More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1278 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_1278  KpsF/GutQ  100 
 
 
321 aa  630  1e-179  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000847451 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1893  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  83.18 
 
 
321 aa  534  1e-151  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.573226  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2977  KpsF/GutQ family protein  81.31 
 
 
321 aa  531  1e-150  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00368361  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2608  KpsF/GutQ family protein  77.02 
 
 
322 aa  502  1e-141  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1602  KpsF/GutQ family protein  76.71 
 
 
322 aa  500  1e-140  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0969  KpsF/GutQ family protein  74.14 
 
 
321 aa  481  1e-134  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0045257  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2171  KpsF/GutQ family protein  71.88 
 
 
322 aa  455  1e-127  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1943  arabinose-5-phosphate isomerase  68.97 
 
 
320 aa  457  1e-127  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0150417  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0902  hypothetical protein  55.45 
 
 
320 aa  358  5e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0871  hypothetical protein  55.45 
 
 
320 aa  358  5e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2710  KpsF/GutQ family protein  58.93 
 
 
329 aa  354  8.999999999999999e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2121  KpsF/GutQ family protein  56.05 
 
 
339 aa  348  5e-95  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0875  KpsF/GutQ family protein  55.49 
 
 
324 aa  345  8.999999999999999e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03660  hypothetical protein  54.92 
 
 
323 aa  342  5e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0756  KpsF/GutQ family protein  55.7 
 
 
323 aa  340  2e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4258  KpsF/GutQ family protein  53.92 
 
 
324 aa  339  4e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0365  KpsF/GutQ family protein  56.23 
 
 
325 aa  339  4e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.623237  normal  0.274757 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0403  KpsF/GutQ family protein  52.19 
 
 
315 aa  338  5.9999999999999996e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18910  KpsF/GutQ family protein  53.48 
 
 
331 aa  338  7e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.413862  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3174  arabinose-5-phosphate isomerase  52.98 
 
 
323 aa  337  1.9999999999999998e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1202  arabinose-5-phosphate isomerase  53.97 
 
 
324 aa  336  3.9999999999999995e-91  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002407  arabinose 5-phosphate isomerase  53.97 
 
 
323 aa  335  5.999999999999999e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.585942  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0763  arabinose-5-phosphate isomerase  54.14 
 
 
324 aa  335  5.999999999999999e-91  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12840  Arabinose 5-phosphate isomerase protein  53.46 
 
 
344 aa  335  9e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0862  KpsF/GutQ  52.66 
 
 
324 aa  334  1e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2221  KpsF/GutQ family protein  54.92 
 
 
326 aa  334  1e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57890  hypothetical protein  54.86 
 
 
326 aa  334  1e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0959  KpsF/GutQ family protein  54.26 
 
 
333 aa  334  1e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.444411 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0957  KpsF/GutQ family protein  53.29 
 
 
324 aa  333  2e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0746  sugar isomerase, KpsF/GutQ  55.87 
 
 
330 aa  333  2e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.269497  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2225  KpsF/GutQ family protein  56.41 
 
 
341 aa  333  2e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0996  KpsF/GutQ family protein  53.29 
 
 
324 aa  332  4e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4448  sugar isomerase, KpsF/GutQ  51.72 
 
 
324 aa  331  1e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4142  KpsF/GutQ  52.04 
 
 
324 aa  331  1e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0964  KpsF/GutQ family protein  52.98 
 
 
324 aa  331  1e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4362  D-arabinose 5-phosphate isomerase  52.68 
 
 
328 aa  331  1e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.315495  normal  0.179965 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03188  arabinose 5-phosphate isomerase  53.46 
 
 
326 aa  331  1e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.655458  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3372  KpsF/GutQ family protein  52.2 
 
 
325 aa  329  3e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.600625  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3810  D-arabinose 5-phosphate isomerase  52.23 
 
 
328 aa  329  5.0000000000000004e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5030  hypothetical protein  53.92 
 
 
324 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.698137  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0413  hypothetical protein  53.67 
 
 
333 aa  328  9e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0763573 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1058  KpsF/GutQ family protein  56.39 
 
 
338 aa  328  1.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  0.335757 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3611  KpsF/GutQ family protein  52.83 
 
 
325 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3339  KpsF/GutQ family protein  57.5 
 
 
326 aa  327  1.0000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2104  hypothetical protein  53.48 
 
 
326 aa  327  2.0000000000000001e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0510  D-arabinose 5-phosphate isomerase  52.37 
 
 
357 aa  327  2.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0446  D-arabinose 5-phosphate isomerase  52.37 
 
 
328 aa  327  2.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1148  D-arabinose 5-phosphate isomerase  52.37 
 
 
342 aa  327  2.0000000000000001e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4538  KpsF/GutQ family protein  52.68 
 
 
321 aa  326  3e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02232  arabinose 5-phosphate isomerase  52.68 
 
 
333 aa  326  4.0000000000000003e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4132  KpsF/GutQ family protein  55.77 
 
 
333 aa  325  5e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03062  D-arabinose 5-phosphate isomerase  52.05 
 
 
328 aa  325  6e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00212199  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0510  KpsF/GutQ family protein  52.05 
 
 
328 aa  325  6e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4519  D-arabinose 5-phosphate isomerase  52.05 
 
 
328 aa  325  6e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.498324  normal  0.41247 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3390  D-arabinose 5-phosphate isomerase  52.05 
 
 
328 aa  325  6e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.997652  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3493  D-arabinose 5-phosphate isomerase  52.05 
 
 
328 aa  325  6e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3573  D-arabinose 5-phosphate isomerase  52.05 
 
 
328 aa  325  6e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3685  D-arabinose 5-phosphate isomerase  52.05 
 
 
328 aa  325  6e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03013  hypothetical protein  52.05 
 
 
328 aa  325  6e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00296594  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0503  D-arabinose 5-phosphate isomerase  52.05 
 
 
328 aa  325  6e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.183909 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0494  KpsF/GutQ family protein  52.23 
 
 
325 aa  325  7e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0102894  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3652  D-arabinose 5-phosphate isomerase  51.91 
 
 
328 aa  325  8.000000000000001e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0675  KpsF/GutQ family protein  52.66 
 
 
345 aa  324  1e-87  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0761  arabinose-5-phosphate isomerase  52.66 
 
 
345 aa  324  1e-87  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0137  KpsF/GutQ family protein  55.52 
 
 
335 aa  324  1e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4108  KpsF/GutQ family protein  54.63 
 
 
330 aa  324  1e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.525065  normal  0.0965302 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0401  KpsF/GutQ family protein  48.59 
 
 
326 aa  324  1e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0295  KpsF/GutQ family protein  53.67 
 
 
327 aa  323  2e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3306  KpsF/GutQ family protein  51.57 
 
 
325 aa  323  2e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.57065 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1749  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  51.56 
 
 
319 aa  323  2e-87  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3633  D-arabinose 5-phosphate isomerase  51.59 
 
 
328 aa  323  3e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.143875 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0678  KpsF/GutQ family protein  51.27 
 
 
325 aa  323  3e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.732488  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0538  capsule expression protein KpsF/GutQ  55.87 
 
 
328 aa  322  4e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0731  Arabinose-5-phosphate isomerase  55.77 
 
 
325 aa  322  4e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0268  KpsF/GutQ family protein  53.67 
 
 
327 aa  322  6e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3490  KpsF/GutQ family protein  55.13 
 
 
333 aa  321  8e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0712  KpsF/GutQ family protein  50.64 
 
 
325 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0114298 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3663  KpsF/GutQ family protein  50.64 
 
 
325 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000627199  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0691  KpsF/GutQ family protein  50.64 
 
 
325 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.983087  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0721  KpsF/GutQ family protein  50.64 
 
 
325 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0677  KpsF/GutQ family protein  50.96 
 
 
325 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.953587  normal  0.0677039 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3505  D-arabinose 5-phosphate isomerase  52.37 
 
 
328 aa  320  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3612  D-arabinose 5-phosphate isomerase  52.37 
 
 
328 aa  320  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.164557 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4898  KpsF/GutQ family protein  54.31 
 
 
335 aa  320  1.9999999999999998e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.340772  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3507  D-arabinose 5-phosphate isomerase  52.37 
 
 
328 aa  320  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3674  D-arabinose 5-phosphate isomerase  52.37 
 
 
328 aa  320  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.835894  normal  0.0549633 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3576  D-arabinose 5-phosphate isomerase  52.37 
 
 
328 aa  320  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2788  sugar phosphate isomerase  52.98 
 
 
330 aa  319  3e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000495576  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3344  KpsF/GutQ family protein  50.64 
 
 
325 aa  319  3e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.275941 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0879  KpsF/GutQ family protein  55.59 
 
 
329 aa  319  3e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00879092  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3956  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  50 
 
 
325 aa  318  7e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0563  KpsF/GutQ family protein  52.52 
 
 
323 aa  318  7.999999999999999e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.57393  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0731  arabinose-5-phosphate isomerase  51.26 
 
 
325 aa  318  1e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0503  arabinose 5-phosphate isomerase  51.91 
 
 
324 aa  316  3e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.576158  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4237  KpsF/GutQ family protein  53.99 
 
 
333 aa  316  3e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0922  sugar isomerase  51.56 
 
 
330 aa  316  4e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4235  KpsF/GutQ family protein  51.26 
 
 
325 aa  316  4e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000366362 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0286  D-arabinose 5-phosphate isomerase  49.84 
 
 
345 aa  315  5e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0195424  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0182  KpsF/GutQ family protein  53.46 
 
 
330 aa  315  5e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3083  arabinose-5-phosphate isomerase  51.26 
 
 
325 aa  315  5e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.353966 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>