35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1391 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2684  hypothetical protein  64.5 
 
 
621 aa  817    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.427064  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2597  hypothetical protein  61.07 
 
 
619 aa  712    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1629  hypothetical protein  61.07 
 
 
619 aa  715    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2515  hypothetical protein  55.9 
 
 
652 aa  695    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0758792  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1489  hypothetical protein  72.98 
 
 
623 aa  901    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.124741  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1391  hypothetical protein  100 
 
 
619 aa  1256    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.86997 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1651  hypothetical protein  46.63 
 
 
624 aa  509  1e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1010  hypothetical protein  26.01 
 
 
634 aa  106  1e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101857  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0223  hypothetical protein  38.51 
 
 
881 aa  103  6e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0051  hypothetical protein  29.06 
 
 
613 aa  104  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.062012 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2374  hypothetical protein  30.67 
 
 
881 aa  97.8  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0423348  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2017  hypothetical protein  32.95 
 
 
880 aa  94.7  5e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000248245  normal  0.284056 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0581  hypothetical protein  29.59 
 
 
1009 aa  93.6  9e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.272409  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0333  hypothetical protein  31.36 
 
 
880 aa  93.6  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2186  hypothetical protein  32.13 
 
 
882 aa  87.4  6e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000183684  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1794  hypothetical protein  31.25 
 
 
1245 aa  87.4  7e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.69552  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2243  hypothetical protein  34.5 
 
 
875 aa  86.3  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1528  hypothetical protein  27.86 
 
 
984 aa  82.8  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0809349 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4967  hypothetical protein  26.99 
 
 
991 aa  81.3  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.736334  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0307  hypothetical protein  26.32 
 
 
993 aa  80.1  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0935  hypothetical protein  25.36 
 
 
531 aa  80.1  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0932  hypothetical protein  32.68 
 
 
541 aa  78.6  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.315139  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2144  hypothetical protein  29.47 
 
 
1099 aa  78.2  0.0000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2927  hypothetical protein  27.27 
 
 
1001 aa  77.8  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000253968 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1626  hypothetical protein  26.32 
 
 
1093 aa  76.3  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4667  hypothetical protein  26.37 
 
 
1076 aa  74.3  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0836755  hitchhiker  0.00000000312371 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2085  hypothetical protein  30.81 
 
 
989 aa  73.2  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0197  hypothetical protein  32.32 
 
 
880 aa  73.2  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0773  hypothetical protein  22.06 
 
 
455 aa  71.6  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000042468  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01380  hypothetical protein  26.26 
 
 
1109 aa  70.9  0.00000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.369989  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0238  hypothetical protein  28.11 
 
 
947 aa  70.1  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1844  hypothetical protein  20.75 
 
 
1005 aa  65.5  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0832694 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1942  hypothetical protein  26.63 
 
 
580 aa  63.5  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0873468  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0968  conserved hypothetical protein, membrane  26.24 
 
 
1103 aa  59.3  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.688922  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0195  hypothetical protein  25.49 
 
 
522 aa  45.8  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.966603  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>