More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1393 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  93.84 
 
 		 568 aa  1097    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  86.09 
 
 		 568 aa  998    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  62.01 
 
 		 563 aa  731    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  86.27 
 
 		 568 aa  998    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  84.86 
 
 		 568 aa  1009    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  80.28 
 
 		 566 aa  931    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  100 
 
 		 568 aa  1158    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  64.56 
 
 		 568 aa  771    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  66.14 
 
 		 568 aa  788    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  64.9 
 
 		 568 aa  775    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  82.72 
 
 		 568 aa  966    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  88.2 
 
 		 568 aa  1047    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  61.82 
 
 		 571 aa  721    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  64.74 
 
 		 568 aa  772    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  63.25 
 
 		 571 aa  749    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1103  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  54.05 
 
 		 571 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202418  decreased coverage  0.00743342 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04882  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  51.09 
 
 		 577 aa  569  1e-161  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.415694  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0416  type IV pilus biogenesis protein PilB  48.4 
 
 		 569 aa  548  1e-154  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0420  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  48.58 
 
 		 569 aa  546  1e-154  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3605  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  48.22 
 
 		 569 aa  546  1e-154  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.464844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3919  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  48.58 
 
 		 570 aa  546  1e-154  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00735332  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0369  type IV pilus biogenesis protein PilB  49.11 
 
 		 568 aa  547  1e-154  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0217494  unclonable  0.0000124471 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0419  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  48.04 
 
 		 569 aa  547  1e-154  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.447977  hitchhiker  0.00974258 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3423  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  48.15 
 
 		 569 aa  543  1e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3942  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  48.58 
 
 		 570 aa  543  1e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1579  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  49.11 
 
 		 565 aa  540  9.999999999999999e-153  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4060  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  48.04 
 
 		 570 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0244852  normal  0.314215 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0312  type II secretion system protein E  48.47 
 
 		 571 aa  539  9.999999999999999e-153  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0425  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  48.22 
 
 		 569 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00261577  hitchhiker  0.000552387 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3867  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  48.22 
 
 		 570 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000581945 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2034  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  49.91 
 
 		 577 aa  536  1e-151  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.226289  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3167  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  49.26 
 
 		 577 aa  538  1e-151  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.644973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3438  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  47.51 
 
 		 569 aa  536  1e-151  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.141365  normal  0.083139 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1175  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  50.67 
 
 		 571 aa  534  1e-150  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.323553  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0313  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  48.49 
 
 		 569 aa  533  1e-150  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2114  pilus biogenesis protein  49.72 
 
 		 577 aa  534  1e-150  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0787  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  48.58 
 
 		 549 aa  529  1e-149  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  45.91 
 
 		 553 aa  529  1e-149  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3783  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  47.15 
 
 		 568 aa  530  1e-149  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.458272  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0413  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  47.7 
 
 		 568 aa  528  1e-148  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0362  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  48.42 
 
 		 569 aa  527  1e-148  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.388372 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0183  type IV pilus assembly protein  48.42 
 
 		 569 aa  527  1e-148  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5488  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  49.15 
 
 		 580 aa  519  1e-146  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.388204  normal  0.1076 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2370  type IV pilus assembly protein, PilB  49.24 
 
 		 571 aa  520  1e-146  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.881077  normal  0.0893992 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2902  type II secretion system protein E  49.35 
 
 		 577 aa  519  1e-146  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0639  type II secretion system protein E  49.62 
 
 		 571 aa  518  1.0000000000000001e-145  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0408  type II secretion system protein E  45.09 
 
 		 570 aa  517  1.0000000000000001e-145  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3389  type II secretion system protein E  45.73 
 
 		 569 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3919  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  49.81 
 
 		 555 aa  518  1.0000000000000001e-145  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.762326  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2681  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  49.16 
 
 		 572 aa  516  1.0000000000000001e-145  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.722105  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3680  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  46.86 
 
 		 578 aa  517  1.0000000000000001e-145  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  45.94 
 
 		 556 aa  513  1e-144  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4447  type IV pilus biogenesis protein PilB  48.39 
 
 		 566 aa  513  1e-144  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0064  pilin secretion/fimbrial assembly system protein, PilB  45.29 
 
 		 591 aa  514  1e-144  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.978792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4820  type II secretion system protein E  46.35 
 
 		 566 aa  513  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0768  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  47.56 
 
 		 577 aa  513  1e-144  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0069  type II secretion system protein E  46.11 
 
 		 570 aa  513  1e-144  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.73093  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0805  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  48.18 
 
 		 577 aa  515  1e-144  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0509  pilus biogenesis ATPase  47.29 
 
 		 572 aa  511  1e-143  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0385141 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0480  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  48.91 
 
 		 562 aa  511  1e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.942114  normal  0.860525 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4220  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  47.99 
 
 		 577 aa  509  1e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0550  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  47.29 
 
 		 574 aa  506  9.999999999999999e-143  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0926  type IV pilus biogenesis protein PilB  47.36 
 
 		 564 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  46.54 
 
 		 553 aa  505  9.999999999999999e-143  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2184  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  48.94 
 
 		 572 aa  506  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.48405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2079  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  46.41 
 
 		 578 aa  507  9.999999999999999e-143  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292786 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  45.49 
 
 		 557 aa  507  9.999999999999999e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0798  type II secretion system protein E  46.79 
 
 		 564 aa  503  1e-141  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  47.45 
 
 		 559 aa  504  1e-141  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2096  type IV pilus assembly protein PilB  44.5 
 
 		 571 aa  501  1e-140  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  45.94 
 
 		 558 aa  500  1e-140  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0766  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  47.63 
 
 		 578 aa  501  1e-140  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.59759  normal  0.16115 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0841  type II secretion system protein E  45.73 
 
 		 578 aa  500  1e-140  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0657263  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  44.69 
 
 		 787 aa  501  1e-140  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1479  pilus assembly protein PilB  46.21 
 
 		 574 aa  498  1e-139  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1504  pilus assembly protein PilB  46.21 
 
 		 574 aa  497  1e-139  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12090  type IV pilus assembly protein  46.78 
 
 		 566 aa  496  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  42.55 
 
 		 561 aa  498  1e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03469  hypothetical protein  46.8 
 
 		 561 aa  496  1e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58750  type 4 fimbrial biogenesis protein PilB  46.53 
 
 		 567 aa  497  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.497058 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2960  type II secretion system protein E  44.5 
 
 		 586 aa  494  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548556  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  44.58 
 
 		 573 aa  492  9.999999999999999e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5162  type 4 fimbrial biogenesis protein PilB  46.42 
 
 		 561 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  45.45 
 
 		 561 aa  489  1e-137  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  46.56 
 
 		 558 aa  490  1e-137  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  42.91 
 
 		 557 aa  488  1e-137  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2141  type II secretion system protein E  45.02 
 
 		 569 aa  491  1e-137  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000466372  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2705  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.57 
 
 		 575 aa  491  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3070  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.02 
 
 		 575 aa  488  1e-136  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  44.68 
 
 		 871 aa  486  1e-136  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  43.11 
 
 		 558 aa  486  1e-136  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0775  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  45.08 
 
 		 567 aa  488  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.621188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3108  type II secretion system protein E  44.91 
 
 		 573 aa  488  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.275217  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2825  type IV pilus assembly protein  43.99 
 
 		 575 aa  484  1e-135  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00509282  normal  0.0351792 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0426  type II secretion system protein E  43.42 
 
 		 577 aa  483  1e-135  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0285266  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2000  type IV pilus assembly protein PilB  46.74 
 
 		 562 aa  481  1e-134  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.758865  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  42.83 
 
 		 564 aa  481  1e-134  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  44.19 
 
 		 555 aa  480  1e-134  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2174  type II secretion system protein E  43.26 
 
 		 579 aa  481  1e-134  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002545  type 4 fimbrial assembly ATPase PilB  48.93 
 
 		 561 aa  480  1e-134  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.255614  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>