclease ABC subunit C  49.37 
 
 
87 aa  82  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2257  Excinuclease ABC C subunit domain protein  51.35 
 
 
91 aa  82.8  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.879636  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2891  excinuclease ABC subunit C  46.84 
 
 
94 aa  82  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.625064  normal  0.178968 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0038  excinuclease ABC subunit C  48.1 
 
 
97 aa  80.5  0.000000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2636  Excinuclease ABC C subunit domain protein  49.35 
 
 
77 aa  80.1  0.000000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.303825  normal  0.812434 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1139  Excinuclease ABC C subunit domain protein  51.35 
 
 
80 aa  80.1  0.000000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.138973  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0145  endonuclease  46.34 
 
 
106 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03940  Excinuclease ABC C subunit domain protein  50 
 
 
86 aa  77.8  0.00000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0098  excinuclease ABC subunit C  45.78 
 
 
107 aa  77.4  0.00000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.807182  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4762  excinuclease ABC subunit C  46.84 
 
 
95 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000128421 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0137  excinuclease ABC subunit C  44.3 
 
 
139 aa  77  0.00000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0489368 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1073  Excinuclease ABC C subunit domain protein  47.37 
 
 
90 aa  76.3  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0081744 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2084  Excinuclease ABC C subunit domain protein  46.15 
 
 
88 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000359134  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4401  endo/excinuclease amino terminal domain-containing protein  43.9 
 
 
95 aa  75.9  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0448  excinuclease ABC subunit C  47.95 
 
 
79 aa  75.5  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4217  excinuclease ABC subunit C  43.59 
 
 
163 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0136  excinuclease ABC subunit C  43.21 
 
 
147 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0675  hypothetical protein  44.3 
 
 
101 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0145  hypothetical protein  42.35 
 
 
122 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0136  excinuclease ABC subunit C  42.86 
 
 
140 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.228252 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1452  excinuclease ABC subunit C  43.59 
 
 
112 aa  75.1  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00178124  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2428  hypothetical protein  48.68 
 
 
83 aa  74.7  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1867  Excinuclease ABC C subunit domain protein  45.45 
 
 
80 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000216284  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0131  excinuclease ABC subunit C  44.3 
 
 
141 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2759  excinuclease ABC subunit C  46.05 
 
 
103 aa  73.9  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00570056  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0140  Excinuclease ABC C subunit domain protein  42.31 
 
 
166 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2171  excinuclease ABC subunit C  41.98 
 
 
110 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000951078 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1603  Excinuclease ABC C subunit domain protein  45 
 
 
88 aa  73.6  0.0000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000181458  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2472  excinuclease ABC subunit C  44.3 
 
 
86 aa  72.4  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.897508 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0115  excinuclease ABC subunit C  42.5 
 
 
90 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0452  Excinuclease ABC C subunit domain protein  42.67 
 
 
84 aa  71.6  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122957  normal  0.760356 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0879  endo/excinuclease domain-containing protein  46.75 
 
 
165 aa  72  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0141  excinuclease ABC subunit C  42.31 
 
 
92 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0509  excinuclease ABC subunit C  47.3 
 
 
82 aa  72  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.107949  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0522  excinuclease ABC subunit C  47.3 
 
 
82 aa  72  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.199527  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5558  excinuclease ABC subunit C  45.33 
 
 
90 aa  71.2  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2851  Excinuclease ABC C subunit domain protein  43.42 
 
 
103 aa  71.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2943  Excinuclease ABC C subunit domain protein  43.42 
 
 
103 aa  71.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3617  putative excinuclease, subunit C  42.31 
 
 
98 aa  71.2  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1525  endonuclease  43.24 
 
 
89 aa  70.9  0.000000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4370  excinuclease ABC subunit C  42.31 
 
 
84 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1731  Excinuclease ABC C subunit domain protein  45.57 
 
 
91 aa  70.5  0.000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.26715  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0126  hypothetical protein  44.59 
 
 
82 aa  70.1  0.000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0737  endo/excinuclease domain-containing protein  44.44 
 
 
298 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.346537  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2326  excinuclease ABC subunit C  50.79 
 
 
291 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2276  endo/excinuclease domain-containing protein  44.44 
 
 
304 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3008  endo/excinuclease domain-containing protein  44.44 
 
 
334 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.975273  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1079  excinuclease ABC, C subunit, N-terminal  44.44 
 
 
264 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1589  endo/excinuclease domain-containing protein  44.44 
 
 
322 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.942614  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0136  excinuclease ABC subunit C  41.03 
 
 
167 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0133  excinuclease ABC subunit C  42.31 
 
 
119 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3457  GIY-YIG nuclease superfamily protein  43.59 
 
 
120 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3528  GIY-YIG nuclease superfamily protein  43.59 
 
 
120 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3459  GIY-YIG nuclease superfamily protein  43.59 
 
 
120 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1238  endo/excinuclease domain-containing protein  44.44 
 
 
284 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3565  GIY-YIG nuclease superfamily protein  43.59 
 
 
120 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2420  excinuclease ABC subunit C  45.45 
 
 
285 aa  68.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.180406 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1804  excinuclease ABC subunit C  45.45 
 
 
295 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2416  excinuclease ABC subunit C  45.45 
 
 
299 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3625  GIY-YIG nuclease superfamily protein  43.59 
 
 
120 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.791399  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0446  excinuclease ABC subunit C  40 
 
 
80 aa  68.9  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000029981  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3608  GIY-YIG nuclease superfamily protein  37.8 
 
 
88 aa  68.6  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.942188  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3055  Excinuclease ABC C subunit domain protein  48.72 
 
 
103 aa  68.6  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3398  hypothetical protein  41.56 
 
 
116 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.711714  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0876  excinuclease ABC subunit C  44.16 
 
 
237 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.644539 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02157  GIY-YIG nuclease superfamily protein  38.27 
 
 
101 aa  67.4  0.00000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.433469  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0606  hypothetical protein  39.74 
 
 
94 aa  67.4  0.00000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.383877  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0550  Excinuclease ABC C subunit domain protein  41.56 
 
 
100 aa  67.4  0.00000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0247  Excinuclease ABC C subunit domain protein  45.21 
 
 
127 aa  67.4  0.00000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1115  Excinuclease ABC C subunit domain protein  40.26 
 
 
109 aa  67  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0778  hypothetical protein  43.24 
 
 
88 aa  66.2  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.68184  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13970  predicted endonuclease containing a URI domain protein  46.05 
 
 
151 aa  66.6  0.0000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03022  hypothetical protein  40.26 
 
 
100 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02973  hypothetical protein  40.26 
 
 
100 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3638  GIY-YIG nuclease superfamily protein  38.75 
 
 
100 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0543  GIY-YIG nuclease superfamily protein  40.26 
 
 
100 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.792444 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3616  GIY-YIG nuclease superfamily protein  40.26 
 
 
100 aa  65.5  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3347  GIY-YIG nuclease superfamily protein  40.26 
 
 
100 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4475  GIY-YIG nuclease superfamily protein  40.26 
 
 
100 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3451  GIY-YIG nuclease superfamily protein  40.26 
 
 
100 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1312  Excinuclease ABC C subunit domain protein  46.15 
 
 
88 aa  64.7  0.0000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.12439  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0974  O-methyltransferase  45.33 
 
 
330 aa  64.3  0.0000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0397708  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3592  GIY-YIG nuclease superfamily protein  39.74 
 
 
113 aa  63.9  0.0000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.394656  normal  0.0895016 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2126  Excinuclease ABC C subunit domain protein  36.84 
 
 
105 aa  63.5  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05350  hypothetical protein  37.04 
 
 
104 aa  63.2  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5743  excinuclease ABC subunit C  45.45 
 
 
289 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.6194  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2461  excinuclease ABC subunit C  45.45 
 
 
296 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.976587  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3712  GIY-YIG nuclease superfamily protein  38.16 
 
 
95 aa  62.4  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3334  Excinuclease ABC C subunit domain protein  39.51 
 
 
100 aa  62.4  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.692644  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>