More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1248 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  100 
 
 		 359 aa  733    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  73.26 
 
 		 358 aa  555  1e-157  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  56.7 
 
 		 359 aa  422  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2588  permease YjgP/YjgQ family protein  51.39 
 
 		 359 aa  380  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3408  permease YjgP/YjgQ family protein  51.25 
 
 		 360 aa  366  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3470  permease YjgP/YjgQ family protein  50.97 
 
 		 360 aa  362  5.0000000000000005e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1639  permease YjgP/YjgQ family protein  48.74 
 
 		 359 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000266176  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1923  hypothetical protein  37.01 
 
 		 362 aa  260  3e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.24425e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1432  permease YjgP/YjgQ family protein  33.33 
 
 		 359 aa  219  5e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0188  permease YjgP/YjgQ family protein  30.14 
 
 		 360 aa  180  2.9999999999999997e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0302  hypothetical protein  30.03 
 
 		 359 aa  169  6e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  26.67 
 
 		 792 aa  159  7e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  28.73 
 
 		 365 aa  157  3e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2033  permease YjgP/YjgQ family protein  28.96 
 
 		 360 aa  149  9e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.971288 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1831  permease YjgP/YjgQ family protein  29.69 
 
 		 387 aa  147  3e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0389  hypothetical protein  27.43 
 
 		 360 aa  144  3e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.534497 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  27.1 
 
 		 356 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2369  permease YjgP/YjgQ family protein  26.21 
 
 		 359 aa  135  8e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.792203  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2678  permease YjgP/YjgQ family protein  27.3 
 
 		 371 aa  134  3e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197081  normal  0.64085 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1307  permease YjgP/YjgQ family protein  26.12 
 
 		 356 aa  132  6.999999999999999e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0220  permease YjgP/YjgQ  25.62 
 
 		 356 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.633981 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1512  permease YjgP/YjgQ family protein  25.46 
 
 		 374 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2785  permease YjgP/YjgQ family protein  24.1 
 
 		 358 aa  119  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.661197  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1545  permease YjgP/YjgQ family protein  25.21 
 
 		 364 aa  117  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2901  putative permease  24.93 
 
 		 364 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220999  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1695  permease YjgP/YjgQ family protein  25.56 
 
 		 361 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1120  permease YjgP/YjgQ family protein  24.39 
 
 		 364 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.187975 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0495  permease YjgP/YjgQ  27.15 
 
 		 366 aa  114  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0409  permease YjgP/YjgQ family protein  23.81 
 
 		 360 aa  113  5e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1510  permease YjgP/YjgQ family protein  25.13 
 
 		 396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000161428 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  23.68 
 
 		 434 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0135  permease YjgP/YjgQ family protein  23.95 
 
 		 395 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000106292 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2464  permease YjgP/YjgQ  25.71 
 
 		 360 aa  109  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0984614  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0138  permease YjgP/YjgQ family protein  23.68 
 
 		 395 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  26.54 
 
 		 1040 aa  108  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  22.71 
 
 		 392 aa  108  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1395  permease YjgP/YjgQ family protein  25.43 
 
 		 360 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144867  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1491  permease YjgP/YjgQ family protein  25.43 
 
 		 360 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.269853  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0044  permease YjgP/YjgQ family protein  24.19 
 
 		 362 aa  107  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.484166  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2177  permease YjgP/YjgQ  24.22 
 
 		 366 aa  106  5e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4390  permease YjgP/YjgQ family protein  24.21 
 
 		 391 aa  105  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0512  hypothetical protein  24.16 
 
 		 394 aa  104  3e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  27.42 
 
 		 382 aa  104  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0679  permease YjgP/YjgQ family protein  29.41 
 
 		 350 aa  103  3e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2682  hypothetical protein  23.38 
 
 		 356 aa  103  5e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  25.13 
 
 		 391 aa  102  9e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1949  permease, putative  23.45 
 
 		 359 aa  102  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000528059  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2554  hypothetical protein  23.1 
 
 		 356 aa  101  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3906  permease YjgP/YjgQ family protein  24.43 
 
 		 364 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  26.39 
 
 		 389 aa  101  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0528  putative permease  23.46 
 
 		 358 aa  100  4e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0041624  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03633  hypothetical protein  23.12 
 
 		 356 aa  100  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1429  permease YjgP/YjgQ family protein  25.54 
 
 		 367 aa  100  5e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.398459  normal  0.880258 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3080  permease YjgP/YjgQ  25.97 
 
 		 362 aa  100  5e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0169896 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1803  permease YjgP/YjgQ family protein  25.27 
 
 		 360 aa  100  5e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5837  permease YjgP/YjgQ family protein  24.72 
 
 		 362 aa  100  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2026  permease YjgP/YjgQ family protein  24.65 
 
 		 358 aa  100  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.507643  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5099  permease YjgP/YjgQ family protein  25.07 
 
 		 362 aa  99.4  9e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.624296  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0112  permease YjgP/YjgQ family protein  21.88 
 
 		 370 aa  99.4  9e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.378963  hitchhiker  0.000636313 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1141  putative permease  22.47 
 
 		 355 aa  99  1e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0797  hypothetical protein  23.28 
 
 		 352 aa  99  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0544635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0948  permease YjgP/YjgQ  22.6 
 
 		 368 aa  97.8  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.046524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3339  permease YjgP/YjgQ family protein  25.07 
 
 		 363 aa  97.8  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465141 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0651  permease YjgP/YjgQ family protein  22.95 
 
 		 362 aa  97.1  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4679  permease YjgP/YjgQ family protein  25.6 
 
 		 360 aa  97.1  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002430  hypothetical protein  23.2 
 
 		 356 aa  97.1  5e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00895033  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0876  hypothetical membrane spanning protein  22.47 
 
 		 355 aa  97.1  5e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0397  permease YjgP/YjgQ family protein  24.06 
 
 		 354 aa  96.7  5e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0180892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0518  permease  23.78 
 
 		 356 aa  96.7  6e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.29406  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1909  permease YjgP/YjgQ  25.51 
 
 		 354 aa  96.3  7e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3045  permease YjgP/YjgQ family protein  23.94 
 
 		 369 aa  96.3  7e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.453296 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0873  permease YjgP/YjgQ  24.29 
 
 		 351 aa  95.9  9e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000147876  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2221  permease YjgP/YjgQ family protein  23.26 
 
 		 397 aa  95.5  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.481086 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0582  hypothetical protein  26.63 
 
 		 356 aa  95.9  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.878195  normal  0.534189 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0941  permease YjgP/YjgQ family protein  23.3 
 
 		 352 aa  95.9  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00480022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1297  permease YjgP/YjgQ family protein  22.87 
 
 		 358 aa  95.5  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0266045  normal  0.200906 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1919  permease YjgP/YjgQ family protein  23.49 
 
 		 369 aa  95.5  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1016  permease YjgP/YjgQ family protein  24.44 
 
 		 352 aa  94.7  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00281225  normal  0.223874 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1078  permease YjgP/YjgQ family protein  24.23 
 
 		 352 aa  95.1  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000141824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1678  permease YjgP/YjgQ  22.99 
 
 		 365 aa  94.4  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.626554 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2681  permease YjgP/YjgQ family protein  22.48 
 
 		 397 aa  93.6  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.485939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2341  permease YjgP/YjgQ  23.27 
 
 		 365 aa  94  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.231587  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0912  permease YjgP/YjgQ family protein  23.81 
 
 		 352 aa  94  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00097364  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0501  hypothetical protein  21.39 
 
 		 360 aa  93.6  5e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.183407 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1723  permease YjgP/YjgQ family protein  23.49 
 
 		 369 aa  93.6  5e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1543  permease YjgP/YjgQ family protein  23.16 
 
 		 1096 aa  93.2  6e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00918394  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0764  permease YjgP/YjgQ family protein  26.7 
 
 		 360 aa  93.2  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.27721 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  22.58 
 
 		 391 aa  92.8  7e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1403  permease YjgP/YjgQ family protein  23.45 
 
 		 360 aa  92.4  9e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2733  permease YjgP/YjgQ family protein  24.73 
 
 		 360 aa  92.4  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.193527  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01574  predicted permease  22.83 
 
 		 353 aa  92.4  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334902  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1482  putative permease  23.72 
 
 		 400 aa  92.4  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0253141  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3830  putative permease  22.88 
 
 		 365 aa  92  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.105268 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2627  permease YjgP/YjgQ family protein  24.28 
 
 		 376 aa  91.3  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2809  permease YjgP/YjgQ  22.87 
 
 		 387 aa  91.7  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.652763  normal  0.723942 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  25 
 
 		 391 aa  90.9  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3066  permease YjgP/YjgQ family protein  22.93 
 
 		 355 aa  90.9  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.326563 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2417  hypothetical protein  23.12 
 
 		 401 aa  90.1  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3560  permease YjgP/YjgQ  23.05 
 
 		 353 aa  90.1  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0179004  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0901  permease YjgP/YjgQ family protein  24.79 
 
 		 373 aa  90.1  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.104569 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>