138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1347 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_1347  phosphoesterase, PA-phosphatase related  100 
 
 
392 aa  783    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.423681  hitchhiker  0.0000000949183 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1840  PAP2 family protein  67.78 
 
 
272 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2234  phosphoesterase, PA-phosphatase related  58.27 
 
 
268 aa  301  1e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1517  phosphoesterase PA-phosphatase related  54.84 
 
 
281 aa  280  4e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000561151  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3083  phosphoesterase PA-phosphatase related  45.87 
 
 
294 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.227102  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1178  phosphoesterase PA-phosphatase related  44.08 
 
 
294 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.2963e-23 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1841  hypothetical protein  52.73 
 
 
129 aa  106  6e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.191726  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2023  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.2 
 
 
317 aa  105  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000204588 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0936  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.78 
 
 
286 aa  103  5e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.176181 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0313  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.21 
 
 
305 aa  75.9  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.512715  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0216  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.25 
 
 
218 aa  73.2  0.000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1221  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.15 
 
 
274 aa  70.5  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4469  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30 
 
 
251 aa  68.6  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3191  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.93 
 
 
174 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.353726  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3521  PAP2 family protein  35.25 
 
 
174 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.702348  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0806  phosphoesterase, PA-phosphatase related  26.29 
 
 
281 aa  66.2  0.0000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.343717  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11398  Phosphoesterase, PA-phosphatase-related protein  30.29 
 
 
304 aa  65.9  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.924537  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0823  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.64 
 
 
292 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2419  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.73 
 
 
222 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.623876  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2366  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.84 
 
 
201 aa  64.7  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0167377 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1340  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.31 
 
 
249 aa  63.5  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.130328  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2545  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.71 
 
 
242 aa  63.5  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1712  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.81 
 
 
177 aa  63.5  0.000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0174559  normal  0.195225 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1750  hypothetical protein  37.27 
 
 
126 aa  63.5  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0175059  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1441  PAP2 family protein  45.12 
 
 
175 aa  63.2  0.000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.24965  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3857  PAP2 family protein  40.62 
 
 
175 aa  62.4  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3600  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.88 
 
 
171 aa  62.4  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000568068  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4017  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.21 
 
 
290 aa  61.6  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.193202  normal  0.169945 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2784  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.86 
 
 
442 aa  61.6  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.952787  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0639  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.65 
 
 
185 aa  62  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.198264  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1102  phosphatase  32.3 
 
 
185 aa  61.2  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0240643  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1598  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.14 
 
 
180 aa  61.2  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.970961  hitchhiker  0.00000195096 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6735  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  40.54 
 
 
245 aa  60.5  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.418259 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0835  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.67 
 
 
181 aa  60.5  0.00000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.896282 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3793  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  35.38 
 
 
1261 aa  59.7  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1710  hypothetical protein  37.61 
 
 
127 aa  58.9  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  5.4977199999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2216  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.09 
 
 
245 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.322102 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5449  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.34 
 
 
284 aa  58.9  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.961923  normal  0.71434 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0607  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.27 
 
 
179 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00776566  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0961  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.07 
 
 
166 aa  58.2  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1280  PAP2 family protein  34.4 
 
 
185 aa  56.2  0.0000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0275929  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05882  hypothetical protein  37.5 
 
 
108 aa  55.8  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5776  phosphoesterase PA-phosphatase related  26.12 
 
 
194 aa  56.2  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00125534  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0111  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.76 
 
 
174 aa  55.1  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2185  phosphoesterase PA-phosphatase related  41.43 
 
 
257 aa  55.5  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.303622  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3031  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.4 
 
 
460 aa  55.5  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0770809  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3348  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.12 
 
 
186 aa  55.1  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.31592  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3097  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.26 
 
 
222 aa  55.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1765  putative membrane-associated phosphoesterase  32.28 
 
 
187 aa  55.1  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.569407  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1160  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.92 
 
 
205 aa  54.7  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0637  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.94 
 
 
208 aa  54.7  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1669  phosphoesterase PA-phosphatase related  26.34 
 
 
202 aa  54.7  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000273408  normal  0.218841 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0831  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.54 
 
 
189 aa  53.9  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1516  hypothetical protein  42.86 
 
 
118 aa  54.3  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00121071  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1773  PAP2 superfamily protein  27.98 
 
 
445 aa  53.9  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0816  membrane-associated phospholipid phosphatase  36.54 
 
 
189 aa  53.5  0.000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0247749 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1027  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.17 
 
 
437 aa  53.5  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.313073  normal  0.124762 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1891  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.76 
 
 
182 aa  53.1  0.000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.161028  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0572  PAP2 superfamily protein  30.34 
 
 
243 aa  53.1  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.194022 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1377  phosphoesterase PA-phosphatase related  24.72 
 
 
345 aa  53.1  0.000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4218  phosphoesterase, PA-phosphatase related  39.09 
 
 
277 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.575493  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0466  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.46 
 
 
207 aa  51.6  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4143  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.45 
 
 
201 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4117  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.45 
 
 
201 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3290  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.48 
 
 
171 aa  51.6  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.377201  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2672  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  29.41 
 
 
191 aa  51.2  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2554  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.33 
 
 
280 aa  50.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163921  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4071  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.04 
 
 
169 aa  50.8  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0634  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.78 
 
 
178 aa  50.8  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000602311  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4366  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.31 
 
 
218 aa  50.4  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0817815  normal  0.119091 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5863  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  36.63 
 
 
168 aa  50.4  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3368  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.19 
 
 
176 aa  50.1  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2011  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  32.98 
 
 
222 aa  50.1  0.00007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.235686  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001653  membrane-associated phospholipid phosphatase  35.48 
 
 
182 aa  50.1  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5970  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  26.45 
 
 
212 aa  50.1  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00821  phospholipid phosphatase  32.63 
 
 
182 aa  50.1  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4351  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.39 
 
 
277 aa  49.7  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1969  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.48 
 
 
253 aa  49.7  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.175709  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0425  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.03 
 
 
209 aa  49.7  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.41159  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4374  phosphoesterase PA-phosphatase related  39.64 
 
 
277 aa  49.7  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.171887  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00209  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.07 
 
 
172 aa  49.7  0.00009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1842  phosphoesterase, PA-phosphatase related  26.95 
 
 
204 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1340  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.81 
 
 
204 aa  49.3  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2558  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.37 
 
 
255 aa  49.3  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0088777  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0547  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.26 
 
 
261 aa  49.3  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0347407  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0399  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.71 
 
 
245 aa  48.5  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.149101  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3404  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.07 
 
 
228 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0771  VanZ like protein  38.46 
 
 
121 aa  48.1  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3371  membrane-associated phospholipid phosphatase  30 
 
 
217 aa  47.8  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.067771 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0206  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  34.07 
 
 
239 aa  47.8  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.456858  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1338  PAP2 family protein  32.09 
 
 
347 aa  47.8  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0037  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.33 
 
 
272 aa  47.4  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3912  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.41 
 
 
230 aa  47.8  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.703578  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0530  phosphoesterase, PA-phosphatase related  39.74 
 
 
199 aa  47.4  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.126296  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3198  PAP2 family protein  37.89 
 
 
170 aa  47.4  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3721  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.46 
 
 
170 aa  47  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.701868  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6959  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  30.48 
 
 
244 aa  46.6  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.190723  normal  0.122006 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4138  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.65 
 
 
499 aa  46.6  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4360  lipid A 1-phosphatase protein  32.11 
 
 
268 aa  46.6  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15070  PAP2 superfamily protein  32.84 
 
 
198 aa  46.6  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.872818 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>