More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1246 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1246  radical SAM family protein  100 
 
 		 432 aa  890    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0936067  normal  0.0177716 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2425  radical SAM domain-containing protein  50.59 
 
 		 434 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.200383  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2734  radical SAM family protein  47.41 
 
 		 446 aa  382  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0884  radical SAM domain-containing protein  46.23 
 
 		 510 aa  380  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.699879  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1961  radical SAM domain-containing protein  44.08 
 
 		 440 aa  372  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1353  radical SAM domain-containing protein  43.33 
 
 		 429 aa  372  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.973606  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1962  radical SAM domain-containing protein  44.04 
 
 		 436 aa  374  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1446  radical SAM domain-containing protein  43.9 
 
 		 443 aa  366  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0575  Radical SAM domain protein  43.43 
 
 		 434 aa  362  9e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2391  Radical SAM domain protein  44.72 
 
 		 446 aa  358  8e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1828  Radical SAM domain protein  44.72 
 
 		 445 aa  352  7e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00146977 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1357  radical SAM domain-containing protein  40.85 
 
 		 298 aa  215  9.999999999999999e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.241565  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2899  Radical SAM domain protein  44.21 
 
 		 281 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2395  Radical SAM domain protein  30.17 
 
 		 394 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0515  radical SAM domain-containing protein  31.96 
 
 		 400 aa  155  2e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000107878  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1502  radical SAM domain-containing protein  29.38 
 
 		 442 aa  138  2e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0399675  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1457  radical SAM domain-containing protein  29.38 
 
 		 442 aa  138  2e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0668  radical SAM domain-containing protein  25.65 
 
 		 449 aa  137  3.0000000000000003e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.204384  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1456  radical SAM domain-containing protein  28.89 
 
 		 454 aa  137  4e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1501  radical SAM domain-containing protein  28.89 
 
 		 454 aa  137  4e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.567857  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1624  Radical SAM domain protein  29.14 
 
 		 486 aa  132  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.197988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2438  Radical SAM domain protein  25.67 
 
 		 447 aa  132  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4275  Radical SAM domain protein  30 
 
 		 474 aa  126  7e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0262219  normal  0.0188195 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1396  Radical SAM domain protein  29 
 
 		 447 aa  123  6e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.581014  hitchhiker  0.000129983 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5654  Radical SAM domain-containing protein  26.96 
 
 		 449 aa  119  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150626  normal  0.213395 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1058  radical SAM domain-containing protein  24.13 
 
 		 455 aa  118  1.9999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6677  radical SAM family protein  32.04 
 
 		 470 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  26.55 
 
 		 447 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0897  Radical SAM domain protein  27.27 
 
 		 454 aa  112  9e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0669  radical SAM domain-containing protein  24.74 
 
 		 450 aa  112  1.0000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0393374  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1561  radical SAM domain-containing protein  24.31 
 
 		 455 aa  112  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0870  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  27.33 
 
 		 483 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2423  radical SAM family protein  27.81 
 
 		 473 aa  109  9.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000017109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0871  radical SAM domain-containing protein  26.65 
 
 		 489 aa  108  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4676  Radical SAM domain-containing protein  26.55 
 
 		 434 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.100099  normal  0.0397095 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  31.99 
 
 		 458 aa  104  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0042  radical SAM family protein  25.68 
 
 		 452 aa  103  8e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0142  Radical SAM domain protein  26.01 
 
 		 477 aa  103  9e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4919  Radical SAM domain protein  26.04 
 
 		 476 aa  102  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000220499  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1460  radical SAM domain-containing protein  25.82 
 
 		 461 aa  102  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000686349  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1909  radical SAM domain-containing protein  25.95 
 
 		 450 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00558063  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  28.76 
 
 		 489 aa  102  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  28.53 
 
 		 450 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2198  radical SAM domain-containing protein  25.95 
 
 		 457 aa  101  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0076  Radical SAM domain protein  26.45 
 
 		 444 aa  100  7e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.419521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2476  radical SAM domain-containing protein  28.43 
 
 		 476 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.187942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1445  Radical SAM domain protein  28.53 
 
 		 468 aa  97.8  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2308  radical SAM domain-containing protein  28.43 
 
 		 476 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1605  radical SAM domain-containing protein  24.21 
 
 		 415 aa  97.1  5e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1704  radical SAM domain-containing protein  26.56 
 
 		 485 aa  97.1  6e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.347799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1480  radical SAM domain-containing protein  24.15 
 
 		 442 aa  96.7  8e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.227708  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  26.96 
 
 		 477 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0906  radical SAM family protein  23.56 
 
 		 450 aa  95.1  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000066146  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3461  radical SAM domain protein  28.02 
 
 		 476 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.361209 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2944  radical SAM domain-containing protein  28.28 
 
 		 476 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.388692  normal  0.122709 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2284  Radical SAM domain protein  24.83 
 
 		 444 aa  94  4e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00108467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  23.04 
 
 		 460 aa  93.2  7e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0679  Radical SAM domain protein  31.58 
 
 		 462 aa  93.2  8e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0478  radical SAM family protein  24.93 
 
 		 448 aa  93.2  8e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6334  Radical SAM domain protein  28.29 
 
 		 419 aa  92.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0725918  hitchhiker  0.00194618 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0069  Radical SAM domain protein  24.37 
 
 		 452 aa  92.4  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2677  radical SAM domain-containing protein  31.72 
 
 		 464 aa  90.9  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.773927  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1754  Radical SAM domain protein  25.2 
 
 		 447 aa  90.5  5e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305986  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1741  Radical SAM domain protein  24.76 
 
 		 728 aa  90.5  5e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0185422  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0945  Radical SAM domain protein  27.73 
 
 		 453 aa  89.7  8e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00793831  normal  0.0982171 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4137  Radical SAM domain protein  29.1 
 
 		 430 aa  89.4  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2206  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 456 aa  88.6  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000327652  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2359  radical SAM domain-containing protein  26.57 
 
 		 450 aa  89  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.288415  hitchhiker  0.00183234 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4492  Radical SAM domain protein  26.22 
 
 		 460 aa  87.4  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0565392 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4047  Radical SAM domain protein  28.29 
 
 		 403 aa  86.3  9e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3029  radical SAM family protein  27.62 
 
 		 484 aa  85.9  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0038885  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0328  Radical SAM domain protein  32.68 
 
 		 468 aa  86.3  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0433  radical SAM domain-containing protein  25.82 
 
 		 365 aa  85.9  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.293902  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0762  Radical SAM domain protein  26.56 
 
 		 476 aa  85.9  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.502838  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 463 aa  85.1  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0029  Radical SAM domain protein  27.25 
 
 		 452 aa  84.7  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1369  radical SAM domain-containing protein  23.72 
 
 		 454 aa  83.2  0.000000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2384  Radical SAM domain protein  23.55 
 
 		 339 aa  81.6  0.00000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.597572  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2370  Radical SAM domain protein  23.89 
 
 		 462 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1520  radical SAM domain-containing protein  26.36 
 
 		 351 aa  80.5  0.00000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1687  radical SAM domain-containing protein  26.41 
 
 		 385 aa  80.1  0.00000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3222  radical SAM domain-containing protein  21.51 
 
 		 459 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.026994  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0687  radical SAM domain-containing protein  31.29 
 
 		 481 aa  78.2  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01455  hypothetical protein  25.6 
 
 		 385 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2149  Radical SAM domain protein  25.6 
 
 		 385 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.967723  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01468  hypothetical protein  25.6 
 
 		 385 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1582  radical SAM domain-containing protein  25.6 
 
 		 385 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.28073  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1676  radical SAM domain-containing protein  25.3 
 
 		 385 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2160  radical SAM domain-containing protein  25.6 
 
 		 385 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07060  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  27.03 
 
 		 389 aa  78.2  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0678  radical SAM domain-containing protein  34.69 
 
 		 464 aa  77.4  0.0000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.628302  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0685  radical SAM domain-containing protein  23.9 
 
 		 499 aa  77.8  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00827758 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2110  radical SAM domain protein  25.52 
 
 		 385 aa  77.8  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.73629  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0409  radical SAM domain-containing protein  23.12 
 
 		 439 aa  77  0.0000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1837  Radical SAM domain protein  28.12 
 
 		 518 aa  77  0.0000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.654863  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3241  radical SAM family protein  32.03 
 
 		 329 aa  76.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.036472  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0623  Radical SAM domain protein  24.62 
 
 		 453 aa  75.1  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000646743  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  28.97 
 
 		 496 aa  75.1  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0105  radical SAM domain-containing protein  25.56 
 
 		 290 aa  75.9  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.287918  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3060  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 339 aa  74.3  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.738512  normal  0.173999 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>