More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1282 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1282  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 246 aa  494  1e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000182009 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1888  ABC transporter, ATP-binding protein  82.93 
 
 		 246 aa  414  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.986838  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2973  ABC transporter related  74.8 
 
 		 246 aa  383  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000014361  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0868  ABC transporter related protein  78.57 
 
 		 245 aa  367  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.463879  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3391  ABC transporter related  78.57 
 
 		 245 aa  367  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2167  ABC transporter related  69.55 
 
 		 247 aa  336  1.9999999999999998e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1939  hypothetical protein  66.24 
 
 		 241 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0973  ABC transporter related  68.78 
 
 		 247 aa  325  6e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.059424  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2070  ABC transporter related  62.96 
 
 		 245 aa  306  1.0000000000000001e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0552622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4150  ABC transporter related  61.32 
 
 		 244 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2108  ABC transporter, ATP-binding protein  60.25 
 
 		 241 aa  301  5.000000000000001e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1196  ABC transporter related protein  58.58 
 
 		 243 aa  300  1e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17500  ABC transporter related  61.09 
 
 		 239 aa  300  1e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0533908  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0595  ABC transporter related protein  59.92 
 
 		 249 aa  300  2e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.63679  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3960  ABC transporter, ATP-binding protein  61.67 
 
 		 243 aa  298  4e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002404  lipopolysaccharide ABC transporter ATP-binding protein LptB  59.41 
 
 		 241 aa  297  1e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.052444  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3667  ABC transporter related  61.25 
 
 		 243 aa  296  2e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00165948  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03192  ABC-type transport system ATPase component  60.25 
 
 		 241 aa  296  2e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0687  ABC transporter related  61.25 
 
 		 243 aa  296  2e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000839172  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0727  ABC transporter related  62.18 
 
 		 241 aa  296  2e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0674  ABC transporter related  61.25 
 
 		 243 aa  296  2e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.120094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3348  ABC transporter related  61.25 
 
 		 243 aa  296  2e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00159492  normal  0.142579 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3376  ABC transporter related  60.42 
 
 		 243 aa  296  2e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.681925  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0717  ABC transporter related  61.25 
 
 		 243 aa  296  2e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.759015  normal  0.46231 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0673  ABC transporter related  61.25 
 
 		 243 aa  296  2e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.207873  normal  0.0972351 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0708  ABC transporter related  61.25 
 
 		 243 aa  296  2e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.658002  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03663  hypothetical protein  59.41 
 
 		 241 aa  295  4e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2117  ABC transporter related  60.08 
 
 		 244 aa  295  5e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2891  ABC transporter ATP-binding protein  59.66 
 
 		 241 aa  295  5e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.724805  normal  0.0929005 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2634  ABC transporter related  60.5 
 
 		 241 aa  295  6e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.445237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3026  ABC transporter, ATP-binding protein  60.5 
 
 		 241 aa  295  6e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.808463  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1421  hypothetical protein  57.74 
 
 		 243 aa  295  7e-79  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.872796 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3615  ABC transporter related  60.42 
 
 		 243 aa  294  9e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0117606  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1937  ABC transporter related  59.17 
 
 		 244 aa  294  9e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1176  ABC transporter, ATP-binding protein  58.58 
 
 		 241 aa  294  9e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0251  ATPase  58.75 
 
 		 244 aa  293  1e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3310  ABC transporter-related protein  60.33 
 
 		 243 aa  293  2e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000131342  normal  0.806996 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4299  ABC transporter-related protein  56.91 
 
 		 255 aa  292  3e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2546  ABC transporter related  59.66 
 
 		 244 aa  292  3e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.651086  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2229  ABC transporter related  60.92 
 
 		 241 aa  292  3e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2170  ABC transporter-related protein  61.34 
 
 		 244 aa  292  4e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.529851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1661  ABC transporter, ATPase subunit  63.03 
 
 		 242 aa  291  6e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0673  ABC transporter related  60.08 
 
 		 262 aa  291  8e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.125229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0752  ABC transporter related protein  59.11 
 
 		 247 aa  290  1e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.306795  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0868  ABC transporter related  58.92 
 
 		 254 aa  291  1e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4366  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  60.08 
 
 		 241 aa  290  1e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.254909  normal  0.374938 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4049  ABC transporter related  57.32 
 
 		 243 aa  290  2e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000937515 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3178  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  60.5 
 
 		 241 aa  289  3e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4239  ABC transporter related  59.09 
 
 		 243 aa  288  4e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000891993 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0567  ABC transporter related  58.58 
 
 		 241 aa  289  4e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.714932  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3335  ABC transporter related  57.81 
 
 		 250 aa  288  4e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0534  ATPase component ABC-type transport system  58.65 
 
 		 240 aa  288  6e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0490  ABC transporter related  61.34 
 
 		 243 aa  288  7e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.858965  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0418  ABC transporter-related protein  59.26 
 
 		 263 aa  288  7e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0499  ABC transport protein, ATP-binding component  58.16 
 
 		 241 aa  287  9e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0141  ABC transporter related  56.54 
 
 		 240 aa  287  9e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.911941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0727  ABC transporter-related protein  59.92 
 
 		 243 aa  287  9e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.12728 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0465  ABC transporter related  58.7 
 
 		 264 aa  287  1e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.15337  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3678  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  59.24 
 
 		 241 aa  287  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.156461 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3616  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  59.24 
 
 		 241 aa  287  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.238218 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3511  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  59.24 
 
 		 241 aa  287  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3580  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  59.24 
 
 		 241 aa  287  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3509  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  59.24 
 
 		 241 aa  287  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3637  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  59.24 
 
 		 241 aa  287  1e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.671496  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0716  ABC transporter related  60.42 
 
 		 243 aa  286  2e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0818834  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3814  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  59.24 
 
 		 241 aa  286  2e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188088  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3709  ABC transporter related  58.85 
 
 		 265 aa  286  2.9999999999999996e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.320955  normal  0.158224 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4313  ABC transporter related  57.98 
 
 		 251 aa  285  4e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.271583 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3656  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  58.4 
 
 		 241 aa  285  4e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.875085  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4486  ABC transporter related  59.26 
 
 		 268 aa  285  4e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.152694 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1911  ABC transporter related  58 
 
 		 255 aa  285  4e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4542  ABC transporter, ATP-binding protein  58.16 
 
 		 246 aa  285  5.999999999999999e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.979233  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12363  ABC transporter, ATP-binding protein  54.39 
 
 		 246 aa  284  7e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1770  ATPase  59.66 
 
 		 240 aa  284  8e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.464592  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0759  LPS ABC transporter ATP-binding protein  57.74 
 
 		 249 aa  284  1.0000000000000001e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4226  ABC transporter-related protein  58.96 
 
 		 268 aa  283  1.0000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.219808 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1206  ABC transporter, ATP-binding protein  57.74 
 
 		 249 aa  284  1.0000000000000001e-75  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0065  ABC transporter related  58.65 
 
 		 310 aa  283  2.0000000000000002e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0871  ABC transporter related  58.58 
 
 		 241 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0818606  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0898  hypothetical protein  59 
 
 		 241 aa  282  4.0000000000000003e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0867  hypothetical protein  59 
 
 		 241 aa  282  4.0000000000000003e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0973  ABC transporter related  58.72 
 
 		 240 aa  282  4.0000000000000003e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.156124  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2272  ABC transporter related  55.83 
 
 		 244 aa  282  4.0000000000000003e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.638981  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0288  ATPase  57.56 
 
 		 244 aa  281  6.000000000000001e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.017076 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0085  ABC transporter related  57.38 
 
 		 268 aa  281  6.000000000000001e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.329192  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1616  ABC transporter related  58.23 
 
 		 255 aa  281  8.000000000000001e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0405  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  56.38 
 
 		 268 aa  281  8.000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0016  ABC transporter related  58.33 
 
 		 270 aa  281  9e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00016595 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3087  ABC transporter, ATP-binding protein  59.58 
 
 		 243 aa  281  9e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.187467  normal  0.113266 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2817  ABC transporter related  56.96 
 
 		 253 aa  280  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0507  ABC transporter-related protein  58.82 
 
 		 240 aa  281  1e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.302089  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1156  ABC transporter, ATPase subunit  56.96 
 
 		 253 aa  280  1e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3684  ABC transporter related  55.23 
 
 		 244 aa  280  1e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0336  ABC transporter related  59.26 
 
 		 250 aa  280  1e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.18468  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0347  ABC transporter related  59.26 
 
 		 255 aa  280  1e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0282  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  57.56 
 
 		 241 aa  279  2e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41598  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12800  LPS transport protein LptB  57.98 
 
 		 241 aa  280  2e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0478  ABC transporter, ATP-binding protein  55.6 
 
 		 263 aa  280  2e-74  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0275  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  57.56 
 
 		 241 aa  279  2e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.314804  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0416  ABC transporter related  58.3 
 
 		 317 aa  279  3e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>