More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1412 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1412  translation initiation factor IF-3  100 
 
 		 143 aa  289  1e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000852308  normal  0.493061 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1516  translation initiation factor IF-3  89.51 
 
 		 172 aa  263  7e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.027432  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2307  translation initiation factor IF-3  74.13 
 
 		 154 aa  229  8.000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00282878  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2229  translation initiation factor IF-3  80.28 
 
 		 173 aa  223  5.0000000000000005e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00231449 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1991  translation initiation factor IF-3  80.88 
 
 		 138 aa  214  2.9999999999999998e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.386988  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2627  translation initiation factor IF-3  83.82 
 
 		 138 aa  211  1.9999999999999998e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350049  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1870  translation initiation factor IF-3  76.22 
 
 		 157 aa  189  7e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000408645  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1419  translation initiation factor IF-3  61.97 
 
 		 146 aa  187  4e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000288109  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0425  translation initiation factor IF-3  62.86 
 
 		 171 aa  186  7e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00000964088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3024  translation initiation factor IF-3  60.71 
 
 		 173 aa  184  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0044  translation initiation factor IF-3  55.94 
 
 		 173 aa  176  1e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2676  translation initiation factor 3  59.26 
 
 		 137 aa  176  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.233816 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1032  translation initiation factor IF-3  56.34 
 
 		 238 aa  176  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1434  translation initiation factor IF-3  56.34 
 
 		 225 aa  176  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0842222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1613  translation initiation factor IF-3  58.04 
 
 		 145 aa  174  3e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000306668  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0488  translation initiation factor IF-3  56.34 
 
 		 184 aa  174  4e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.270402  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0534  translation initiation factor IF-3  58.57 
 
 		 165 aa  173  6e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000758155  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0428  translation initiation factor IF-3  54.55 
 
 		 156 aa  173  7e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2172  translation initiation factor IF-3  58.57 
 
 		 154 aa  172  9e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000864988  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1758  translation initiation factor 3  56.43 
 
 		 154 aa  172  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1557  translation initiation factor IF-3  56.03 
 
 		 156 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2103  translation initiation factor 3  56.83 
 
 		 177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.286317  normal  0.133955 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1161  translation initiation factor 3  56.83 
 
 		 154 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.930143 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15200  translation initiation factor 3  57.04 
 
 		 197 aa  170  5e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000028162  normal  0.0802518 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2853  translation initiation factor IF-3  55.32 
 
 		 174 aa  170  6.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0116753 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2002  translation initiation factor 3  57.86 
 
 		 153 aa  170  7.999999999999999e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112753  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1578  translation initiation factor IF-3  54.61 
 
 		 178 aa  169  9e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1976  translation initiation factor IF-3  56.03 
 
 		 173 aa  169  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1372  translation initiation factor 3  54.61 
 
 		 156 aa  168  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0696405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1383  translation initiation factor IF-3  56.43 
 
 		 187 aa  168  2e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111233  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3043  initiation factor 3  56.12 
 
 		 139 aa  167  4e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000731556  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1624  translation initiation factor IF-3  55 
 
 		 176 aa  167  4e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101313 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1906  translation initiation factor IF-3  55 
 
 		 173 aa  167  4e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1233  translation initiation factor IF-3  58.52 
 
 		 198 aa  167  5e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000135112  normal  0.0984034 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4616  translation initiation factor 3  55.32 
 
 		 156 aa  167  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00507113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2755  translation initiation factor IF-3  53.9 
 
 		 156 aa  167  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0994  translation initiation factor IF-3  55.32 
 
 		 156 aa  167  5e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1360  translation initiation factor IF-3  55.32 
 
 		 156 aa  167  5e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.485624  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1476  translation initiation factor IF-3  55.32 
 
 		 156 aa  167  5e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348442  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1453  translation initiation factor IF-3  55.32 
 
 		 156 aa  167  5e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0525841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1400  translation initiation factor IF-3  55.32 
 
 		 156 aa  167  5e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0821028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2400  translation initiation factor IF-3  54.29 
 
 		 164 aa  167  6e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00646191  normal  0.390668 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3163  translation initiation factor IF-3  52.82 
 
 		 252 aa  167  6e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0170352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1008  translation initiation factor 3  56.43 
 
 		 155 aa  166  7e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0442083  hitchhiker  0.00912814 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0207  translation initiation factor IF-3  55.71 
 
 		 173 aa  167  7e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1612  translation initiation factor IF-3  54.29 
 
 		 173 aa  166  9e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252676 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0830  translation initiation factor IF-3  56.93 
 
 		 169 aa  166  1e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.124767  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3158  translation initiation factor IF-3  55 
 
 		 173 aa  166  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2996  translation initiation factor IF-3  53.85 
 
 		 173 aa  166  1e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4639  translation initiation factor IF-3  52.52 
 
 		 219 aa  165  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000486529  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0671  translation initiation factor IF-3  56.2 
 
 		 192 aa  165  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.395911  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0767  translation initiation factor 3  57.94 
 
 		 146 aa  165  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3090  translation initiation factor IF-3  53.19 
 
 		 179 aa  164  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.639467  normal  0.0869717 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0641  translation initiation factor IF-3  59.56 
 
 		 175 aa  164  2.9999999999999998e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129727 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0964  translation initiation factor IF-3  53.9 
 
 		 156 aa  164  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.698743  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05720  translation initiation factor 3  55.56 
 
 		 207 aa  164  4e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000188671  normal  0.0169059 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0201  translation initiation factor IF-3  53.9 
 
 		 156 aa  164  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00116998  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4742  translation initiation factor IF-3  52.86 
 
 		 176 aa  164  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.676759  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1538  translation initiation factor IF-3  53.9 
 
 		 156 aa  164  5e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1095  translation initiation factor IF-3  53.9 
 
 		 156 aa  164  5e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.171775  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1891  translation initiation factor IF-3  53.9 
 
 		 156 aa  164  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.210834  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2594  translation initiation factor IF-3  53.9 
 
 		 156 aa  164  5e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1713  translation initiation factor IF-3  53.9 
 
 		 156 aa  164  5e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.225755  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1736  translation initiation factor IF-3  53.9 
 
 		 156 aa  164  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1778  translation initiation factor IF-3  53.9 
 
 		 156 aa  164  5e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.843423 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0798  translation initiation factor IF-3  54.41 
 
 		 202 aa  163  6.9999999999999995e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2613  translation initiation factor IF-3  54.69 
 
 		 172 aa  163  8e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0154974  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2242  translation initiation factor IF-3  54.69 
 
 		 166 aa  163  9e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000466118  hitchhiker  0.00531509 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2660  translation initiation factor IF-3  54.68 
 
 		 190 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000648528  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1149  translation initiation factor IF-3  55.8 
 
 		 202 aa  162  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01384  translation initiation factor IF-3  54.68 
 
 		 159 aa  162  1.0000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2638  translation initiation factor IF-3  55.94 
 
 		 169 aa  162  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.294805  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4232  translation initiation factor IF-3  52.14 
 
 		 173 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00738998 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1249  translation initiation factor IF-3  53.62 
 
 		 174 aa  162  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.246001 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2109  translation initiation factor IF-3  54.61 
 
 		 219 aa  162  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000273336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0724  translation initiation factor IF-3  51.08 
 
 		 194 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000346718  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2218  translation initiation factor IF-3  52.9 
 
 		 182 aa  162  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000264089  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2858  translation initiation factor 3  52.48 
 
 		 173 aa  161  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.357759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1975  translation initiation factor IF-3  59.15 
 
 		 233 aa  161  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2098  translation initiation factor IF-3  52.52 
 
 		 147 aa  161  3e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2139  translation initiation factor IF-3  51.05 
 
 		 177 aa  161  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0045601  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2019  translation initiation factor IF-3  52.52 
 
 		 147 aa  161  3e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1988  translation initiation factor IF-3  59.15 
 
 		 230 aa  160  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.61417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1903  translation initiation factor IF-3  59.15 
 
 		 232 aa  160  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.982503  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0766  translation initiation factor IF-3  54.07 
 
 		 181 aa  160  4.0000000000000004e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1301  translation initiation factor 3  51.45 
 
 		 175 aa  160  6e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.444006  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2042  translation initiation factor IF-3  49.65 
 
 		 199 aa  159  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0708817  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1871  translation initiation factor IF-3  53.62 
 
 		 181 aa  158  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2769  translation initiation factor IF-3  53.68 
 
 		 178 aa  158  2e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1887  translation initiation factor 3  57.45 
 
 		 160 aa  158  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.729735  normal  0.011077 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3182  translation initiation factor IF-3  50.36 
 
 		 205 aa  158  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0466683  normal  0.175076 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1319  translation initiation factor IF-3  53.68 
 
 		 190 aa  158  2e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0918782  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1269  translation initiation factor 3  51.77 
 
 		 225 aa  158  2e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.628011  normal  0.508823 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1341  translation initiation factor IF-3  54.41 
 
 		 173 aa  158  2e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4706  translation initiation factor IF-3  51.43 
 
 		 195 aa  157  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000432272  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4317  translation initiation factor IF-3  51.43 
 
 		 195 aa  157  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000117232  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2642  translation initiation factor IF-3  52.94 
 
 		 178 aa  158  3e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4819  translation initiation factor IF-3  51.43 
 
 		 186 aa  157  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000690292  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1880  translation initiation factor IF-3  58.57 
 
 		 229 aa  158  3e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.10659 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1090  hypothetical protein  50.36 
 
 		 179 aa  158  3e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000129093  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>