More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1414 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1414  50S ribosomal protein L20  100 
 
 		 117 aa  231  3e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000403686  normal  0.489901 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1518  50S ribosomal protein L20  93.16 
 
 		 117 aa  218  1.9999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0150794  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2625  50S ribosomal protein L20  88.03 
 
 		 117 aa  208  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000948958  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2305  50S ribosomal protein L20  89.74 
 
 		 117 aa  207  4e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00881657  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1872  50S ribosomal protein L20  82.91 
 
 		 117 aa  199  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000476313  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2227  50S ribosomal protein L20  92.45 
 
 		 117 aa  197  3e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00200707 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1421  50S ribosomal protein L20  82.05 
 
 		 118 aa  197  3e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000852478  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1993  50S ribosomal protein L20  92.45 
 
 		 117 aa  197  3e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.708674  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05610  ribosomal protein L20  65.81 
 
 		 119 aa  167  4e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312556  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3041  50S ribosomal protein L20  67.54 
 
 		 116 aa  163  9e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000250393  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4404  50S ribosomal protein L20  64.1 
 
 		 118 aa  157  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000358516  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4704  50S ribosomal protein L20  63.25 
 
 		 118 aa  156  7e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000111354  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4469  50S ribosomal protein L20  63.25 
 
 		 118 aa  156  7e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000222511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4304  50S ribosomal protein L20  63.25 
 
 		 118 aa  156  7e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.71931e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4315  50S ribosomal protein L20  63.25 
 
 		 118 aa  156  7e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000569694  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4697  50S ribosomal protein L20  63.25 
 
 		 118 aa  156  7e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443116  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4817  50S ribosomal protein L20  63.25 
 
 		 118 aa  156  7e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000468944  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0556  50S ribosomal protein L20  63.25 
 
 		 118 aa  156  7e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000506915  hitchhiker  1.2511e-24 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4688  50S ribosomal protein L20  63.25 
 
 		 118 aa  156  7e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.35886e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4681  50S ribosomal protein L20  63.25 
 
 		 118 aa  156  7e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000654651  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0046  ribosomal protein L20  63.48 
 
 		 117 aa  153  6e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0710  50S ribosomal protein L20  66.09 
 
 		 117 aa  153  6e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000670695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3259  50S ribosomal protein L20  61.54 
 
 		 118 aa  152  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000143022  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0427  ribosomal protein L20  63.16 
 
 		 117 aa  152  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00000768971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1381  ribosomal protein L20  63.25 
 
 		 120 aa  150  5.9999999999999996e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000161333  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2398  ribosomal protein L20  60.68 
 
 		 118 aa  150  7e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0041866  normal  0.275247 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1615  50S ribosomal protein L20  61.54 
 
 		 118 aa  149  8.999999999999999e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000423443  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2216  ribosomal protein L20  65.79 
 
 		 118 aa  149  8.999999999999999e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000311515  normal  0.131567 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1821  LSU ribosomal protein L20P  61.54 
 
 		 117 aa  149  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00014178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1092  50S ribosomal protein L20  58.12 
 
 		 118 aa  148  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000110509  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3478  50S ribosomal protein L20  66.09 
 
 		 118 aa  147  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0800064  hitchhiker  0.00881726 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2468  50S ribosomal protein L20  66.09 
 
 		 118 aa  147  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0164678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3222  50S ribosomal protein L20  66.09 
 
 		 118 aa  147  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.888026 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1973  50S ribosomal protein L20  64.29 
 
 		 114 aa  147  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1970  50S ribosomal protein L20  66.09 
 
 		 118 aa  147  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0648376  hitchhiker  0.00701004 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2381  ribosomal protein L20  64.1 
 
 		 118 aa  147  5e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2165  50S ribosomal protein L20  64.1 
 
 		 118 aa  147  5e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000386102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1934  50S ribosomal protein L20  64.1 
 
 		 118 aa  147  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1580  50S ribosomal protein L20  67.24 
 
 		 119 aa  147  5e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2594  ribosomal protein L20  62.39 
 
 		 118 aa  147  5e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649926  hitchhiker  0.00570674 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1905  50S ribosomal protein L20  63.39 
 
 		 114 aa  147  6e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28680  50S ribosomal protein L20  64.1 
 
 		 118 aa  147  6e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000531022 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1990  50S ribosomal protein L20  63.39 
 
 		 114 aa  147  6e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.115038  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2507  50S ribosomal protein L20  64.1 
 
 		 118 aa  147  6e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2488  50S ribosomal protein L20  65.79 
 
 		 119 aa  147  7e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000082554  hitchhiker  0.0000796215 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2123  50S ribosomal protein L20  65.79 
 
 		 119 aa  146  9e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000359041  normal  0.016896 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2025  50S ribosomal protein L20  65.79 
 
 		 119 aa  146  9e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.240457  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003713  LSU ribosomal protein L20p  63.25 
 
 		 117 aa  146  9e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000104464  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02082  50S ribosomal protein L20  63.25 
 
 		 117 aa  146  9e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2260  50S ribosomal protein L20  65.79 
 
 		 119 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000555159  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1979  50S ribosomal protein L20  65.22 
 
 		 118 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0347964  normal  0.0774628 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0800  50S ribosomal protein L20  61.54 
 
 		 119 aa  145  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2029  50S ribosomal protein L20  65.79 
 
 		 119 aa  145  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000108915  hitchhiker  0.0000236508 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20450  50S ribosomal protein L20  64.35 
 
 		 118 aa  145  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.834025  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1768  50S ribosomal protein L20  64.91 
 
 		 119 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000021709  normal  0.0190948 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2302  50S ribosomal protein L20  64.91 
 
 		 118 aa  145  3e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2219  50S ribosomal protein L20  64.91 
 
 		 118 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000521277  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2658  50S ribosomal protein L20  59.83 
 
 		 119 aa  144  3e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000886061  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2636  50S ribosomal protein L20  60.87 
 
 		 117 aa  144  3e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0643522  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2015  50S ribosomal protein L20  64.91 
 
 		 118 aa  145  3e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000132248  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2327  50S ribosomal protein L20  64.91 
 
 		 118 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000174207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1708  50S ribosomal protein L20  64.91 
 
 		 118 aa  145  3e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0547661  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2151  50S ribosomal protein L20  64.91 
 
 		 118 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000337835  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1802  50S ribosomal protein L20  65.22 
 
 		 117 aa  144  3e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0021941  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2187  50S ribosomal protein L20  64.91 
 
 		 118 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000144083  normal  0.0378081 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1958  50S ribosomal protein L20  64.91 
 
 		 118 aa  145  3e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000262165  normal  0.497021 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2018  50S ribosomal protein L20  64.91 
 
 		 118 aa  145  3e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000148558  normal  0.0497188 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2046  50S ribosomal protein L20  64.91 
 
 		 118 aa  145  3e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000387614  hitchhiker  0.00333012 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2496  50S ribosomal protein L20  64.04 
 
 		 118 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00192283  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0939  50S ribosomal protein L20  64.04 
 
 		 117 aa  144  5e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000748381  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1313  50S ribosomal protein L20  60 
 
 		 117 aa  144  6e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000242462  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1664  50S ribosomal protein L20  62.39 
 
 		 118 aa  142  1e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0696  50S ribosomal protein L20  64.91 
 
 		 115 aa  142  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129228  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2058  50S ribosomal protein L20  61.54 
 
 		 117 aa  142  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.524551  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0449  50S ribosomal protein L20  58.97 
 
 		 118 aa  142  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000370171  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15180  LSU ribosomal protein L20P  56.41 
 
 		 117 aa  141  3e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00260509  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0217  50S ribosomal protein L20  58.97 
 
 		 120 aa  141  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000274969  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1206  50S ribosomal protein L20  60.87 
 
 		 119 aa  140  4e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000522592  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2052  50S ribosomal protein L20  58.12 
 
 		 119 aa  141  4e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00996082  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1143  50S ribosomal protein L20  60.68 
 
 		 119 aa  140  5e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000341848  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1882  50S ribosomal protein L20  67.31 
 
 		 114 aa  140  5e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.96166  normal  0.0688359 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0490  50S ribosomal protein L20  61.54 
 
 		 119 aa  140  6e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.397114  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2017  50S ribosomal protein L20  58.12 
 
 		 119 aa  140  6e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1235  ribosomal protein L20  57.89 
 
 		 117 aa  140  9e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000439682  normal  0.0943757 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2317  50S ribosomal protein L20  58.97 
 
 		 118 aa  139  9e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000405852  normal  0.195139 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0981  50S ribosomal protein L20  58.26 
 
 		 117 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0960905 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1756  50S ribosomal protein L20  57.26 
 
 		 121 aa  139  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000228708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1757  50S ribosomal protein L20  66.98 
 
 		 117 aa  139  9.999999999999999e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0134124  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1475  50S ribosomal protein L20  63.25 
 
 		 119 aa  139  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000544649  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1412  50S ribosomal protein L20  63.25 
 
 		 119 aa  139  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00164339  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2096  50S ribosomal protein L20  57.26 
 
 		 119 aa  138  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01386  50S ribosomal protein L20  61.4 
 
 		 119 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2802  50S ribosomal protein L20  61.4 
 
 		 119 aa  138  3e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2000  50S ribosomal protein L20  59.83 
 
 		 120 aa  138  3e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0210248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2170  ribosomal protein L20  56.41 
 
 		 121 aa  137  3.9999999999999997e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00052538  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1997  50S ribosomal protein L20  57.26 
 
 		 118 aa  137  4.999999999999999e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00229305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1402  50S ribosomal protein L20  59.83 
 
 		 119 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2753  50S ribosomal protein L20  59.83 
 
 		 119 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0178087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1374  50S ribosomal protein L20  59.83 
 
 		 119 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.107797  normal  0.806931 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1362  50S ribosomal protein L20  59.83 
 
 		 119 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.626846  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>