250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1295 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1873  oligoendopeptidase F  81.31 
 
 		 596 aa  1001    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.201769  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1295  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  100 
 
 		 612 aa  1248    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104369  hitchhiker  0.000569902 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1993  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  61.5 
 
 		 592 aa  757    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000167694  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1382  pepF/M3 family oligoendopeptidase  62.03 
 
 		 589 aa  747    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000209164  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1295  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  67.68 
 
 		 588 aa  837    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0778267  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2055  pepF/M3 family oligoendopeptidase  73.94 
 
 		 591 aa  895    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00862679  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2988  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  67.51 
 
 		 588 aa  837    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.68469e-23 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2068  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  42.5 
 
 		 603 aa  469  1.0000000000000001e-131  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1896  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  43.15 
 
 		 601 aa  427  1e-118  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0533  pepF/M3 family oligoendopeptidase  42.34 
 
 		 589 aa  428  1e-118  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.18439  normal  0.721981 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4566  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  42.09 
 
 		 607 aa  401  9.999999999999999e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0554379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2576  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  41.4 
 
 		 620 aa  398  1e-109  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.855226 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0884  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  35.11 
 
 		 578 aa  392  1e-108  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000022902  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2192  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  39.11 
 
 		 597 aa  380  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.246068  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1636  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  38.18 
 
 		 573 aa  382  1e-104  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1482  pepF/M3 family oligoendopeptidase  40.27 
 
 		 615 aa  381  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2674  oligoendopeptidase F, putative  37.5 
 
 		 598 aa  370  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0370  pepF/M3 family oligoendopeptidase  38.84 
 
 		 622 aa  369  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2299  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  37.5 
 
 		 598 aa  370  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.39572 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4260  pepF/M3 family oligoendopeptidase  37.9 
 
 		 620 aa  365  1e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0066  rhomboid family protein  37.46 
 
 		 573 aa  357  2.9999999999999997e-97  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.411672  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0076  oligoendopeptidase F  38.1 
 
 		 620 aa  357  2.9999999999999997e-97  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0081  oligoendopeptidase F  38.1 
 
 		 620 aa  357  3.9999999999999996e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2070  pepF/M3 family oligoendopeptidase  37.59 
 
 		 634 aa  357  5e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.024965  normal  0.33011 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3702  oligoendopeptidase F  39.13 
 
 		 619 aa  356  5.999999999999999e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3296  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  38.82 
 
 		 617 aa  353  4e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2730  pepF/M3 family oligoendopeptidase  38.1 
 
 		 616 aa  353  4e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.797581  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0329  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  39.07 
 
 		 615 aa  353  5e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.559929 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1177  pepF/M3 family oligoendopeptidase  34.62 
 
 		 590 aa  353  5.9999999999999994e-96  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2754  pepF/M3 family oligoendopeptidase  37.76 
 
 		 625 aa  353  5.9999999999999994e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1694  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  32.65 
 
 		 584 aa  352  2e-95  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2981  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  37.8 
 
 		 625 aa  351  2e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.54197  normal  0.947222 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2052  pepF/M3 family oligoendopeptidase  38.66 
 
 		 614 aa  350  5e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.841739  hitchhiker  0.00000309933 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2877  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  38.1 
 
 		 601 aa  348  2e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0929363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0213  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  39.12 
 
 		 616 aa  347  3e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227297  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1225  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  38.1 
 
 		 626 aa  346  6e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100343  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3597  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  38.11 
 
 		 617 aa  346  7e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.794644  normal  0.398139 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6862  putative oligoendopeptidase F  37.88 
 
 		 664 aa  346  8.999999999999999e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.916639  normal  0.20394 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2803  pepF/M3 family oligoendopeptidase  38.1 
 
 		 623 aa  344  2e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.121144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3974  peptidase M3B, oligoendopeptidase-like clade 3  36.87 
 
 		 626 aa  344  2e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.221188  normal  0.896374 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0701  putative oligoendopeptidase F  36.69 
 
 		 571 aa  342  2e-92  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1431  peptidase M3B, oligoendopeptidase-like clade 3  37.76 
 
 		 610 aa  342  2e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.838587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0993  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  37.82 
 
 		 625 aa  340  4e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3148  pepF/M3 family oligoendopeptidase  38.47 
 
 		 616 aa  339  8e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00629046 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1054  oligoendopeptidase F  34.99 
 
 		 573 aa  339  9.999999999999999e-92  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1411  peptidase M3B, oligoendopeptidase-like clade 3  37.54 
 
 		 632 aa  337  3.9999999999999995e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.249086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2684  pepF/M3 family oligoendopeptidase  38.1 
 
 		 627 aa  333  4e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.667149 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1817  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  32.69 
 
 		 597 aa  333  4e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000237555  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0719  oligoendopeptidase F, putative  35.17 
 
 		 569 aa  333  4e-90  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.954418  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4665  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  37.07 
 
 		 638 aa  333  7.000000000000001e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1570  pepF/M3 family oligoendopeptidase  38.18 
 
 		 606 aa  333  8e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.713222  normal  0.288392 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1242  oligoendopeptidase F  34.29 
 
 		 573 aa  330  4e-89  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.906065  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2412  oligoendopeptidase F  37.14 
 
 		 606 aa  329  7e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0632065  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1117  oligoendopeptidase F  34.63 
 
 		 572 aa  328  1.0000000000000001e-88  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1075  pepF/M3 family oligoendopeptidase  37.14 
 
 		 606 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.371255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1832  pepF/M3 family oligoendopeptidase  36.61 
 
 		 620 aa  328  2.0000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0623  oligoendopeptidase F  34.13 
 
 		 573 aa  327  6e-88  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2603  oligoendopeptidase  36.8 
 
 		 611 aa  325  1e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0093862 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0569  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  36.01 
 
 		 606 aa  316  7e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0425519  hitchhiker  0.00000722694 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3392  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  34.36 
 
 		 607 aa  310  4e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.935472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1105  peptidase  33.1 
 
 		 566 aa  302  1e-80  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.567346  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2169  peptidase M3A and M3B, thimet/oligopeptidase F  36.78 
 
 		 601 aa  283  6.000000000000001e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0882  pepF/M3 family oligoendopeptidase  34.58 
 
 		 608 aa  283  9e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.83984  normal  0.332504 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34179  predicted protein  32.32 
 
 		 577 aa  259  1e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.137613  normal  0.109742 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1439  oligoendopeptidase F  29.37 
 
 		 599 aa  222  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1729  oligopeptidase F  27.62 
 
 		 593 aa  220  6e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0341754  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1706  oligoendopeptidase F  29.2 
 
 		 599 aa  220  7e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.615745  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1205  oligoendopeptidase F  28.67 
 
 		 597 aa  216  7e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2457  oligoendopeptidase F  27.87 
 
 		 595 aa  214  4.9999999999999996e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0101459  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1160  oligopeptidase F  28.31 
 
 		 603 aa  213  5.999999999999999e-54  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.167862  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3298  pepF/M3 family oligoendopeptidase  28.26 
 
 		 582 aa  213  9e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0058  oligoendopeptidase F  27.23 
 
 		 592 aa  212  2e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2686  oligoendopeptidase F  30.66 
 
 		 599 aa  211  2e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08170  Oligoendopeptidase F  26.79 
 
 		 598 aa  210  5e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1212  pepF/M3 family oligoendopeptidase  28.02 
 
 		 586 aa  209  1e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0407734  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1422  oligoendopeptidase F  28.83 
 
 		 596 aa  209  1e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0811423  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2002  oligoendopeptidase F  27.77 
 
 		 594 aa  207  3e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000655164  normal  0.321245 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3273  pepF/M3 family oligoendopeptidase  31.51 
 
 		 603 aa  207  5e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.474589 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2001  oligoendopeptidase F, putative  29.6 
 
 		 597 aa  206  9e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0875927  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0388  oligoendopeptidase F  28.01 
 
 		 608 aa  206  2e-51  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0196949  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3460  oligoendopeptidase F  28.68 
 
 		 601 aa  205  2e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000449992  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1998  pepF/M3 family oligoendopeptidase  31.51 
 
 		 603 aa  202  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1167  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  26.73 
 
 		 593 aa  201  3e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2755  oligoendopeptidase F  28.27 
 
 		 606 aa  200  5e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000210431  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2647  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  31.24 
 
 		 584 aa  200  7.999999999999999e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00961781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1169  oligoendopeptidase F  29.23 
 
 		 644 aa  197  6e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.325773 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0099  oligoendopeptidase F  28.04 
 
 		 619 aa  196  1e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.893555  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1255  oligoendopeptidase F  28.44 
 
 		 600 aa  195  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012526 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4094  oligoendopeptidase F  27.87 
 
 		 608 aa  194  4e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1090  oligoendopeptidase F  27.87 
 
 		 608 aa  194  5e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1102  oligoendopeptidase F  27.87 
 
 		 608 aa  194  5e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1114  oligoendopeptidase F  28.18 
 
 		 608 aa  193  7e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1096  oligoendopeptidase F  27.87 
 
 		 608 aa  193  7e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1276  oligoendopeptidase F  27.87 
 
 		 608 aa  193  7e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1206  oligoendopeptidase F  28.18 
 
 		 608 aa  193  7e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003689  oligoendopeptidase F  26.94 
 
 		 598 aa  193  7e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1310  oligoendopeptidase F  29.49 
 
 		 602 aa  193  9e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0118183  hitchhiker  0.00000404795 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1352  oligoendopeptidase F  27.87 
 
 		 608 aa  192  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1247  oligoendopeptidase F  27.87 
 
 		 608 aa  193  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1314  oligoendopeptidase F  27.87 
 
 		 608 aa  192  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>